基于CRISPR-Cas12a传感系统的PPIs检测平台及检测方法

    公开(公告)号:CN114088952B

    公开(公告)日:2024-04-16

    申请号:CN202111399079.6

    申请日:2021-11-19

    Applicant: 南通大学

    Abstract: 本发明提供一种基于CRISPR‑Cas12a传感系统的PPIs检测平台及检测方法,用于p53‑MDM2相互作用监测和抑制剂疗效评价。所述检测方法包括如下步骤:对Cas‑PPIor进行探针设计及Cas‑PPIor可行性进行验证;Cas‑PPIor用于p53‑MDM2相互作用研究及抑制剂效力评价;Cas‑PPIor用于细胞内蛋白相互作用检测。本发明开发了基于CRISPR‑Cas12a传感系统的PPIs检测平台,可以实现有效的p53‑MDM2相互作用过程监测以及小分子拮抗剂的抑制作用效力评估。

    一种环境介质中新冠病毒的可视化快速检测方法

    公开(公告)号:CN116536452A

    公开(公告)日:2023-08-04

    申请号:CN202310432841.9

    申请日:2023-04-21

    Applicant: 南通大学

    Abstract: 本发明属于病毒检测及环境监测领域,公开了一种环境介质中新冠病毒的可视化快速检测方法。该检测方法在单管中进行逆转录重组酶聚合酶扩增(RT‑RPA)、Cas12a酶激活、G‑四链体(G4)切割和基于G4的比色反应,可避免假阳性结果,提高了检测可靠性,同时具有灵敏度高、特异性好和成本低等优点,且该方法中用于单管测定的致病微生物基因组是在没有进一步纯化的情况下通过酸处理快速获得的,监测过程简单。本发明提供的检测方法可广泛应用于致病微生物现场环境监测中。

    一种基于RPA-UDG与Cas12a联用的SNP分型方法及应用

    公开(公告)号:CN117965698A

    公开(公告)日:2024-05-03

    申请号:CN202410286405.X

    申请日:2024-03-13

    Applicant: 南通大学

    Abstract: 本发明属于核酸检测技术领域,公开了一种基于RPA‑UDG与Cas12a联用进行SNP分型的方法及其应用。方法为:将RPA反向引物中的脱氧胸苷替换为脱氧尿嘧啶,对目标核酸进行扩增后利用UDG降解产物的dU碱基,得到dsDNA靶标;构建包括Cas12a、sgRNA、调控链、ssDNA荧光底物和dsDNA靶标的Cas12a检测体系,利用sgRNA触发TSDR,激活Cas12a的反式切割活性,降解ssDNA荧光底物,产生荧光信号;根据荧光信号进行基因分型。该方法可对目标核酸上的突变位点进行高灵敏度高特异性的检测,可成功区分ApoE基因rs7412位点的三种基因型,检测过程无需温度循环仪器,操作便捷。

    一种用于检测外泌体的DNA分子机器

    公开(公告)号:CN111781180B

    公开(公告)日:2022-10-18

    申请号:CN202010655609.8

    申请日:2020-07-09

    Applicant: 南通大学

    Inventor: 苏高星 于艳艳

    Abstract: 本发明提供一种用于检测外泌体的DNA分子机器,由特征Substrate链和Aptamer锁定的Motor链结合在金纳米粒子(GNP)表面构成,用于荧光检测外泌体中的特异性生物标记物,进而确定外泌体的浓度。本发明通过外泌体膜上的CD63蛋白与DNA分子机器上用于锁定Motor链的CD63 aptamer的特异性识别,从而解除Motor链的锁定,Motor链和Substrate链结合,可被限制性内切酶切断Substrate链,使DNA分子机器开始运行,并释放荧光分子。本发明提供的DNA分子机器具有高特异性和灵敏性,并且成本低廉;CD63 aptamer也可被替换成其他特异性生物标志物的适配体,扩大了DNA分子机器的检测范围。

    一种壳-核结构的siRNA仿病毒递送系统及应用

    公开(公告)号:CN107875400A

    公开(公告)日:2018-04-06

    申请号:CN201711155278.6

    申请日:2017-11-20

    Applicant: 南通大学

    Abstract: 本发明公开了一种壳-核结构的siRNA仿病毒递送系统,内核为多聚精氨酸或多聚组氨酸修饰的壳聚糖包覆siRNA,外壳为含有RGD基序的多肽和精氨酸共同修饰的白蛋白。本发明所述的递送系统能够靶向识别肿瘤细胞,进入内体-溶酶体酸性环境中后,脱去蛋白外壳,暴露的内核能够从内体-溶酶体中逃逸,随后在胞内GSH还原条件下释放siRNA。本发明所述的递送系统稳定性好,基因载量高,主动靶向性能优异,能够显著提高siRNA的基因沉默效果,有效抑制肿瘤细胞生长及转移。

    基于PfAgo-G4的H1N1病毒检测试剂盒及检测方法

    公开(公告)号:CN117844980A

    公开(公告)日:2024-04-09

    申请号:CN202311855361.X

    申请日:2023-12-29

    Applicant: 南通大学

    Abstract: 本发明属于H1N1病毒检测技术领域,公开了一种基于PfAgo‑G4的H1N1病毒检测试剂盒及检测方法。检测试剂盒包括primer‑F,primer‑R,gDNA1,gDNA2,G4‑a,G4‑b和Link,其序列如SEQ ID NO:1‑7所述。所述检测方法包括如下步骤:将H1N1病毒基因扩增后得到双链DNA序列,此序列可被gDNA1和gDNA2特异性识别,从而引导PfAgo切割上述双链DNA,进而生成gDNA3进行Link的切割;采用G4作为荧光信号输出手段,Link的降解导致G4的荧光降低,从而实现对H1N1病毒的检测。本发明检测成本低,特异性强,可对单碱基突变实现高灵敏检测。

    一种用于检测微囊藻毒素-LR的试纸检测方法

    公开(公告)号:CN114384242A

    公开(公告)日:2022-04-22

    申请号:CN202210050940.6

    申请日:2022-01-17

    Applicant: 南通大学

    Abstract: 本发明属于生物传感器及环境监测领域,公开了用于检测微囊藻毒素‑LR的试纸检测方法。该试纸检测方法包括:构建磁珠‑DNA探针;将磁珠‑DNA探针与待检测水样混合;磁分离Blocker链;构建CRISPR‑Cas12a系统;采用试纸检测。当MC‑LR存在时,磁珠‑DNA探针上的DNA双链Probe中的Blocker链与MC‑LR竞争结合Aptamer,进而释放Blocker链,释放的Blocker链与Cas12a‑crRNA结合,可激活CRISPR‑Cas12a系统的核酸酶活性,从而非特异性切断信号链Reporter链,断裂的Reporter链可让试纸的T线显色。该试纸检测方法对MC‑LR具有高特异性和灵敏性,并且成本低廉,可用于真实环境水样的检测。

    基于CRISPR-Cas12a传感系统的PPIs检测平台及检测方法

    公开(公告)号:CN114088952A

    公开(公告)日:2022-02-25

    申请号:CN202111399079.6

    申请日:2021-11-19

    Applicant: 南通大学

    Abstract: 本发明提供一种基于CRISPR‑Cas12a传感系统的PPIs检测平台及检测方法,用于p53‑MDM2相互作用监测和抑制剂疗效评价。所述检测方法包括如下步骤:对Cas‑PPIor进行探针设计及Cas‑PPIor可行性进行验证;Cas‑PPIor用于p53‑MDM2相互作用研究及抑制剂效力评价;Cas‑PPIor用于细胞内蛋白相互作用检测。本发明开发了基于CRISPR‑Cas12a传感系统的PPIs检测平台,可以实现有效的p53‑MDM2相互作用过程监测以及小分子拮抗剂的抑制作用效力评估。

    一种DNA框架包裹的G-四链体结构及其制备方法与应用

    公开(公告)号:CN112226487B

    公开(公告)日:2025-01-03

    申请号:CN202011071468.1

    申请日:2020-10-09

    Applicant: 南通大学

    Abstract: 本发明公开了一种DNA框架包裹的G‑四链体结构及其制备方法与应用。本发明通过将组装框架结构所需的6条DNA序列、构成G‑四链体探针所需的Cy3序列和Cy5序列以终浓度0.6μM在缓冲液中混合均匀,将样品放入PCR仪中在3.5小时内从95℃程序退火到4℃,得到DNA框架包裹的G‑四链体纳米结构(G4‑F),在靶序列(miR‑122a)缺失的情况下,仅出现来自Cy3的绿色荧光。而当靶序列存在时,则能够促进荧光共振能量转移过程,使得Cy3荧光减弱的同时Cy5荧光增强。本发明制备方法简单,成本低廉,所制备的G4‑F可以特异性地检测目的靶标,不受外界环境因素干扰,具有高度稳定性,DNA框架结构可以在细胞内有效保护G‑四链体探针不被细胞内物质降解,能够高效识别靶标序列并实现细胞内成像检测。

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