一种内分泌干扰物特征质谱指纹提取的方法与应用

    公开(公告)号:CN117630148A

    公开(公告)日:2024-03-01

    申请号:CN202311623818.4

    申请日:2023-11-30

    Applicant: 南京大学

    Abstract: 本发明公开了一种内分泌干扰物特征质谱指纹提取的方法与应用,属于质谱数据处理和内分泌干扰物的高通量识别筛查领域。本发明通过对内分泌干扰物质谱数据的收集和处理,对多个类别的内分泌干扰物进行特征质谱指纹的提取和识别,建立种类全面的内分泌干扰物质谱数据库,实现质谱层面高通量筛查潜在的内分泌干扰物,大大提高非靶向的筛查效率,在污染物的识别领域具有极大的应用价值,对内分泌干扰物的可疑筛查具有重要的指导意义。

    一种基于核受体二聚过程的雌激素干扰活性定量预测方法

    公开(公告)号:CN111462827A

    公开(公告)日:2020-07-28

    申请号:CN202010466655.3

    申请日:2020-05-28

    Applicant: 南京大学

    Abstract: 本发明公开了一种基于核受体二聚过程的雌激素干扰活性定量预测方法,属于预测毒理学领域。本发明首先获取雌激素受体的晶体结构,并确定晶体结构中配体的雌激素效应EC50值,然后对雌激素受体的晶体结构的受体蛋白和配体分子进行预处理;然后构建复合体对复合体进行分子动力学模拟,计算复合体的自由结合能;建立定量相关关系,拟合回归预测模型;最后利用所拟合的回归模型进行雌激素干扰活性预测。本发明综合考虑了受配体结合、二聚化、共因子招募过程,然后利用分子动力学方法计算复合体的结合能,并建立预测回归模型,有效地提高了雌激素干扰活性的预测准确性。

    水样中关键拟/抗雄激素干扰毒物快速鉴别方法

    公开(公告)号:CN103529145B

    公开(公告)日:2015-01-14

    申请号:CN201310539205.2

    申请日:2013-11-04

    Applicant: 南京大学

    Abstract: 本发明公开了一种水样中关键拟/抗雄激素干扰毒物快速鉴别方法。其主要包括以下步骤:水样通过固相萃取柱进行富集,萃取柱负压真空干燥;依次用有机溶剂洗脱萃取柱,将洗脱液浓缩,定容,一半用于拟/抗雄激素总毒性测试,并基于标准物质EC50与稀释倍数计算总毒性当量,另一半用于有毒样品的主要致毒物质鉴别;基于常见拟/抗雄激素活性毒物的质谱特征与毒性当量建立毒物质量平衡数据库,进而基于定性分析与定量分析的结果,进行毒性当量与毒性贡献率计算,确定主要致毒物质。本发明样品需求量少,试剂消耗少,成本低,步骤少,却能较快速的鉴别不同污染水平水体中的拟/抗雄激素毒物。

    一种基于作用模式的人类发育毒性预测的方法

    公开(公告)号:CN113409899B

    公开(公告)日:2024-02-09

    申请号:CN202110677549.4

    申请日:2021-06-18

    Applicant: 南京大学

    Abstract: 本发明公开了一种基于作用模式的人类发育毒性预测的方法,属于化学品的人类发育毒性虚拟筛选与活性预测领域。包括构建化合物活性数据集,基于人类发育毒性作用模式,选取了有害结局路径,收集了有害结局路径信号通路上的研究事件及其活性数据;并基于所述数据集构建第一预测模型;然后利用若干种具有体内实验数据的化合物,以及利用所述第一预测模型对具有体内实验数据的化合物进行预测的预测结果,利用朴素贝叶斯算法训练得到第二预测模型;将待测化合物输入到所述第一预测模型中进行定性预测,并将定性预测结果输入所述第二预测模型,完成对化学品的人类发育毒性进行预测。本发明可以对潜在基于作用模式的人类发育毒性化学品进行高通量筛查。

    一种水中有机污染物的仿生富集及识别方法

    公开(公告)号:CN116297972A

    公开(公告)日:2023-06-23

    申请号:CN202310320421.1

    申请日:2023-03-29

    Applicant: 南京大学

    Abstract: 本发明公开了一种水中有机污染物的仿生富集及识别方法,采用低密度聚乙烯膜进行有机污染物的仿生富集,节省了大量的实验生物;采用特殊的溶剂对被动富集材料进行净化、有机污染物的提取,利用超高效液相色谱‑四级杆轨道阱质谱实现种类繁多有机污染物的高效分离、扫描;利用MS Dial自带质谱数据库,进行有机污染物的识别;在不购买标准品的情景下实现有机污染物高置信度的识别及富集因子的计算。

    一种同时测定环境水样中多种内分泌干扰物的方法

    公开(公告)号:CN109682897B

    公开(公告)日:2022-09-23

    申请号:CN201910044583.0

    申请日:2019-01-17

    Applicant: 南京大学

    Abstract: 本发明公开了一种同时测定环境水样中多种内分泌干扰物的方法,属于环境检测领域。它包括:(1)取水样,自然沉淀或离心后取上清液;使用固相萃取装置将上清液经过活化后的固相萃取小柱富集,富集后将萃取柱进行离心或真空干燥;(2)使用有机溶剂洗脱萃取柱,洗脱液浓缩后使用甲醇定容制成待测液;(3)建立目标污染物的定量方法;(4)采用高效液相色谱‑三重四级杆质谱测定水样中内分泌干扰物的浓度。本发明方法试剂消耗少,成本低,步骤少却能同时对水体中的多种内分泌干扰物进行定量分析,将关注的内分泌干扰物从传统的几种到十几种扩展到103种,大幅提高分析通量,拓展了应用范围,能够更好地识别环境水样中潜在高风险内分泌干扰物。

    一种基于增强采样分子动力学模拟的混合拟、抗雌激素干扰物的识别方法

    公开(公告)号:CN110610745A

    公开(公告)日:2019-12-24

    申请号:CN201910904484.5

    申请日:2019-09-24

    Applicant: 南京大学

    Abstract: 本发明公开了一种基于增强采样分子动力学模拟的混合拟、抗雌激素效应的识别和预测方法,基于核受体变构和共调节因子调控机制,采用增强采样分子动力学模拟方法,通过识别局部和全局自由能最低点并进行动态轨迹聚类,提取配体化合物作用下雌激素受体α的稳态构象,并根据受体第12号螺旋稳定位置与共调节因子招募/抑制机制的关系,判断受测化合物的雌激素干扰效应,识别和预测拟性、抗性和混合拟、抗性干扰物。相比于传统体外实验方法,此方法成本低廉、效率更高,且避免了混合拟、抗性干扰物的细胞特异性问题;相比于已有的计算机辅助筛选方法,此方法能有效识别稳态构象,实现混合拟、抗雌激素干扰效应的预测。

    一种基于增强采样分子动力学模拟的混合拟、抗糖皮质激素干扰物的识别方法

    公开(公告)号:CN110501510A

    公开(公告)日:2019-11-26

    申请号:CN201910904152.7

    申请日:2019-09-24

    Applicant: 南京大学

    Abstract: 本发明公开了一种基于增强采样分子动力学模拟的混合拟、抗糖皮质激素干扰物的识别方法,基于核受体变构和共调节因子调控机制,采用增强采样分子动力学模拟方法,通过识别局部和全局自由能最低点并进行动态轨迹聚类,提取配体化合物作用下糖皮质激素受体的稳态构象,并根据受体第12号螺旋稳定位置与共调节因子招募/抑制机制的关系,判断受测化合物的内分泌干扰效应,识别和预测拟性、抗性和混合拟、抗糖皮质激素干扰物。相比于传统体外实验方法,此方法成本低廉、效率更高,且避免了混合拟、抗性干扰物的细胞特异性问题;相比于已有的计算机辅助筛选方法,此方法能有效识别稳态构象,实现混合拟、抗糖皮质激素干扰效应的预测。

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