公开(公告)号：CN119264275A

公开(公告)日：2025-01-07

申请号：CN202411568463.8

申请日：2024-11-05

Applicant: 苏州系统医学研究所

Inventor： 张晓辉 ,  李依诺 ,  林义朗

IPC: C07K19/00 ,  C12N9/78 ,  C12N9/22 ,  C12N15/62 ,  C12N15/113

Abstract: 本发明提供了一种提高碱基编辑活性、降低脱靶水平的融合蛋白，涉及生物技术领域。本发明首次将基于tDeg融合蛋白的降解体系引入碱基编辑系统中获得了一种提高碱基编辑效率同时降低脱靶水平的新的碱基编辑系统，具体为将降解决定子序列和RNA结合多肽与碱基编辑器的碱基编辑元件融合获得融合蛋白，同时将Pepper RNA引入sgRNA的loop区域，即得本申请碱基编辑系统。本发明所构建的高效率和低脱靶率的碱基编辑系统将进一步推动碱基编辑工具的广泛应用，尤其是在基因治疗和临床疾病治疗上。

公开(公告)号：CN119286830A

公开(公告)日：2025-01-10

申请号：CN202311786372.7

申请日：2023-12-22

Applicant: 苏州系统医学研究所

Inventor： 张晓辉 ,  李皓婕 ,  任婧萱 ,  李依诺 ,  何远清

IPC: C12N9/78 ,  C07K19/00 ,  C12N15/10

Abstract: 本发明提供了一种具有序列偏好性的融合蛋白及基因编辑系统，涉及基因编辑技术领域。本发明中首次公开了TadA‑8e与底物DNA结合的关键的第48位氨基酸影响ABE8e整体的编辑效率、编辑准确性以及序列偏好性；通过理性设计，针对ABE8e中的TadA‑8e部分进行改造，在TadA‑8e与底物DNA结合的关键的第48位氨基酸设计饱和突变，开发了一种具有序列偏好的(YAY)高精度ABE。它能够将编辑窗口内序列YAY(Y＝T或C)中A准确编辑为G，对于其他的A不编辑或者仅产生较低的编辑，避免了“邻近碱基”突变问题，减少了错误突变带来的安全隐患。

公开(公告)号：CN117568321A

公开(公告)日：2024-02-20

申请号：CN202311487517.3

申请日：2023-11-09

Applicant: 苏州系统医学研究所

Inventor： 张晓辉 ,  任婧萱 ,  李依诺 ,  周卓 ,  王健伟

IPC: C12N9/78 ,  C12N15/55 ,  C07K19/00 ,  C12N9/22 ,  C12N15/62 ,  C12N15/113 ,  C12N15/85 ,  C12N5/10

Abstract: 本发明提供了一种腺嘌呤脱氨酶突变体及其应用，涉及基因工程技术领域。该腺嘌呤脱氨酶突变体由腺嘌呤脱氨酶删除部分氨基酸序列获得，所述部分氨基酸序列包括自序列N端开始向C端方向顺序计数第70‑74位氨基酸序列、第147‑152位氨基酸序列、第1‑11位氨基酸序列、第25‑30位氨基酸序列、第46‑57位氨基酸序列、第84‑88位氨基酸序列和/或第135‑138位氨基酸序列。本发明中通过删除腺嘌呤脱氨酶TadA‑8e的第70‑74位氨基酸序列或第147‑152位氨基酸序列，在保证编辑效率的前提下，获得体积小且精度高的腺嘌呤碱基编辑器。