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公开(公告)号：CN103529145B
公开(公告)日：2015-01-14
申请号：CN201310539205.2
申请日：2013-11-04
Applicant: 南京大学
Abstract: 本发明公开了一种水样中关键拟/抗雄激素干扰毒物快速鉴别方法。其主要包括以下步骤：水样通过固相萃取柱进行富集，萃取柱负压真空干燥；依次用有机溶剂洗脱萃取柱，将洗脱液浓缩，定容，一半用于拟/抗雄激素总毒性测试，并基于标准物质EC50与稀释倍数计算总毒性当量，另一半用于有毒样品的主要致毒物质鉴别；基于常见拟/抗雄激素活性毒物的质谱特征与毒性当量建立毒物质量平衡数据库，进而基于定性分析与定量分析的结果，进行毒性当量与毒性贡献率计算，确定主要致毒物质。本发明样品需求量少，试剂消耗少，成本低，步骤少，却能较快速的鉴别不同污染水平水体中的拟/抗雄激素毒物。
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公开(公告)号：CN105893759B
公开(公告)日：2018-08-24
申请号：CN201610201950.X
申请日：2016-04-01
Applicant: 南京大学
IPC: G06F19/00
CPC classification number: G06F19/12 , G01N2333/723 , G06F19/16 , G06F19/18
Abstract: 本发明公开了一种基于核受体共调节因子的甲状腺激素干扰物虚拟筛选及其干扰活性的定量计算方法，它基于核受体共调节因子调节机制，采用分子动力学模拟和结合自由能计算方法，通过12号螺旋的稳定位置、甲状腺激素的后踢与共激活因子、共抑制因子相互关系判断受测化合物的甲状腺激素干扰效应，区分积极的抗性、消极的抗性和拟性效应，通过计算配体‑受体结合自由能预测相关活性大小。与现有技术相比，本发明相比于传统的体外筛查方法，成本低廉、操作简单、效率更高；相比于其他虚拟筛选方法，此方法更全面地考虑了分子作用机制，可以区分拟性和抗性，定性和定量预测结果更可靠。
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公开(公告)号：CN103529145A
公开(公告)日：2014-01-22
申请号：CN201310539205.2
申请日：2013-11-04
Applicant: 南京大学
Abstract: 本发明公开了一种水样中关键拟/抗雄激素干扰毒物快速鉴别方法。其主要包括以下步骤：水样通过固相萃取柱进行富集，萃取柱负压真空干燥；依次用有机溶剂洗脱萃取柱，将洗脱液浓缩，定容，一半用于拟/抗雄激素总毒性测试，并基于标准物质EC50与稀释倍数计算总毒性当量，另一半用于有毒样品的主要致毒物质鉴别；基于常见拟/抗雄激素活性毒物的质谱特征与毒性当量建立毒物质量平衡数据库，进而基于定性分析与定量分析的结果，进行毒性当量与毒性贡献率计算，确定主要致毒物质。本发明样品需求量少，试剂消耗少，成本低，步骤少，却能较快速的鉴别不同污染水平水体中的拟/抗雄激素毒物。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN105893759A
公开(公告)日：2016-08-24
申请号：CN201610201950.X
申请日：2016-04-01
Applicant: 南京大学
IPC: G06F19/00
CPC classification number: G06F19/12 , G01N2333/723 , G06F19/16 , G06F19/18 , G06F19/00
Abstract: 本发明公开了一种基于核受体共调节因子的甲状腺激素干扰物虚拟筛选及其干扰活性的定量计算方法，它基于核受体共调节因子调节机制，采用分子动力学模拟和结合自由能计算方法，通过12号螺旋的稳定位置、甲状腺激素的后踢与共激活因子、共抑制因子相互关系判断受测化合物的甲状腺激素干扰效应，区分积极的抗性、消极的抗性和拟性效应，通过计算配体?受体结合自由能预测相关活性大小。与现有技术相比，本发明相比于传统的体外筛查方法，成本低廉、操作简单、效率更高；相比于其他虚拟筛选方法，此方法更全面地考虑了分子作用机制，可以区分拟性和抗性，定性和定量预测结果更可靠。
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公开(公告)号：CN103529145B9
公开(公告)日：2015-05-13
申请号：CN201310539205.2
申请日：2013-11-04
Applicant: 南京大学
Abstract: 本发明公开了一种水样中关键拟/抗雄激素干扰毒物快速鉴别方法。其主要包括以下步骤：水样通过固相萃取柱进行富集，萃取柱负压真空干燥；依次用有机溶剂洗脱萃取柱，将洗脱液浓缩，定容，一半用于拟/抗雄激素总毒性测试，并基于标准物质EC50与稀释倍数计算总毒性当量，另一半用于有毒样品的主要致毒物质鉴别；基于常见拟/抗雄激素活性毒物的质谱特征与毒性当量建立毒物质量平衡数据库，进而基于定性分析与定量分析的结果，进行毒性当量与毒性贡献率计算，确定主要致毒物质。本发明样品需求量少，试剂消耗少，成本低，步骤少，却能较快速的鉴别不同污染水平水体中的拟/抗雄激素毒物。
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公开(公告)号：CN106407740A
公开(公告)日：2017-02-15
申请号：CN201610806127.1
申请日：2016-09-05
Applicant: 南京大学
IPC: G06F19/16
CPC classification number: G16B15/00
Abstract: 本发明公开了一种基于分子动力学模拟筛分黄酮类化合物抗雄活性方法，受试黄酮化合物结构经过优化后和同源模建获得的受体文件进行对接组成复合物，然后用GROMACS软件包进行分子动力学模拟20纳秒，计算黄酮化合物受体的12号螺旋8～20ns均方根偏差，将数据导入R语言包，计算出的标准偏差及残差建立区分模型，再将模糊区域中的化合物通过考察其在受体中的运动轨迹及计算的均方根偏差，排除无活性化合物。本发明首次引入定量判断，并运用定量和定性结合来提高预判的精确度，使得抗性和无抗性黄酮的区分率达到87.5％，无抗性黄酮的筛除率达到90％，不仅能够大幅削减实验室工作量，减少试验品消耗，节约资源，还能大幅提高QSAR预测的准确性，使得QSAR能够真正实现应用。
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公开(公告)号：CN103324861B
公开(公告)日：2016-07-20
申请号：CN201310288617.3
申请日：2013-07-10
Applicant: 南京大学
IPC: G06F19/00
Abstract: 本发明公开了一种基于分子动力学模拟的核受体介导内分泌干扰物质的虚拟筛选方法，属于环境可疑内分泌干扰物的虚拟筛选与活性预测领域。本发明是将受试小分子经过优化后和实验或者同源模建获得的受体文件进行对接组成复合物，然后用GROMACS软件包进行分子动力学模拟。对受体的12号螺旋进行运动轨迹分析，空间位置的均方根偏差分析随时间的变化曲线来鉴别具有受体活性的污染物质，在规定时间内，曲线趋于稳定的可以认为对应的螺旋定位到确定的位置，于是具有生物活性。然后再通过考察定位的位置来判断拟性还是抗性。
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公开(公告)号：CN103324861A
公开(公告)日：2013-09-25
申请号：CN201310288617.3
申请日：2013-07-10
Applicant: 南京大学
IPC: G06F19/00
Abstract: 本发明公开了一种基于分子动力学模拟的核受体介导内分泌干扰物质的虚拟筛选方法，属于环境可疑内分泌干扰物的虚拟筛选与活性预测领域。本发明是将受试小分子经过优化后和实验或者同源模建获得的受体文件进行对接组成复合物，然后用GROMACS软件包进行分子动力学模拟。对受体的12号螺旋进行运动轨迹分析，空间位置的均方根偏差分析随时间的变化曲线来鉴别具有受体活性的污染物质，在规定时间内，曲线趋于稳定的可以认为对应的螺旋定位到确定的位置，于是具有生物活性。然后再通过考察定位的位置来判断拟性还是抗性。
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