基于蛋白质序列的药物靶点相互作用预测方法

    公开(公告)号:CN119649896A

    公开(公告)日:2025-03-18

    申请号:CN202411664188.X

    申请日:2024-11-20

    Applicant: 浙江大学

    Abstract: 本发明公开了一种基于蛋白质序列的药物靶点相互作用预测方法,包括:构建药物靶点数据库;构建基于预训练蛋白质语言模型的靶点特征提取器;构建基于预训练分子模型的药物特征提取器;采用自注意力机制构建特征学习方法,采用交叉注意力机制构建药物靶点相互作用学习方法,结合线性层构建预测器,搭建预测药物靶点相互作用模型;训练并优化药物靶点相互作用预测模型的参数,得到优化后的药物靶点预测模型;药物靶点输入到优化后的预测模型中,输出预测结果,最后通过注意力分数可视化,标注出药物与靶点潜在的活性位点和重要氨基酸残基。本发明实现了基于蛋白质序列预测药物与靶点相互作用精度的提升,并实现了深度学习模型的可解释性。

Patent Agency Ranking