一种南方水稻黑条矮缩病的抗病位点qSRV6.1、分子标记及其应用

    公开(公告)号:CN112410455B

    公开(公告)日:2021-09-10

    申请号:CN202011408366.4

    申请日:2020-12-04

    Abstract: 本发明公开了一种水稻黑条矮缩病抗病位点qSRV6.1及其应用。qSRV6.1位于水稻日本晴参考基因组(IRGSP‑1.0)0.91‑1.18Mb的物理位置上。测序分析发现,抗病品种W44相对于感病品种日本晴,在日本晴基因组926852bp后插入了插入了25个核苷酸,在日本晴基因组1171606bp后插入了插入了12个核苷酸,在日本晴基因组1171647bp后插入插入了9个核苷酸。与抗病位点qSRV6.1紧密连锁的分子标记qSRV6.1‑1和qSRV6.1‑2可以有效的用于区分抗病品种和感病品种,且可以用于杂交育种过程中的分子标记辅助选择。本发明利用试验证明抗病位点qSRV6.1能够显著提高水稻的SRBSDV抗性,在水稻抗病应用中具有重要的价值。

    一种泛基因组的构建方法及其相应的结构变异挖掘方法

    公开(公告)号:CN113571131A

    公开(公告)日:2021-10-29

    申请号:CN202110903763.7

    申请日:2021-08-06

    Abstract: 本发明属于基因组数据分析技术领域,具体涉及一种泛基因组的构建方法及其相应的结构变异挖掘方法,通过把基因组比较得到的结构变异放回线性基因组上,同时增加结构变异位点信息文件,构建一种形式上线性化,兼顾多种结构变异形式的高效分析的泛基因组;所述泛基因组不但可以捕获更多全新的,参考基因组未发现的结构变异,而且通过线性化方法结合变异位点信息文件,更好的展示了捕获到的结构变异,使构建的泛基因组更容易理解和分析,更有利于后续应用;本发明构建的泛基因组和二代测序数据进行基因组结构变异分析的方法和流程,并编写了完整的程序代码,实现了基于相对低成本的二代测序数据对结构变异的高效、精准挖掘。

    一种水稻金属转运基因OsNRAMP2及其应用

    公开(公告)号:CN112746077A

    公开(公告)日:2021-05-04

    申请号:CN202011409794.9

    申请日:2020-12-04

    Abstract: 本发明公开了一种水稻金属转运基因OsNRAMP2及其应用。本发明首次证明了水稻OsNRAMP2基因是水稻镉转运和积累的功能基因,所述水稻OsNRAMP2基因碱基序列如SEQ ID NO.1所示。本发明通过试验证明水稻OsNRAMP2基因敲除可以显著降低水稻地上部分镉转移率,显著降低谷粒中的镉含量。这对于研究水稻镉积累遗传机制、多途径组合降低水稻谷粒镉含量等方面具有重要的价值。OsNRAMP2基因增量表达可以显著提高谷粒中的铁、锰、锌、铜含量。目前,金属转运基因的增量表达是否能够提高营养金属元素的含量很少有报道。因此,本发明为提高水稻谷粒营养金属元素提供了可以选择的候选基因,在提高作物营养金属元素方面具有较好的应用前景。

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