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公开(公告)号：CN117912558A
公开(公告)日：2024-04-19
申请号：CN202410309191.3
申请日：2024-03-19
Applicant: 北京医院 , 北京卡尤迪生物科技股份有限公司
Abstract: 本申请涉及生成自然界不存在的核酸序列的方法及其生成的核酸序列。所生成的核酸序列用作通过聚合酶链式反应（PCR）检测目的核酸的外源内参序列，该方法包括通过计算机执行的以下步骤：生成第一数量的核酸序列，该核酸序列中的每一个包括N个碱基对，N是正整数；基于核酸序列的期望特性，对所生成的核酸序列进行筛选，获得筛选后的核酸序列；将筛选后的核酸序列组装为外源内参序列，所述外源内参序列包含将引物和探针进行连接获得的连接后的核酸序列，该引物包括正向引物和反向引物，且正向引物、反向引物和探针中的至少一者来自筛选后的核酸序列；以及基于连接后的核酸序列与已知的自然界的核酸序列进行比较，获得自然界不存在的核酸序列。
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公开(公告)号：CN117912558B
公开(公告)日：2024-12-31
申请号：CN202410309191.3
申请日：2024-03-19
Applicant: 北京医院 , 北京卡尤迪生物科技股份有限公司
Abstract: 本申请涉及生成自然界不存在的核酸序列的方法及其生成的核酸序列。所生成的核酸序列用作通过聚合酶链式反应（PCR）检测目的核酸的外源内参序列，该方法包括通过计算机执行的以下步骤：生成第一数量的核酸序列，该核酸序列中的每一个包括N个碱基对，N是正整数；基于核酸序列的期望特性，对所生成的核酸序列进行筛选，获得筛选后的核酸序列；将筛选后的核酸序列组装为外源内参序列，所述外源内参序列包含将引物和探针进行连接获得的连接后的核酸序列，该引物包括正向引物和反向引物，且正向引物、反向引物和探针中的至少一者来自筛选后的核酸序列；以及基于连接后的核酸序列与已知的自然界的核酸序列进行比较，获得自然界不存在的核酸序列。
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公开(公告)号：CN117604105B
公开(公告)日：2024-04-30
申请号：CN202410079511.0
申请日：2024-01-19
Applicant: 北京医院
IPC: C12Q1/6886 , C12Q1/686
Abstract: 本发明涉及融合基因检测溯源技术领域，建立了一种基于内参基因的BCR‑ABL1 p190融合基因检测溯源方法，溯源方法包括内参基因ABL1检测方法的溯源；可溯源至参考质粒的p190质粒的制备；p190融合基因检测方法的溯源；建立的溯源方法可以将内参基因ABL1与p190融合基因检测的具体拷贝数以及p190融合基因/内参基因ABL1检测的比例都溯源至有证参考质粒，溯源过程中的线性关系曲线良好，R2与斜率都接近1。该溯源方法对于促进p190型融合基因检测的标准化具有重要意义。
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公开(公告)号：CN117604105A
公开(公告)日：2024-02-27
申请号：CN202410079511.0
申请日：2024-01-19
Applicant: 北京医院
IPC: C12Q1/6886 , C12Q1/686
Abstract: 本发明涉及融合基因检测溯源技术领域，建立了一种基于内参基因的BCR‑ABL1 p190融合基因检测溯源方法，溯源方法包括内参基因ABL1检测方法的溯源；可溯源至参考质粒的p190质粒的制备；p190融合基因检测方法的溯源；建立的溯源方法可以将内参基因ABL1与p190融合基因检测的具体拷贝数以及p190融合基因/内参基因ABL1检测的比例都溯源至有证参考质粒，溯源过程中的线性关系曲线良好，R2与斜率都接近1。该溯源方法对于促进p190型融合基因检测的标准化具有重要意义。
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公开(公告)号：CN117106865A
公开(公告)日：2023-11-24
申请号：CN202311061436.7
申请日：2023-08-23
Applicant: 北京医院
IPC: C12Q1/6858 , C12N15/11
Abstract: 本发明涉及DNA序列检测领域，公开了基于双扩增放大和双LNA探针特异识别DNA突变的高灵敏检测方法，步骤如下：步骤一：确定新建方法的核心反应原理，明确需评估的方法性能指标；步骤二：制备新建方法建立及验证的生物材料，包括引物、LNA探针、待测样本等；步骤三：建立新建方法的检测流程，优化新建方法的关键参数；步骤四：确定新建方法的检测阈值，评估新建方法的分析性能：包括分析敏感性、分析特异性、重复性等；步骤五：评估新建方法的临床应用价值，实现了基于双扩增放大和双LNA探针识别DNA突变的高灵敏检测新方法的建立，为DNA的灵敏、快速地检出提供技术基础，具有单核苷酸的分辨率，也可以提供技术思路，为DNA检测新技术的研发提供经验方法。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN101363041B
公开(公告)日：2011-03-23
申请号：CN200810105855.5
申请日：2008-05-04
Applicant: 卫生部北京医院
Abstract: 本发明公开了一种检测沙眼衣原体的质控物，属于临床检验学和生物技术领域。一种检测沙眼衣原体的质控物，含有序列表SEQ ID No.1至SEQ ID No.4所示的核苷酸序列或其互补序列。本发明的优点是：(1)利用重叠PCR与双酶切的方法，建立了一种将多间隔片段连接并构建入同一载体的简便有效的方法，定向克隆避免了长距离PCR效率较低的可能，二者联用可取长补短。(2)成功地得到了无生物传染危险性可模拟临床标本、可以大量生产、稳定保存的沙眼衣原体聚合酶链反应检测质控物，且具有较好的适用性。
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公开(公告)号：CN101503700A
公开(公告)日：2009-08-12
申请号：CN200810089697.9
申请日：2008-04-14
Applicant: 卫生部北京医院
Abstract: 本发明涉及一种可产生包装大片段RNA病毒样颗粒的双质粒表达系统，属于生物技术领域。一种可表达含大片段RNA病毒样颗粒的双质粒表达系统，由质粒PET－MC和质粒pACYC－X组成，其中pET－MC由pET－28(b)整合噬菌体MS2成熟酶蛋白和衣壳蛋白cDNA构建而成，pACYC－X为PACYCDuet－1整合噬菌体MS2的19mer包装位点和目的RNA的cDNA构建而成。发明的优点是：本发明构建的双质粒系统表达的病毒样颗粒内含长片段RNA。我们把不同病毒要扩增的目的片段构建在一起，形成嵌合体，并包装入病毒样颗粒内，这种病毒样颗粒就可以作为对同一个标本进行多个病毒的同时检测时可应用的多靶核酸标准品和质控品，既节省了成本，也减化了操作程序。
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公开(公告)号：CN117925787A
公开(公告)日：2024-04-26
申请号：CN202410066429.4
申请日：2024-01-17
Applicant: 北京医院
IPC: C12Q1/6841 , C12Q1/682
Abstract: 本发明涉及DNA荧光原位检测领域，提供一种基于“内‑外”双重信号放大的DCasFISH染色体多色原位成像系统，基于染色体本身串联重复序列的多拷贝特征用于“内部”信号放大，通过在sgRNA骨架序列中插入多个MS2 RNA适配体序列用于“外部”信号放大，建立了一种基于CRISPR/dCas9的“内‑外”双重信号放大系统，可用于染色体的快速、多色原位成像；本方法只需要使用一种dCas9蛋白、一种MS2‑sgRNA信号放大系统和多种颜色的MCP荧光蛋白，即可实现使用单一信号放大系统进行多色成像的目的，减少了多种蛋白和信号放大系统的设计成本；本发明的设计达到了使用“非酶”信号放大方法提高检测灵敏度的目的，可用于46条人类染色体特异性串联重复序列的原位检测，检测效率>90%，能够在3~4h内完成检测。
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公开(公告)号：CN114182018B
公开(公告)日：2023-10-03
申请号：CN202111555192.9
申请日：2021-12-17
Applicant: 北京医院
IPC: C12Q1/6886 , C12Q1/6869 , C12Q1/6806 , C12N15/85 , C12N5/10
Abstract: 本发明公开了一种肿瘤突变负荷检测的质控品及其制备方法，属于医学检验和生物技术领域。一种肿瘤突变负荷检测的质控品，以正常人源细胞为基础，采用基因编辑技术进行编辑，制备得到同时具有至少两个影响DNA复制修复功能的基因突变的超高肿瘤突变负荷细胞系；将制备得到的超高肿瘤突变负荷细胞系与基因编辑基础细胞系按比例进行混合、固定及石蜡包埋，制备成为模拟肿瘤组织FFPE样本类型且具有不同TMB水平的肿瘤突变负荷检测质控品。本发明质控品可长期持续获得，具有相同基因组背景的配对样本，适用于所有TMB检测方法，良好地模拟真实临床肿瘤样本，突变类型包含SNVs和Indels，覆盖同义突变和非同义突变，突变数量覆盖TMB高中低水平，满足多种应用目的。
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公开(公告)号：CN111172263A
公开(公告)日：2020-05-19
申请号：CN201811338459.7
申请日：2018-11-12
Applicant: 北京医院
IPC: C12Q1/6883 , C12Q1/6806 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种应用于无创产前检测的参考物质及其制备方法，属于临床检验学和生物技术领域。一种用于无创产前检测的模拟母亲cfDNA组分的制备方法，用DNA片段化因子酶切模拟母亲样本细胞系的细胞核，得到模拟母亲cfDNA(核酸短片段)组分。本发明得到的含有不同染色体非整倍体cfDNA片段与含正常染色体数目cfDNA片段混合制作的无创产前检测参考物质，提供了一种可用于制造室内质量控制和室间质量评价的参考物质的方法。这种利用不同酶消化产生的含不同染色体非整倍体cfDNA片段与含正常染色体数目cfDNA混合制作参考物质的方法在国内外尚属首例。这种方法也能用于制作一系列的用于其他无创检测的混合cfDNA样本参考物质。
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