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公开(公告)号：CN119286822A
公开(公告)日：2025-01-10
申请号：CN202410101075.2
申请日：2024-01-24
Applicant: 苏州系统医学研究所
Abstract: 本发明提供了一种化学诱导的多功能基因编辑系统及其应用，涉及基因编辑技术领域。该碱基编辑系统是利用现有的PROCISiR系统中可正交的化学药物诱导蛋白二聚化响应元件(受体蛋白和读取器蛋白表达元件)，将其分别与核酸酶或脱氨酶融合，获得的具有化学药物可控的多功能碱基编辑系统。该碱基编辑系统既具有单一化学药物诱导的单一碱基底物编辑的特性，也具有两种化学药物诱导的两种碱基底物编辑的能力，并且在保持较高编辑活性的同时有效地降低了存在的脱靶编辑。
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公开(公告)号：CN116731207A
公开(公告)日：2023-09-12
申请号：CN202310609752.7
申请日：2023-05-26
Applicant: 苏州系统医学研究所
IPC: C07K19/00 , C12N9/22 , C12N15/113
Abstract: 本发明提供了一种降低基因编辑脱靶效率的融合蛋白及其应用，涉及生物技术领域。具体的，该融合蛋白包括蛋白表达元件、核苷脱氨酶和核酸酶，其中蛋白表达元件为小分子药物响应的蛋白表达元件FRB/FKBP。本发明首次根据ABE8e蛋白晶体结构理性设计拆分位点，通过筛选拆分位点，发现在TadA‑8e的37‑38位点插入小分子药物响应的蛋白表达元件FRB/FKBP，可有效降低ABE8e的Cas9依赖的DNA脱靶、非Cas9依赖的DNA脱靶和RNA脱靶，对单碱基基因编辑技术进行了突破性的改进并能够广泛应用于基因编辑、基因治疗、细胞治疗、动物模型制作、作物遗传育种等多种方面。
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公开(公告)号：CN119286830A
公开(公告)日：2025-01-10
申请号：CN202311786372.7
申请日：2023-12-22
Applicant: 苏州系统医学研究所
Abstract: 本发明提供了一种具有序列偏好性的融合蛋白及基因编辑系统，涉及基因编辑技术领域。本发明中首次公开了TadA‑8e与底物DNA结合的关键的第48位氨基酸影响ABE8e整体的编辑效率、编辑准确性以及序列偏好性；通过理性设计，针对ABE8e中的TadA‑8e部分进行改造，在TadA‑8e与底物DNA结合的关键的第48位氨基酸设计饱和突变，开发了一种具有序列偏好的(YAY)高精度ABE。它能够将编辑窗口内序列YAY(Y＝T或C)中A准确编辑为G，对于其他的A不编辑或者仅产生较低的编辑，避免了“邻近碱基”突变问题，减少了错误突变带来的安全隐患。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN117568321A
公开(公告)日：2024-02-20
申请号：CN202311487517.3
申请日：2023-11-09
Applicant: 苏州系统医学研究所
Abstract: 本发明提供了一种腺嘌呤脱氨酶突变体及其应用，涉及基因工程技术领域。该腺嘌呤脱氨酶突变体由腺嘌呤脱氨酶删除部分氨基酸序列获得，所述部分氨基酸序列包括自序列N端开始向C端方向顺序计数第70‑74位氨基酸序列、第147‑152位氨基酸序列、第1‑11位氨基酸序列、第25‑30位氨基酸序列、第46‑57位氨基酸序列、第84‑88位氨基酸序列和/或第135‑138位氨基酸序列。本发明中通过删除腺嘌呤脱氨酶TadA‑8e的第70‑74位氨基酸序列或第147‑152位氨基酸序列，在保证编辑效率的前提下，获得体积小且精度高的腺嘌呤碱基编辑器。
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公开(公告)号：CN119390853A
公开(公告)日：2025-02-07
申请号：CN202411520183.X
申请日：2024-10-29
Applicant: 苏州系统医学研究所
Abstract: 本发明公开了一种同时编辑四种碱基的融合蛋白及其应用，涉及基因编辑技术领域。本发明的融合蛋白结合gGBE、DAF‑TBE和TadDE，将这三者的脱氨酶和糖苷酶融合在nCas9中，开发能够同时编辑四种碱基(A、T、C、G)的融合蛋白。该融合蛋白能够实现A到G、A到C、A到T、T到G、T到C、T到A、C到T、C到G、C到A、G到A、G到C和G到T的碱基转换和颠换，在蛋白定向进化、细胞示踪和复杂疾病模型的构建等方面具有广阔的应用前景。
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公开(公告)号：CN116694605A
公开(公告)日：2023-09-05
申请号：CN202310875903.3
申请日：2023-07-17
Applicant: 苏州系统医学研究所
Abstract: 本发明提供了一种烷基腺嘌呤DNA糖基化酶突变体、融合蛋白和应用，涉及生物技术领域。本发明申请人根据碱基编辑技术的工作原理，通过对融合蛋白AYBE的理性设计，截去了AYBE中对烷基腺嘌呤DNA糖基化酶(MPG)核心功能没有影响的区域第2‑79位氨基酸序列、第287‑298位氨基酸序列以及2‑79aa与287‑298aa双截短氨基酸序列，开发出了体积更小的A到Y(Y＝T或C)碱基编辑器，克服了目前AYBE因体积较大难以通过腺相关病毒(AAV)包装进行体内递送的问题，使该碱基编辑器更有可能通过AAV递送进行在体递送用于基因治疗，具有更佳广阔的应用前景。
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公开(公告)号：CN119286803A
公开(公告)日：2025-01-10
申请号：CN202311666216.7
申请日：2023-12-06
Applicant: 苏州系统医学研究所
Abstract: 本发明提供了一种具有三碱基编辑功能的融合蛋白及其应用，涉及碱基编辑技术领域。该融合蛋白包括：腺嘌呤脱氨酶、N‑甲基嘌呤DNA糖基化酶、核酸酶。针对现有的碱基编辑工具不能同时以三种碱基作为底物进行编辑的问题，本发明提供了一种新型的三功能碱基编辑器，命名为A,C&G‑BE。A,C&G‑BE可以单独以A、C、G作为底物进行编辑，实现A‑G/T/C、C‑T/G/A、G‑T/A/C的编辑活性，还可以在等位基因上同时以A、C、G作为底物进行编辑。
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公开(公告)号：CN119264275A
公开(公告)日：2025-01-07
申请号：CN202411568463.8
申请日：2024-11-05
Applicant: 苏州系统医学研究所
IPC: C07K19/00 , C12N9/78 , C12N9/22 , C12N15/62 , C12N15/113
Abstract: 本发明提供了一种提高碱基编辑活性、降低脱靶水平的融合蛋白，涉及生物技术领域。本发明首次将基于tDeg融合蛋白的降解体系引入碱基编辑系统中获得了一种提高碱基编辑效率同时降低脱靶水平的新的碱基编辑系统，具体为将降解决定子序列和RNA结合多肽与碱基编辑器的碱基编辑元件融合获得融合蛋白，同时将Pepper RNA引入sgRNA的loop区域，即得本申请碱基编辑系统。本发明所构建的高效率和低脱靶率的碱基编辑系统将进一步推动碱基编辑工具的广泛应用，尤其是在基因治疗和临床疾病治疗上。
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