一种基于核受体二聚过程的雌激素干扰活性定量预测方法

    公开(公告)号:CN111462827A

    公开(公告)日:2020-07-28

    申请号:CN202010466655.3

    申请日:2020-05-28

    Applicant: 南京大学

    Abstract: 本发明公开了一种基于核受体二聚过程的雌激素干扰活性定量预测方法,属于预测毒理学领域。本发明首先获取雌激素受体的晶体结构,并确定晶体结构中配体的雌激素效应EC50值,然后对雌激素受体的晶体结构的受体蛋白和配体分子进行预处理;然后构建复合体对复合体进行分子动力学模拟,计算复合体的自由结合能;建立定量相关关系,拟合回归预测模型;最后利用所拟合的回归模型进行雌激素干扰活性预测。本发明综合考虑了受配体结合、二聚化、共因子招募过程,然后利用分子动力学方法计算复合体的结合能,并建立预测回归模型,有效地提高了雌激素干扰活性的预测准确性。

    一种基于核受体二聚过程的雌激素干扰活性定量预测方法

    公开(公告)号:CN111462827B

    公开(公告)日:2023-07-28

    申请号:CN202010466655.3

    申请日:2020-05-28

    Applicant: 南京大学

    Abstract: 本发明公开了一种基于核受体二聚过程的雌激素干扰活性定量预测方法,属于预测毒理学领域。本发明首先获取雌激素受体的晶体结构,并确定晶体结构中配体的雌激素效应EC50值,然后对雌激素受体的晶体结构的受体蛋白和配体分子进行预处理;然后构建复合体对复合体进行分子动力学模拟,计算复合体的自由结合能;建立定量相关关系,拟合回归预测模型;最后利用所拟合的回归模型进行雌激素干扰活性预测。本发明综合考虑了受配体结合、二聚化、共因子招募过程,然后利用分子动力学方法计算复合体的结合能,并建立预测回归模型,有效地提高了雌激素干扰活性的预测准确性。

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