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公开(公告)号：CN118290551A
公开(公告)日：2024-07-05
申请号：CN202410222980.3
申请日：2024-02-28
Applicant: 广东省农业科学院水稻研究所
IPC: C07K14/415 , C12N15/29 , C12N15/82 , A01H5/00 , A01H6/46
Abstract: 本发明公开了一个可以提高水稻苗干重的基因及其应用。所述提高水稻苗干重的基因的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示，其编码蛋白的氨基酸序列如SEQ ID NO.2所示。本发明首次确定敲除LOC_Os05g09520基因可以增加水稻苗干重，基于前人对LOC_Os05g09520基因功能的研究成果，我们同时测量了LOC_Os05g09520敲除植株的粒宽和千粒重，发现敲除LOC_Os05g09520基因后，增加水稻苗干重的同时，粒宽和千粒重均显著增加，因此，LOC_Os05g09520是一个有重要应用价值的基因。因此，本发明为提高水稻直播和水稻产量的水稻种质资源改良/遗传育种提供了技术支持。
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公开(公告)号：CN117095747B
公开(公告)日：2024-04-30
申请号：CN202311095082.8
申请日：2023-08-29
Applicant: 广东省农业科学院水稻研究所
IPC: G16B20/20 , G16B30/10 , G16B40/00 , G16B50/30 , G06N3/048 , G06N3/0499 , G06N3/084 , G06N3/0985
Abstract: 本发明公开了一种基于线性泛基因组和人工智能模型检测群体倒位或转座子端点基因型的方法，将群体高深度测序数据挂载到线性泛基因组上；根据群体中每个样品的二代测序序列覆盖情况，检测每个窗口被测序序列完全覆盖的情况，记录窗口位置信息和完全覆盖该窗口的reads数量；构建人工智能模型，通过模拟数据训练模型使其能判定连续窗口覆盖区域是否包含倒位或转座子端点；利用模型扫描一条染色体上的所有区域，得到其上的所有倒位或转座子端点信息，依次扫描多条染色体，汇总成一个样品所有染色体上的倒位或转座子端点信息；基于不同样品，整理并筛选群体水平的倒位或转座子端点基因型矩阵。本发明实现了利用二代测序数据检测转座子和倒位端点基因型。
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公开(公告)号：CN117095747A
公开(公告)日：2023-11-21
申请号：CN202311095082.8
申请日：2023-08-29
Applicant: 广东省农业科学院水稻研究所
IPC: G16B20/20 , G16B30/10 , G16B40/00 , G16B50/30 , G06N3/048 , G06N3/0499 , G06N3/084 , G06N3/0985
Abstract: 本发明公开了一种基于线性泛基因组和人工智能模型检测群体倒位或转座子端点基因型的方法，将群体高深度测序数据挂载到线性泛基因组上；根据群体中每个样品的二代测序序列覆盖情况，检测每个窗口被测序序列完全覆盖的情况，记录窗口位置信息和完全覆盖该窗口的reads数量；构建人工智能模型，通过模拟数据训练模型使其能判定连续窗口覆盖区域是否包含倒位或转座子端点；利用模型扫描一条染色体上的所有区域，得到其上的所有倒位或转座子端点信息，依次扫描多条染色体，汇总成一个样品所有染色体上的倒位或转座子端点信息；基于不同样品，整理并筛选群体水平的倒位或转座子端点基因型矩阵。本发明实现了利用二代测序数据检测转座子和倒位端点基因型。
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公开(公告)号：CN112410455B
公开(公告)日：2021-09-10
申请号：CN202011408366.4
申请日：2020-12-04
Applicant: 广东省农业科学院水稻研究所
IPC: C12Q1/6895 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种水稻黑条矮缩病抗病位点qSRV6.1及其应用。qSRV6.1位于水稻日本晴参考基因组(IRGSP‑1.0)0.91‑1.18Mb的物理位置上。测序分析发现，抗病品种W44相对于感病品种日本晴，在日本晴基因组926852bp后插入了插入了25个核苷酸，在日本晴基因组1171606bp后插入了插入了12个核苷酸，在日本晴基因组1171647bp后插入插入了9个核苷酸。与抗病位点qSRV6.1紧密连锁的分子标记qSRV6.1‑1和qSRV6.1‑2可以有效的用于区分抗病品种和感病品种，且可以用于杂交育种过程中的分子标记辅助选择。本发明利用试验证明抗病位点qSRV6.1能够显著提高水稻的SRBSDV抗性，在水稻抗病应用中具有重要的价值。
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公开(公告)号：CN112279903B
公开(公告)日：2021-08-24
申请号：CN202011181413.6
申请日：2020-10-29
Applicant: 广东省农业科学院水稻研究所
IPC: C07K14/415 , C12N15/29 , C12N15/82 , A01H6/46 , A01H5/00
Abstract: 本发明公开了一种提高水稻穗期稻瘟病抗性的基因及其用途。提高水稻穗期稻瘟病抗性的基因，其核苷酸序列如SEQ ID NO.1的第108位碱基‑第797位碱基序列所示，编码的氨基酸序列如SEQ ID NO.2所示。本发明首次从稻瘟病持久抗性品种三黄占2号中成功克隆到提高水稻穗期稻瘟病抗性的基因，利用Camv35S启动子构建超表达Os03g0694000基因的水稻转化载体。该载体转化水稻后能大幅提高Os03g0694000基因的表达量，伴随着表达量的提高，转化植株的穗期稻瘟病抗性有明显的提高，并且转基因植株在生长状态及农艺性状上没有明显的改变。本发明超表达Os03g0694000基因的技术可以应用于水稻的基因遗传工程育种和生产实践中，提高水稻的穗期稻瘟病抗性，从而保障目前粮食短缺的情况下水稻的生产安全。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN112430603A
公开(公告)日：2021-03-02
申请号：CN202011437433.5
申请日：2020-12-07
Applicant: 广东省农业科学院水稻研究所
IPC: C12N15/29 , C12N15/11 , C12Q1/6895
Abstract: 本发明属于水稻性状基因定位的技术领域，具体涉及一种水稻低温发芽力稳定表达的基因及其分子标记和应用。所述基因位于水稻基因组第10染色体的11551587～11780489bp区间内，命名为qTLG10，其中TAC单倍型的低温发芽力低，CGT单倍型的低温发芽力高；所述分子标记包括D22484或10ID1，所得基因及其分子标记有助于强低温发芽力的水稻品种的选育，由于水稻低温发芽力的鉴定需要特定的低温条件，表型选择比较困难，通过本发明的qLTG10单倍型的筛选可准确判定低温发芽力强弱的基因型；本发明所述分子标记在苗期对低世代的育种群体进行基因型选择，加快耐低温水稻的育种进程。
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公开(公告)号：CN113373157B
公开(公告)日：2022-10-14
申请号：CN202110653753.2
申请日：2021-06-11
Applicant: 广东省农业科学院水稻研究所
IPC: C12N15/29 , C12N15/82 , C07K14/415 , A01H5/00 , A01H6/46
Abstract: 本发明公开了GF14C基因在提高水稻耐盐抗性中的应用。所述的基因为GF14C基因，其核苷酸序列如SEQ ID NO.1的第32位碱基‑第802位碱基序列所示。本发明首次从水稻品种BC‑10中成功克隆到提高水稻耐盐抗性的基因‑GF14C基因，利用Camv35S启动子构建超表达GF14C基因的水稻转化载体。该载体转化水稻后能显著提高GF14C基因的表达量，伴随着表达量的提高，转化植株的耐盐抗性有明显的提高，在盐胁迫条件下，GF14C的过量表达转基因植株比对照平均提高19％的存活率。因此，GF14C是在盐胁迫中发挥正向调控作用的防卫基因。本发明超表达GF14C基因的技术可以应用于水稻的基因遗传工程育种，并能够应用于生产实践中，提高水稻的耐盐抗性，从而保障目前粮食短缺的情况下水稻的生产安全。
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公开(公告)号：CN114437191B
公开(公告)日：2022-10-11
申请号：CN202210207259.8
申请日：2022-03-04
Applicant: 广东省农业科学院水稻研究所
IPC: C07K14/415 , C12N15/29 , C12N15/82 , A01H5/00 , A01H6/46
Abstract: 本发明公开了一个依赖电压的阴离子通道蛋白OsVDAC4及其在调控水稻雄性不育中的应用。依赖电压的阴离子通道蛋白OsVDAC4，氨基酸序列如SEQIDNO.1所示，其特征在于，定位于细胞核和细胞质，在酵母细胞中与OsBVF1蛋白互作。本发明首次证明了水稻依赖电压的阴离子通道蛋白OsVDAC4是水稻雄性发育的功能基因，该基因序列变异会导致水稻雄性不育。因此，OsVDAC4生物学功能的研究对于水稻雄性不育分子机制的深入解析有重要的参考意义，为水稻雄性不育遗传工程的应用提供了有潜力的基因。
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公开(公告)号：CN114437191A
公开(公告)日：2022-05-06
申请号：CN202210207259.8
申请日：2022-03-04
Applicant: 广东省农业科学院水稻研究所
IPC: C07K14/415 , C12N15/29 , C12N15/82 , A01H5/00 , A01H6/46
Abstract: 本发明公开了一个依赖电压的阴离子通道蛋白OsVDAC4及其在调控水稻雄性不育中的应用。依赖电压的阴离子通道蛋白OsVDAC4，氨基酸序列如SEQIDNO.1所示，其特征在于，定位于细胞核和细胞质，在酵母细胞中与OsBVF1蛋白互作。本发明首次证明了水稻依赖电压的阴离子通道蛋白OsVDAC4是水稻雄性发育的功能基因，该基因序列变异会导致水稻雄性不育。因此，OsVDAC4生物学功能的研究对于水稻雄性不育分子机制的深入解析有重要的参考意义，为水稻雄性不育遗传工程的应用提供了有潜力的基因。
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公开(公告)号：CN113373157A
公开(公告)日：2021-09-10
申请号：CN202110653753.2
申请日：2021-06-11
Applicant: 广东省农业科学院水稻研究所
IPC: C12N15/29 , C12N15/82 , C07K14/415 , A01H5/00 , A01H6/46
Abstract: 本发明公开了GF14C基因在提高水稻耐盐抗性中的应用。所述的基因为GF14C基因，其核苷酸序列如SEQ ID NO.1的第32位碱基‑第802位碱基序列所示。本发明首次从水稻品种BC‑10中成功克隆到提高水稻耐盐抗性的基因‑GF14C基因，利用Camv35S启动子构建超表达GF14C基因的水稻转化载体。该载体转化水稻后能显著提高GF14C基因的表达量，伴随着表达量的提高，转化植株的耐盐抗性有明显的提高，在盐胁迫条件下，GF14C的过量表达转基因植株比对照平均提高19％的存活率。因此，GF14C是在盐胁迫中发挥正向调控作用的防卫基因。本发明超表达GF14C基因的技术可以应用于水稻的基因遗传工程育种，并能够应用于生产实践中，提高水稻的耐盐抗性，从而保障目前粮食短缺的情况下水稻的生产安全。
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