一种黄曲霉在物种水平的鉴定方法及应用

    公开(公告)号:CN118600086A

    公开(公告)日:2024-09-06

    申请号:CN202410791988.1

    申请日:2024-06-19

    Abstract: 本发明公开了一种黄曲霉在物种水平的鉴定方法及应用。属于真菌物种鉴定技术领域。本发明方法筛选得到了黄曲霉物种特异靶标序列。本发明方法为黄曲霉构建了包含超过四百万个候选靶标序列库,选择的特异靶标序列具有种内高保守、种间特异性的特点,能够用于广泛物种、曲霉属近缘物种的物种水平的准确鉴定。本发明充分考虑种内变异的影响,优化了生信分析策略和流程,使分析结果能够在广泛物种范围内适用,而不仅限于分析范围内的物种鉴定,具有更广阔的应用前景。同时,测序作为序列识别的金标准,不仅证明了每条特异靶标序列在黄曲霉种内的保守性,同时与近缘物种米曲霉同源序列的差异也证明了序列的特异性。

    一种参与挥发性成分形成的类胡萝卜素裂解双加氧酶编码基因的筛选鉴定及应用

    公开(公告)号:CN113088498B

    公开(公告)日:2022-08-02

    申请号:CN202010017042.1

    申请日:2020-01-08

    Abstract: 本发明属于基因工程技术领域,涉及与挥发性成分形成密切相关的类胡萝卜素裂解双加氧酶LjCCD1b及其编码基因与功能。本发明公开了类胡萝卜素裂解双加氧酶LjCCD1b基因的开放阅读框序列以及其编码的氨基酸序列。基于金银花基因组和转录组数据,本发明筛选获得LjCCD1b基因,通过构建pET32a‑LjCCD1b原核表达载体,以β‑胡萝卜素、10′‑Apo‑β‑胡萝卜素醛和叶黄素为底物,体外鉴定LjCCD1b的催化功能。结果显示,LjCCD1b能够裂解β‑胡萝卜素和10′‑Apo‑β‑胡萝卜素醛生成β‑紫罗兰酮;催化叶黄素生成3‑羟基‑β‑紫罗兰酮和3‑羟基‑α‑紫罗兰酮。本发明揭示金银花中挥发性成分形成的内在分子机制,为金银花的香气成分调控及分子育种研究奠定基础。

    一种细辛属分子身份证及其应用

    公开(公告)号:CN112980988A

    公开(公告)日:2021-06-18

    申请号:CN202110277934.X

    申请日:2021-03-15

    Abstract: 本发明涉及分子生物学技术领域,具体涉及一种细辛属分子身份证及其应用。所述细辛属分子身份证中含有如SEQ ID NO.1或SEQ ID NO.1‑5所示的核苷酸序列。本发明还提供一种细辛属鉴定方法,包括通过检测高通量原始测序数据中是否含有如SEQ ID NO.1或SEQ ID NO.1‑5所示的核苷酸序列来判断混合样品中是否存在细辛属物种。利用本发明所提供的分子身份证和方法可以准确的鉴定细辛属,本发明所提供的方法适用性更广,可检测所有能提取出DNA的样品中是否含有细辛属物种。因此,能够实现细辛属原植物、药材、种子、种苗、粉末和食物混合品的快速、准确鉴定。

    一种参与金银花花色变化的类胡萝卜素裂解双加氧酶编码基因的筛选鉴定及应用

    公开(公告)号:CN112239764A

    公开(公告)日:2021-01-19

    申请号:CN201910639359.6

    申请日:2019-07-16

    Abstract: 本发明涉及了与金银花花色密切相关的类胡萝卜素裂解双加氧酶LjCCD4及其编码基因与功能。本发明属于基因工程技术领域。本发明公开了金银花类胡萝卜素裂解双加氧酶LjCCD4基因的开放阅读框序列以及其编码的氨基酸序列。本发明基于金银花基因组和转录组数据筛选获得LjCCD4基因,通过构建pET32a‑LjCCD4原核表达载体,以β‑胡萝卜素和叶黄素为底物在体外鉴定LjCCD4的催化机制。LjCCD4能够催化β‑胡萝卜素和叶黄素分别生成10’‑Apo‑β‑胡萝卜素醛、β‑紫罗兰酮和3‑羟基‑10’‑Apo‑β‑胡萝卜素醛、3‑OH‑10’‑Apo‑α‑胡萝卜素醛、3‑羟基‑β‑紫罗兰酮、3‑羟基‑α‑紫罗兰酮。本发明揭示金银花中类胡萝卜素类色素降解及其花色变化的内在分子机制,为金银花的花期调控及分子育种等奠定基础。

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