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公开(公告)号：CN103593659B
公开(公告)日：2016-09-14
申请号：CN201310611263.1
申请日：2013-11-26
Applicant: 华南农业大学 , 中国林业科学研究院热带林业研究所
Abstract: 本发明公开了一种针对二倍体PCR产物的Sanger测序中个体内SNP的识别方法，首先单独分离出色谱图中包含的腺瞟呤A、鸟瞟呤G、胞嘧啶C和胸腺嘧啶T四种碱基的荧光数据；采用小波多尺度分析方法对分离的荧光数据分别进行滤波去噪处理；再分析四种碱基荧光数据的波形特征，检测出波形的第一峰与第二峰，选择波峰距离、高度比值和起伏度比值这三个波形特征，作为SNP位点判别的要素；选择结构为3‑10‑1的BP神经网络作为SNP位点检测的分类器，并采用Levenberg Marquardt算法来对BP神经网络进行训练；采用分段线性变换将输出映射为0～100的SNP评价分数，根据评价分数将SNP位点的类别定义为1～5级，并据此判定该位点的SNP置信度。本发明能够有效检测测序文件的个体内SNP位点。
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公开(公告)号：CN103593659A
公开(公告)日：2014-02-19
申请号：CN201310611263.1
申请日：2013-11-26
Applicant: 华南农业大学 , 中国林业科学研究院热带林业研究所
Abstract: 本发明公开了一种针对二倍体PCR产物的Sanger测序中个体内SNP的识别方法，首先单独分离出色谱图中包含的腺瞟呤A、鸟瞟呤G、胞嘧啶C和胸腺嘧啶T四种碱基的荧光数据；采用小波多尺度分析方法对分离的荧光数据分别进行滤波去噪处理；再分析四种碱基荧光数据的波形特征，检测出波形的第一峰与第二峰，选择波峰距离、高度比值和起伏度比值这三个波形特征，作为SNP位点判别的要素；选择结构为3-10-1的BP神经网络作为SNP位点检测的分类器，并采用Levenberg Marquardt算法来对BP神经网络进行训练；采用分段线性变换将输出映射为0～100的SNP评价分数，根据评价分数将SNP位点的类别定义为1～5级，并据此判定该位点的SNP置信度。本发明能够有效检测测序文件的个体内SNP位点。
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公开(公告)号：CN106383094A
公开(公告)日：2017-02-08
申请号：CN201610936185.6
申请日：2016-10-25
Applicant: 中国林业科学研究院热带林业研究所
IPC: G01N21/359 , G01N21/3563
CPC classification number: G01N21/359 , G01N21/3563 , G01N2021/3129 , G01N2021/3572
Abstract: 本发明公开一种快速测定尾细桉木材化学成分含量的方法，该方法通过利用已知尾细桉木材样品的近红外光谱特征吸收峰和各化学成分含量之间建立数学模型，来实现对尾细桉其他待测木材化学成分的快速测定，含以下步骤：1)样品取样；2)样品粉碎与近红外光谱采集；3)样品木材化学成分的标准测量；4)光谱处理和建模；5)模型检验；6)模型应用。本发明测定尾细桉木材纤维素、半纤维素和木质素成分含量的方法实施简便快捷、准确性和可靠性高，不仅显著降低测试成本以及减少对树木的破坏和化学药品的使用，从而实现了对尾细桉大批量样品木材化学成分含量测量的目的。
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公开(公告)号：CN110343741A
公开(公告)日：2019-10-18
申请号：CN201910665025.6
申请日：2019-07-23
Applicant: 中国林业科学研究院热带林业研究所
IPC: C12Q1/6806 , C12N15/10 , C40B50/06
Abstract: 本发明提供了一种基于双酶切的简化基因组测序文库的构建方法，属于全基因组重测序技术领域，包括利用限制性内切酶MspI和MseI对基因组DNA进行酶切，将接头序列分别连接到酶切产物上，得到连接产物；将连接产物进行等质量混合，将得到的混合物进行双轮磁珠分选，得到350bp的片段；以得到的片段为模板，用引物对进行PCR扩增，将得到的扩增产物纯化后，构建得到基于双酶切的简化基因组测序文库；所述引物对的上游引物的序列如SEQ ID No.1所示，下游引物的序列如SEQ ID No.2所示。采用本发明提供的构建方法最终开发的SNP位点有225,744个，提高了SNP位点的开发。
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公开(公告)号：CN109706265A
公开(公告)日：2019-05-03
申请号：CN201910180669.6
申请日：2019-03-11
Applicant: 中国林业科学研究院热带林业研究所
IPC: C12Q1/6895 , C12N15/11
Abstract: 本发明提供了一种SNP组合及其在桉树无性系鉴定中的应用，属于SNP标记技术领域。采用本发明提供的70个SNP标记组合极大提高对无性系检测准确度、缩短检测时间、提高检测水平，可有效应用于桉树无性系鉴定，快速甄别假冒和错乱的无性系，有效减少对桉树无性系鉴定的工作量，为桉树无性系推广、良种市场规范化提供强有力的技术检测，切实保障良种培育人和营林种植者的权益。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN119464558A
公开(公告)日：2025-02-18
申请号：CN202411919615.4
申请日：2024-12-24
Applicant: 中国林业科学研究院热带林业研究所
IPC: C12Q1/6895 , C12Q1/6858 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种用于鉴定桉树父本和品种的15重SSR标记检测方法。本发明通过实验筛选、优化和验证，筛选出了15对SSR标记引物，能够在一个反应体系中检测出15个SSR标记，并优化了反应体系，可用于快速、高效地鉴定桉树天然授粉子代的父本、确定是否天然杂种以及检测桉树无性系的品种归属与真实性。检测步骤包括：(1)DNA提取和纯化、(2)PCR扩增、(3)PCR产物检测及SSR标记分型。本发明提供的方法具有实验效率高、检测准确、操作方便、适用于不同规模等优点。
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公开(公告)号：CN117859534A
公开(公告)日：2024-04-12
申请号：CN202410221103.4
申请日：2024-02-28
Applicant: 中国林业科学研究院热带林业研究所
Abstract: 本发明公开了一种提高猴耳环扦插育苗成活率的方法，包括以下步骤：(1)基质准备与消毒、(2)选择穗条与制作插穗、(3)插穗先后浸泡水与生根剂IG、(4)扦插作业、(5)扦插后管理。本发明的猴耳环扦插育苗方法，插穗生根率高，平均生根率85.09％，最高生根率达91.67％，苗木根系发达，存活率高，可正常造林，适用于猴耳环药用良种的扩繁和种植推广，有助于解决猴耳环资源危机，实现其优质资源可持续利用。
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公开(公告)号：CN110093436B
公开(公告)日：2023-05-02
申请号：CN201910239989.4
申请日：2019-03-27
Applicant: 中国林业科学研究院热带林业研究所
IPC: C12Q1/6895 , C12N15/11 , C12Q1/6858
Abstract: 本发明公开了用于鉴定桉树无性系的SNP位点多色荧光检测引物、试剂盒、检测方法及其应用。本发明在桉树基因组中筛选多态性高的SNP标记，优化并建立了21个位点的多色荧光多重检测体系，分型结果具有带型易判读、位点多态性高、荧光易区分的特点。本发明方法具有实验效率高、检测准确、操作方便等优势。可为今后桉树快速进行种质资源遗传评价、分子标记辅助育种、无性系分子指纹构建和鉴定提供重要的技术支撑。同时构建了58个国内常用桉树无性系的分子指纹，并成功的对上述无性系进行了鉴定，大大减少了对桉树无性系鉴定的工作量。该方法可有效甄别假冒和错乱的无性系，切实保障良种培育人和营林种植者的权益。
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公开(公告)号：CN114277172A
公开(公告)日：2022-04-05
申请号：CN202111523937.3
申请日：2021-12-14
Applicant: 中国林业科学研究院热带林业研究所
IPC: C12Q1/6895 , C12Q1/686 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了猴耳环品种鉴定的SSR多重检测引物、试剂盒及方法。与单个标记的独立PCR检测相比，本发明方法具有经济性好、节约试剂和省时高效等优点，为猴耳环和近缘种的群体多样性分析、种质资源遗传评价、品种和药材真实性鉴定等提供了简便可靠的方法；将该方法用于猴耳环品种(扦插无性系)的SSR分子指纹的构建和待检品种的鉴定，具有准确可靠、有效快捷的优点，可有效甄别假冒和错乱的品种以及新的品种，这为保障良种培育人和营林种植者的权益提供了重要的技术支撑。
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公开(公告)号：CN110093436A
公开(公告)日：2019-08-06
申请号：CN201910239989.4
申请日：2019-03-27
Applicant: 中国林业科学研究院热带林业研究所
IPC: C12Q1/6895 , C12N15/11 , C12Q1/6858
Abstract: 本发明公开了用于鉴定桉树无性系的SNP位点多色荧光检测引物、试剂盒、检测方法及其应用。本发明在桉树基因组中筛选多态性高的SNP标记，优化并建立了21个位点的多色荧光多重检测体系，分型结果具有带型易判读、位点多态性高、荧光易区分的特点。本发明方法具有实验效率高、检测准确、操作方便等优势。可为今后桉树快速进行种质资源遗传评价、分子标记辅助育种、无性系分子指纹构建和鉴定提供重要的技术支撑。同时构建了58个国内常用桉树无性系的分子指纹，并成功的对上述无性系进行了鉴定，大大减少了对桉树无性系鉴定的工作量。该方法可有效甄别假冒和错乱的无性系，切实保障良种培育人和营林种植者的权益。
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