公开(公告)号：CN116731207A

公开(公告)日：2023-09-12

申请号：CN202310609752.7

申请日：2023-05-26

Applicant: 苏州系统医学研究所

Inventor： 张晓辉 ,  王锦鑫 ,  周卓 ,  何远清

IPC: C07K19/00 ,  C12N9/22 ,  C12N15/113

Abstract: 本发明提供了一种降低基因编辑脱靶效率的融合蛋白及其应用，涉及生物技术领域。具体的，该融合蛋白包括蛋白表达元件、核苷脱氨酶和核酸酶，其中蛋白表达元件为小分子药物响应的蛋白表达元件FRB/FKBP。本发明首次根据ABE8e蛋白晶体结构理性设计拆分位点，通过筛选拆分位点，发现在TadA‑8e的37‑38位点插入小分子药物响应的蛋白表达元件FRB/FKBP，可有效降低ABE8e的Cas9依赖的DNA脱靶、非Cas9依赖的DNA脱靶和RNA脱靶，对单碱基基因编辑技术进行了突破性的改进并能够广泛应用于基因编辑、基因治疗、细胞治疗、动物模型制作、作物遗传育种等多种方面。

公开(公告)号：CN119286830A

公开(公告)日：2025-01-10

申请号：CN202311786372.7

申请日：2023-12-22

Applicant: 苏州系统医学研究所

Inventor： 张晓辉 ,  李皓婕 ,  任婧萱 ,  李依诺 ,  何远清

IPC: C12N9/78 ,  C07K19/00 ,  C12N15/10

Abstract: 本发明提供了一种具有序列偏好性的融合蛋白及基因编辑系统，涉及基因编辑技术领域。本发明中首次公开了TadA‑8e与底物DNA结合的关键的第48位氨基酸影响ABE8e整体的编辑效率、编辑准确性以及序列偏好性；通过理性设计，针对ABE8e中的TadA‑8e部分进行改造，在TadA‑8e与底物DNA结合的关键的第48位氨基酸设计饱和突变，开发了一种具有序列偏好的(YAY)高精度ABE。它能够将编辑窗口内序列YAY(Y＝T或C)中A准确编辑为G，对于其他的A不编辑或者仅产生较低的编辑，避免了“邻近碱基”突变问题，减少了错误突变带来的安全隐患。