公开(公告)号：CN118212987B

公开(公告)日：2024-08-20

申请号：CN202410628294.6

申请日：2024-05-21

Applicant: 中国医学科学院北京协和医院

Inventor： 张栋 ,  杜斌 ,  徐英春 ,  彭劲民 ,  杨启文 ,  刘瑞婷 ,  赵颖 ,  奕巧莲 ,  张戈 ,  李瑞琳 ,  拔素苹

IPC: G16B30/00 ,  G16B50/10 ,  G16B30/20

Abstract: 本发明提供了一种基因数据处理方法、装置、存储介质及电子设备，涉及基因技术领域，该方法包括：获取待测样本的测序数据；对测序数据进行预处理，获得目标测序数据；将目标测序数据与物种数据库进行比对，获得目标物种序列数据集，对目标物种序列数据集进行序列组装，获得组装结果；对组装结果进行基因预测，获得基因预测结果；对各个基因预测结果进行去冗余处理，得到各个非冗余基因序列；将每个非冗余基因序列与耐药基因数据库进行比对，获得每个非冗余基因序列对应的注释结果；基于每个非冗余基因序列对应的注释结果在各个非冗余基因序列中确定出耐药基因序列。应用本发明实施例提供的方法，能够准确地确定出耐药基因序列。

公开(公告)号：CN118212987A

公开(公告)日：2024-06-18

申请号：CN202410628294.6

申请日：2024-05-21

Applicant: 中国医学科学院北京协和医院

Inventor： 张栋 ,  杜斌 ,  徐英春 ,  彭劲民 ,  杨启文 ,  刘瑞婷 ,  赵颖 ,  奕巧莲 ,  张戈 ,  李瑞琳 ,  拔素苹

IPC: G16B30/00 ,  G16B50/10 ,  G16B30/20

Abstract: 本发明提供了一种基因数据处理方法、装置、存储介质及电子设备，涉及基因技术领域，该方法包括：获取待测样本的测序数据；对测序数据进行预处理，获得目标测序数据；将目标测序数据与物种数据库进行比对，获得目标物种序列数据集，对目标物种序列数据集进行序列组装，获得组装结果；对组装结果进行基因预测，获得基因预测结果；对各个基因预测结果进行去冗余处理，得到各个非冗余基因序列；将每个非冗余基因序列与耐药基因数据库进行比对，获得每个非冗余基因序列对应的注释结果；基于每个非冗余基因序列对应的注释结果在各个非冗余基因序列中确定出耐药基因序列。应用本发明实施例提供的方法，能够准确地确定出耐药基因序列。