基于“内-外”双重信号放大的DCasFISH染色体多色原位成像系统

    公开(公告)号:CN117925787A

    公开(公告)日:2024-04-26

    申请号:CN202410066429.4

    申请日:2024-01-17

    Applicant: 北京医院

    Abstract: 本发明涉及DNA荧光原位检测领域,提供一种基于“内‑外”双重信号放大的DCasFISH染色体多色原位成像系统,基于染色体本身串联重复序列的多拷贝特征用于“内部”信号放大,通过在sgRNA骨架序列中插入多个MS2 RNA适配体序列用于“外部”信号放大,建立了一种基于CRISPR/dCas9的“内‑外”双重信号放大系统,可用于染色体的快速、多色原位成像;本方法只需要使用一种dCas9蛋白、一种MS2‑sgRNA信号放大系统和多种颜色的MCP荧光蛋白,即可实现使用单一信号放大系统进行多色成像的目的,减少了多种蛋白和信号放大系统的设计成本;本发明的设计达到了使用“非酶”信号放大方法提高检测灵敏度的目的,可用于46条人类染色体特异性串联重复序列的原位检测,检测效率>90%,能够在3~4h内完成检测。

    一种肺癌检测质控品及其制备方法

    公开(公告)号:CN105441541A

    公开(公告)日:2016-03-30

    申请号:CN201510885855.1

    申请日:2015-12-04

    Applicant: 北京医院

    CPC classification number: C12Q1/6886 G01N33/57423

    Abstract: 本发明涉及一种肺癌检测质控品及其制备方法,属于临床检验学、病理学和生物技术领域。一种肺癌检测质控品,为肺癌细胞系H3122、肺癌细胞系H2228和肺癌细胞系H1299分别接种实验动物后生成的肿瘤组织的标本切片。本发明的创新点在于:本发明得到的肺癌异种瘤组织质控品可以长期保存在大多数的温度条件下,在室温和4℃环境保存两周后检测效果无变化,该质控品可以用于EQA和IQC,在将切片质控品作为EQA评估试验的质控品发放的时候,它可以在室温下无需冰袋进行邮寄并能长时间保存在-20℃或者-4℃条件下。

    基于双扩增放大和双LNA探针特异识别DNA突变的高灵敏检测方法

    公开(公告)号:CN117106865B

    公开(公告)日:2024-05-10

    申请号:CN202311061436.7

    申请日:2023-08-23

    Applicant: 北京医院

    Abstract: 本发明涉及DNA序列检测领域,公开了基于双扩增放大和双LNA探针特异识别DNA突变的高灵敏检测方法,步骤如下:步骤一:确定新建方法的核心反应原理,明确需评估的方法性能指标;步骤二:制备新建方法建立及验证的生物材料,包括引物、LNA探针、待测样本等;步骤三:建立新建方法的检测流程,优化新建方法的关键参数;步骤四:确定新建方法的检测阈值,评估新建方法的分析性能:包括分析敏感性、分析特异性、重复性等;步骤五:评估新建方法的临床应用价值,实现了基于双扩增放大和双LNA探针识别DNA突变的高灵敏检测新方法的建立,为DNA的灵敏、快速地检出提供技术基础,具有单核苷酸的分辨率,也可以提供技术思路,为DNA检测新技术的研发提供经验方法。

    生成自然界不存在的核酸序列的方法及其生成的核酸序列

    公开(公告)号:CN117912558A

    公开(公告)日:2024-04-19

    申请号:CN202410309191.3

    申请日:2024-03-19

    Abstract: 本申请涉及生成自然界不存在的核酸序列的方法及其生成的核酸序列。所生成的核酸序列用作通过聚合酶链式反应(PCR)检测目的核酸的外源内参序列,该方法包括通过计算机执行的以下步骤:生成第一数量的核酸序列,该核酸序列中的每一个包括N个碱基对,N是正整数;基于核酸序列的期望特性,对所生成的核酸序列进行筛选,获得筛选后的核酸序列;将筛选后的核酸序列组装为外源内参序列,所述外源内参序列包含将引物和探针进行连接获得的连接后的核酸序列,该引物包括正向引物和反向引物,且正向引物、反向引物和探针中的至少一者来自筛选后的核酸序列;以及基于连接后的核酸序列与已知的自然界的核酸序列进行比较,获得自然界不存在的核酸序列。

    一种基因变异检测质控物及其制备方法

    公开(公告)号:CN108342480B

    公开(公告)日:2022-03-01

    申请号:CN201810181583.0

    申请日:2018-03-05

    Applicant: 北京医院

    Abstract: 本发明涉及一种基因变异检测质控物及其制备方法,属于临床检验学和生物技术领域。一种基因变异检测质控物,为通过CRISPR/Cas介导的非同源末端连接的高效整合机制在染色体靶位插入含特定变异DNA序列的永生化细胞系。本发明的创新点在于:在核酸序列已知的情况下,本发明可以通过基因编辑制备获得含任意基因变异的细胞阳性质控物,适用于所有基于PCR扩增的基因突变检测的质量控制。制备过程简单、高效。

    基于内参基因的BCR-ABL1 p190融合基因检测溯源方法

    公开(公告)号:CN117604105B

    公开(公告)日:2024-04-30

    申请号:CN202410079511.0

    申请日:2024-01-19

    Applicant: 北京医院

    Abstract: 本发明涉及融合基因检测溯源技术领域,建立了一种基于内参基因的BCR‑ABL1 p190融合基因检测溯源方法,溯源方法包括内参基因ABL1检测方法的溯源;可溯源至参考质粒的p190质粒的制备;p190融合基因检测方法的溯源;建立的溯源方法可以将内参基因ABL1与p190融合基因检测的具体拷贝数以及p190融合基因/内参基因ABL1检测的比例都溯源至有证参考质粒,溯源过程中的线性关系曲线良好,R2与斜率都接近1。该溯源方法对于促进p190型融合基因检测的标准化具有重要意义。

    基于内参基因的BCR-ABL1 p190融合基因检测溯源方法

    公开(公告)号:CN117604105A

    公开(公告)日:2024-02-27

    申请号:CN202410079511.0

    申请日:2024-01-19

    Applicant: 北京医院

    Abstract: 本发明涉及融合基因检测溯源技术领域,建立了一种基于内参基因的BCR‑ABL1 p190融合基因检测溯源方法,溯源方法包括内参基因ABL1检测方法的溯源;可溯源至参考质粒的p190质粒的制备;p190融合基因检测方法的溯源;建立的溯源方法可以将内参基因ABL1与p190融合基因检测的具体拷贝数以及p190融合基因/内参基因ABL1检测的比例都溯源至有证参考质粒,溯源过程中的线性关系曲线良好,R2与斜率都接近1。该溯源方法对于促进p190型融合基因检测的标准化具有重要意义。

    基于双扩增放大和双LNA探针特异识别DNA突变的高灵敏检测方法

    公开(公告)号:CN117106865A

    公开(公告)日:2023-11-24

    申请号:CN202311061436.7

    申请日:2023-08-23

    Applicant: 北京医院

    Abstract: 本发明涉及DNA序列检测领域,公开了基于双扩增放大和双LNA探针特异识别DNA突变的高灵敏检测方法,步骤如下:步骤一:确定新建方法的核心反应原理,明确需评估的方法性能指标;步骤二:制备新建方法建立及验证的生物材料,包括引物、LNA探针、待测样本等;步骤三:建立新建方法的检测流程,优化新建方法的关键参数;步骤四:确定新建方法的检测阈值,评估新建方法的分析性能:包括分析敏感性、分析特异性、重复性等;步骤五:评估新建方法的临床应用价值,实现了基于双扩增放大和双LNA探针识别DNA突变的高灵敏检测新方法的建立,为DNA的灵敏、快速地检出提供技术基础,具有单核苷酸的分辨率,也可以提供技术思路,为DNA检测新技术的研发提供经验方法。

    生成自然界不存在的核酸序列的方法及其生成的核酸序列

    公开(公告)号:CN117912558B

    公开(公告)日:2024-12-31

    申请号:CN202410309191.3

    申请日:2024-03-19

    Abstract: 本申请涉及生成自然界不存在的核酸序列的方法及其生成的核酸序列。所生成的核酸序列用作通过聚合酶链式反应(PCR)检测目的核酸的外源内参序列,该方法包括通过计算机执行的以下步骤:生成第一数量的核酸序列,该核酸序列中的每一个包括N个碱基对,N是正整数;基于核酸序列的期望特性,对所生成的核酸序列进行筛选,获得筛选后的核酸序列;将筛选后的核酸序列组装为外源内参序列,所述外源内参序列包含将引物和探针进行连接获得的连接后的核酸序列,该引物包括正向引物和反向引物,且正向引物、反向引物和探针中的至少一者来自筛选后的核酸序列;以及基于连接后的核酸序列与已知的自然界的核酸序列进行比较,获得自然界不存在的核酸序列。

    一种肺癌检测质控品及其制备方法

    公开(公告)号:CN105441541B

    公开(公告)日:2022-04-29

    申请号:CN201510885855.1

    申请日:2015-12-04

    Applicant: 北京医院

    Abstract: 本发明涉及一种肺癌检测质控品及其制备方法,属于临床检验学、病理学和生物技术领域。一种肺癌检测质控品,为肺癌细胞系H3122、肺癌细胞系H2228和肺癌细胞系H1299分别接种实验动物后生成的肿瘤组织的标本切片。本发明的创新点在于:本发明得到的肺癌异种瘤组织质控品可以长期保存在大多数的温度条件下,在室温和4℃环境保存两周后检测效果无变化,该质控品可以用于EQA和IQC,在将切片质控品作为EQA评估试验的质控品发放的时候,它可以在室温下无需冰袋进行邮寄并能长时间保存在‑20℃或者‑4℃条件下。

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