一种基于CRISPR-Cas12系统光激活检测SNP(以miRNA为例)的方法

    公开(公告)号:CN118421765A

    公开(公告)日:2024-08-02

    申请号:CN202410632776.9

    申请日:2024-05-21

    Applicant: 海南大学

    Abstract: 本发明公开了一种基于CRISPR‑Cas12系统光激活检测SNP的方法。该方法中,根据待检测(miRNA作为RNA)靶核酸单链信息,设计、合成其PClinker基团修饰的互补ssDNA链,二者杂交后紫外光照射形成立足点,联合CRISPR‑Cas12系统将检测信号转变成荧光信号来实现核酸检测,并且区分单碱基突变。本发明所述方法材料设计简单、成本低、操作方便,并且可以在40min内直接通过荧光信号检测SNP,区分野生型与突变型,对于癌症的个性化生物标记物诊断和基因治疗方面都有重要意义。

    一种基于RT-LAMP-Cas14a无PAM限制的水产神经坏死病毒检测方法

    公开(公告)号:CN119082370A

    公开(公告)日:2024-12-06

    申请号:CN202411380517.8

    申请日:2024-09-30

    Applicant: 海南大学

    Abstract: 本发明提供了一种基于RT‑LAMP‑Cas14a无PAM限制的石斑鱼神经坏死病毒检测方法,所述方法是一种基于一组特异性的神经坏死病毒RNA RT‑LAMP扩增引物,在FIP引物的3’端引入PAM序列,经过60℃恒温扩增后其产物被CRISPR‑Cas14a特异性识别,随后激活Cas14a酶并触发其非特异性反式切割能力的一种方法。具体涉及水产病毒快速诊断领域。由于神经坏死病毒RNA核酸序列不含Cas14a识别的PAM序列,本发明对RT‑LAMP扩增引物进行改造,实现RNA核酸一步法扩增与CRISPR‑Cas14a相结合,使其突破了Cas14a检测技术的限制,为神经坏死病毒提供一种高特异性、高灵敏度的检测技术。

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