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公开(公告)号：CN117711485A
公开(公告)日：2024-03-15
申请号：CN202311397671.1
申请日：2023-10-24
Applicant: 华中农业大学
Abstract: 本发明公开了猪80K功能位点基因芯片及其应用，首次在利用猪基因组启动子、增强子、编码区关键突变等信息设计基因芯片，基于大规模多组学高通量测序数据，对功能位点按照重要性进行分类，开发以功能位点为主的功能位点基因芯片，打破了连锁依赖理论，解决了现有商业化芯片由于不同群体间因连锁程度不同，在不同群体间的通用性较差的问题。本芯片还具有捕获特性高、成本低、灵活，适用于不同品种猪种遗传育种研究及选种选配等商业化应用。
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公开(公告)号：CN115948363B
公开(公告)日：2024-02-27
申请号：CN202211045564.8
申请日：2022-08-26
Applicant: 武汉影子基因科技有限公司 , 华中农业大学
Abstract: 转座酶片段化位点基本无偏好性，无宿主污染，本发明公开了Tn5转座酶突变体及其制备方 更好地满足了高通量建库要求。法和应用，对Tn5转座酶的402和403位点的氨基酸进行突变，第402位的半胱氨酸突变为色氨酸，第403位的谷氨酰胺突变为赖氨酸，与野生型Tn5(56)对比文件Jiangang Hu 等.“Identification ofnovel biofilm genes in avian pathogenicEscherichia coli by Tn5 transposon mutantlibrary”《.World J Microbiol Biotechnol》.2022,第38卷(第8期),doi: 10.1007/s11274-022-03314-4.唐江涛 等.“细菌转座子 Tn5 转座机理的研究进展”《.广西农业生物科学》.2003,(第4期),第316-321页.
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公开(公告)号：CN111471745B
公开(公告)日：2021-09-07
申请号：CN202010239831.X
申请日：2020-03-30
Applicant: 华中农业大学
IPC: C12Q1/6806
Abstract: 本发明公开了一种基于CRISPR/Cas9系统介导的DNA靶向捕获方法，针对目标DNA区域的上下游分别设计一条sgRNA，在两条sgRNA序列的3'末端添加不同的捕获序列和一段与sgRNA反向互补的序列从而构成pegRNA，当pegRNA‑Cas9蛋白复合物靶向结合目标DNA时，通过pegRNA介导的定点插入，在目标DNA区域上下游分别插入不同的捕获序列，然后通过含捕获序列的引物进行PCR扩增，从DNA文库或全基因组中靶向富集并分离目标DNA，可直接用于后续的捕获测序。本发明提供的方法与其它富集方法相比，简单、快速、特异性强、灵敏度高，在DNA序列分析上有广阔的应用优势。
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公开(公告)号：CN111471745A
公开(公告)日：2020-07-31
申请号：CN202010239831.X
申请日：2020-03-30
Applicant: 华中农业大学
IPC: C12Q1/6806
Abstract: 本发明公开了一种基于CRISPR/Cas9系统介导的DNA靶向捕获方法，针对目标DNA区域的上下游分别设计一条sgRNA，在两条sgRNA序列的3'末端添加不同的捕获序列和一段与sgRNA反向互补的序列从而构成pegRNA，当pegRNA-Cas9蛋白复合物靶向结合目标DNA时，通过pegRNA介导的定点插入，在目标DNA区域上下游分别插入不同的捕获序列，然后通过含捕获序列的引物进行PCR扩增，从DNA文库或全基因组中靶向富集并分离目标DNA，可直接用于后续的捕获测序。本发明提供的方法与其它富集方法相比，简单、快速、特异性强、灵敏度高，在DNA序列分析上有广阔的应用优势。
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公开(公告)号：CN110358792A
公开(公告)日：2019-10-22
申请号：CN201910658641.9
申请日：2019-07-19
Applicant: 华中农业大学
IPC: C12N15/85 , C12N15/113 , C12N15/90 , C12N5/10
Abstract: 本发明公开了一种将外源基因定点整合至ACTB（beta-actin）基因下游的打靶载体，所述的打靶载体是以ACTB基因终止密码子上下游的部分序列为左、右同源臂，将左同源臂、2A剪切肽序列、外源基因序列和右同源臂依次连接起来并构建到真核表达载体或克隆载体骨架上。将该打靶载体与含特异性靶向猪ACTB基因下游的CRISPR/Cas9切割载体共转染至猪真核细胞中，实验及测序检测证实该外源基因定点整合至ACTB基因下游。本发明提供的这一打靶位点，可以拓宽外源基因在猪基因组中整合位点的范围，为制备外源基因高效稳定表达的转基因猪奠定基础。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN119082322A
公开(公告)日：2024-12-06
申请号：CN202411490334.1
申请日：2024-10-23
Applicant: 华中农业大学
IPC: C12Q1/6888
Abstract: 本发明公开了猪料肉比性状相关的SNP分子标记及应用，通过整合猪的重测序数据，并将猪重测序数据比对到猪参考基因组Sscrofa11.1上，获得SNP分型数据，利用混合线性模型进行全基因组分析，筛选出了与猪料肉比相关的146个SNP位点，这些SNP位点与猪料肉比性状的相关性达到了显著水平，为猪料肉比性状的辅助选择改良提供了新的分子标记，对于猪的辅助选育具有重要意义。
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公开(公告)号：CN113355389B
公开(公告)日：2022-11-15
申请号：CN202010146552.9
申请日：2020-03-05
Applicant: 广西扬翔股份有限公司 , 华中农业大学
IPC: C12Q1/6806 , C40B50/06 , C12Q1/6869
Abstract: 本发明涉及一种利用CRISPR/Cas12a系统靶向富集核酸目标区域的方法及其应用。该方法包括(1)设计第一和第二RNA，第一RNA除第一sgRNA分子，还含有第一互补序列，第二RNA除第二sgRNA分子，还含有第二互补序列，第一sgRNA分子和第一互补序列与目标区域上游互补，第二sgRNA分子和第二互补序列与目标区域下游互补；(2)与Cas12a蛋白混合获得复合物；(3)将复合物、核酸、逆转录酶、变性剂和dNTP混合孵育和变性，获得变性产物；(4)去除RNA和蛋白质，扩增获得富集产物。由此可简便、快捷实现目标区域的富集，应用于测序领域。
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公开(公告)号：CN114657259A
公开(公告)日：2022-06-24
申请号：CN202210200463.7
申请日：2022-03-02
Applicant: 华中农业大学
IPC: C12Q1/6888 , C12N15/11
Abstract: 本发明属于猪分子标记技术领域，具体涉及一种与猪瘦肉率性状相关SNP分子标记及其应用。通过整合NCBI数据库和欧洲生物信息研究所公开的58个品种的469头猪的重测序数据，并将重测序数据比对猪参考基因组序列获得基因分型数据，联合分析GWAS信号与增强子‑启动子三维互作网络，筛选得到一种与猪瘦肉率相关的分子标记，该标记的核苷酸序列如SEQ ID NO：1和2所示，在该序列的第51位碱基处存在一个C/T的等位基因突变,TT基因型有利于猪拥有较高的瘦肉率。
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公开(公告)号：CN114657258A
公开(公告)日：2022-06-24
申请号：CN202210200462.2
申请日：2022-03-02
Applicant: 华中农业大学
IPC: C12Q1/6888 , C12N15/11
Abstract: 本发明属于猪分子标记技术领域，具体涉及一种与猪眼肌深度性状相关的SNP分子标记及其应用。通过整合NCBI数据库和欧洲生物信息研究所公开的58个品种的469头猪的重测序数据，并将重测序数据比对猪参考基因组序列获得基因分型数据，联合分析GWAS信号与增强子‑启动子三维互作网络，筛选得到一种与猪眼肌深度相关的分子标记，该标记的核苷酸序列如SEQ ID NO：1和2所示，在该序列的第51位碱基处存在一个C/T的等位基因突变，TT基因型有利于猪拥有较高的眼肌深度。
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公开(公告)号：CN113808672A
公开(公告)日：2021-12-17
申请号：CN202110920428.8
申请日：2021-08-11
Applicant: 广州影子科技有限公司 , 华中农业大学
IPC: G16B50/30 , C12Q1/6837 , C12Q1/6888
Abstract: 本发明属于动物基因育种基因芯片构建技术领域，公开了一种基于动物基因组功能突变位点基因芯片的构建及应用。该芯片是基于构建动物基因组功能突变位点的基因数据信息数据库、比对质控数据、获得基因组遗传变异数据和基因组调控元件数据、遗传变异数据的滤除、构建遗传变异所有特征权重数据完成整体数据分析及处理后，构建出一套具有完整功能位点基因芯片。为动物遗传育种理论研究、性状高效改良和新品种培育提供技术支撑，具有重要理论和应用价值。公开了猪基因组基因芯片全部52,321个功能位点信息，为猪遗传育种理论研究、性状改良和新品种培育提供价值。本发明也适用于马、牛、羊、鸡、鱼等，家畜、家禽、水产类动物。
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