公开(公告)号：CN102747155A

公开(公告)日：2012-10-24

申请号：CN201210235805.5

申请日：2012-07-09

Applicant: 南京大学

Inventor： 程树培 ,  张宴 ,  吴兵 ,  陈亚军 ,  张徐祥 ,  李梅 ,  崔益斌 ,  李爱民 ,  顾继东 ,  福得 ,  史薇 ,  韦斯 ,  刘苏 ,  尹金宝 ,  施鹏 ,  赵福正 ,  黄开龙 ,  张宗尧 ,  贾舒宇 ,  王铸

IPC: C12Q1/68

Abstract: 毒理基因组学指数（crTGI）预警饮用水源水致癌风险的方法，步骤如下：（1）应用基因芯片，检测水源水对小鼠的涉癌毒理基因组学指数（crTGIs），指示水样中所有污染物潜在的致癌毒性；（2）以强致癌污染物苯并芘（BaP）为阳性毒性对照，将水源水涉癌毒理基因组学指数（crTGIs）数值，转化为BaP毒性的当量浓度；根据美国EPA控制BaP对人体致癌风险的标准阈值浓度，评价水源水BaP当量浓度的致癌风险度。

公开(公告)号：CN108486238A

公开(公告)日：2018-09-04

申请号：CN201810323589.7

申请日：2018-04-10

Applicant: 南京大学

Inventor： 黄开龙 ,  任洪强 ,  张徐祥 ,  叶林 ,  孙浩浩 ,  赵福正

IPC: C12Q1/6869 ,  C12Q1/04

CPC classification number: C12Q1/6869 ,  C12Q2531/113 ,  C12Q2535/122 ,  C12Q2537/165

Abstract: 本发明公开了一种基于高通量测序的生物强化功能菌群解析方法，包括如下操作步骤：采用膜生物反应器，通过不断提高进水中负荷进行功能微生物组的驯化；采集膜生物反应器中每个运行阶段稳定运行后的污泥，离心沉淀以富集微生物，并对每个运行阶段的污泥样品进行微生物总DNA的提取；目标片段PCR扩增并纯化扩增产物；对扩增产物质量鉴定，并将不同样品PCR扩增产物按等质量进行混合；对混合文库进行片段大小和定量检测，并高通量测序；最后进行原始数据质控及生物信息学分析。本发明解析方法能从生态学角度系统解析废水生化处理工艺中微生物群落的结构特征，确定废水处理系统中核心功能菌群，并甄别影响微生物群落结构的关键水质参数。

公开(公告)号：CN108486238B

公开(公告)日：2020-10-16

申请号：CN201810323589.7

申请日：2018-04-10

Applicant: 南京大学

Inventor： 黄开龙 ,  任洪强 ,  张徐祥 ,  叶林 ,  孙浩浩 ,  赵福正

IPC: C12Q1/6869 ,  C12Q1/04

Abstract: 本发明公开了一种基于高通量测序的生物强化功能菌群解析方法，包括如下操作步骤：采用膜生物反应器，通过不断提高进水中负荷进行功能微生物组的驯化；采集膜生物反应器中每个运行阶段稳定运行后的污泥，离心沉淀以富集微生物，并对每个运行阶段的污泥样品进行微生物总DNA的提取；目标片段PCR扩增并纯化扩增产物；对扩增产物质量鉴定，并将不同样品PCR扩增产物按等质量进行混合；对混合文库进行片段大小和定量检测，并高通量测序；最后进行原始数据质控及生物信息学分析。本发明解析方法能从生态学角度系统解析废水生化处理工艺中微生物群落的结构特征，确定废水处理系统中核心功能菌群，并甄别影响微生物群落结构的关键水质参数。