一种基于核酸信号二次放大的无PAM点限制的CRISPR-Cas12f核酸检测平台

    公开(公告)号:CN118813764A

    公开(公告)日:2024-10-22

    申请号:CN202410198129.1

    申请日:2024-02-22

    Applicant: 海南大学

    Abstract: 本发明涉及建立一种核酸检测的方法,将传统环介导等温扩增(LAMP)进行引物改造,完成一次信号放大,之后通过链置换反应产生单链DNA靶标完成二次信号放大,实现无前间隔序列邻近基序(protospacer adjacent motif)位点即无PAM位点限制的广适性CRISPR‑Cas12f核酸检测。本发明的意义在于利用环介导等温扩增技术的高灵敏性、操作便捷快速以及引物可按需改造的特点,结合链置换反应高效率,使得靶标信号二次级联放大,通过Cas12f酶识别单链核酸无PAM位点限制特点以及高特异性,提高了本方法的广适性、特异性、灵敏性,建议的恒温反应流程满足了及时快速的诊断需求,在核酸诊断领域具有重要的应用潜力与经济价值。

    一种基于aPCR-Cas12快速鉴别金黄色葡萄球菌和耐甲氧西林金黄色葡萄球菌的方法

    公开(公告)号:CN119662791A

    公开(公告)日:2025-03-21

    申请号:CN202510012940.0

    申请日:2025-01-06

    Applicant: 海南大学

    Abstract: 本发明公开了一种基于aPCR‑Cas12快速鉴别金黄色葡萄球菌和耐甲氧西林金黄色葡萄球菌的方法,属于基因检测技术领域。本发明以nuc为目标基因,利用aPCR扩增出单链ssDNA,根据序列合成互补链PC‑ssDNA,并修饰PClinker基团。二者杂交后紫外处理,切断修饰位点形成立足点双链,联合CRISPR‑Cas12系统提高SNP检测能力,通过读取荧光信号,显著性分析P值实现金黄色葡萄球菌和耐甲氧西林金黄色葡萄球菌的区分检测。该体系无需PAM位点,能够检测到低至9CUF/mL的目标基因,对混合基因中SNP突变率检测的灵敏度达到0.01%。本发明提供的方法对病原菌监控与防治方面都有重要意义。

    一种基于CRISPR-Cas12系统光激活检测SNP(以miRNA为例)的方法

    公开(公告)号:CN118421765A

    公开(公告)日:2024-08-02

    申请号:CN202410632776.9

    申请日:2024-05-21

    Applicant: 海南大学

    Abstract: 本发明公开了一种基于CRISPR‑Cas12系统光激活检测SNP的方法。该方法中,根据待检测(miRNA作为RNA)靶核酸单链信息,设计、合成其PClinker基团修饰的互补ssDNA链,二者杂交后紫外光照射形成立足点,联合CRISPR‑Cas12系统将检测信号转变成荧光信号来实现核酸检测,并且区分单碱基突变。本发明所述方法材料设计简单、成本低、操作方便,并且可以在40min内直接通过荧光信号检测SNP,区分野生型与突变型,对于癌症的个性化生物标记物诊断和基因治疗方面都有重要意义。

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