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公开(公告)号:CN106399475B
公开(公告)日:2019-06-04
申请号:CN201610740314.4
申请日:2016-08-26
Applicant: 中国医学科学院药用植物研究所 , 浙江天皇药业有限公司
IPC: C12Q1/6895 , C12Q1/6806 , C12N15/10
Abstract: 本发明公开了一种获取rDNA ITS2序列用来对铁皮枫斗进行鉴定的方法,提供了用于铁皮枫斗鉴定的标准序列,可有效解决铁皮枫斗药材分子鉴定问题。具体步骤如下:(1)设计两对引物对ITS2序列分段进行PCR扩增;(2)对扩增结果测序后,按重叠区域连接在一起,获得ITS2序列;(3)与本发明标准序列SEQ ID No.1比对,序列相似性大于或等于99%,则鉴定为铁皮石斛。本发明能够实现铁皮枫斗药材、基原植物、种子种苗等的快速、准确鉴定。
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公开(公告)号:CN106399474B
公开(公告)日:2019-06-04
申请号:CN201610740265.4
申请日:2016-08-29
Applicant: 中国医学科学院药用植物研究所 , 浙江天皇药业有限公司
IPC: C12Q1/6895 , C12N15/10
Abstract: 本发明公开了一种名贵中药铁皮石斛干药材分子鉴定方法及其应用,可有效解决铁皮石斛干药材快速鉴定问题。具体步骤如下:(1)以改良的DNA提取方法制备待测样品DNA模板;(2)通过特异的PCR扩增引物和反应参数,扩增样品rDNA ITS2片段;(3)对扩增产物进行测序,获得铁皮石斛干药材的ITS2序列;(4)构建样品的ITS2序列NJ树。本发明能够实现铁皮石斛干药材、基原植物、种子种苗等的快速、准确鉴定。
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公开(公告)号:CN106399475A
公开(公告)日:2017-02-15
申请号:CN201610740314.4
申请日:2016-08-26
Applicant: 中国医学科学院药用植物研究所 , 浙江天皇药业有限公司
CPC classification number: C12Q1/6895 , C12Q1/6806 , C12Q2600/13 , C12Q2531/113
Abstract: 本发明公开了一种获取rDNA ITS2序列用来对铁皮枫斗进行鉴定的方法,提供了用于铁皮枫斗鉴定的标准序列,可有效解决铁皮枫斗药材分子鉴定问题。具体步骤如下:(1)设计两对引物对ITS2序列分段进行PCR扩增;(2)对扩增结果测序后,按重叠区域连接在一起,获得ITS2序列;(3)与本发明标准序列SEQ ID No.1比对,序列相似性大于或等于99%,则鉴定为铁皮石斛。本发明能够实现铁皮枫斗药材、基原植物、种子种苗等的快速、准确鉴定。
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公开(公告)号:CN106399474A
公开(公告)日:2017-02-15
申请号:CN201610740265.4
申请日:2016-08-29
Applicant: 中国医学科学院药用植物研究所 , 浙江天皇药业有限公司
CPC classification number: C12Q1/6895 , C12Q1/6806
Abstract: 本发明公开了一种名贵中药铁皮石斛干药材分子鉴定方法及其应用,可有效解决铁皮石斛干药材快速鉴定问题。具体步骤如下:(1)以改良的DNA提取方法制备待测样品DNA模板;(2)通过特异的PCR扩增引物和反应参数,扩增样品rDNA ITS2片段;(3)对扩增产物进行测序,获得铁皮石斛干药材的ITS2序列;(4)构建样品的ITS2序列NJ树。本发明能够实现铁皮石斛干药材、基原植物、种子种苗等的快速、准确鉴定。
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公开(公告)号:CN118345184B
公开(公告)日:2025-05-20
申请号:CN202410528276.0
申请日:2023-03-03
Applicant: 中国医学科学院药用植物研究所
IPC: C12Q1/6895 , C12Q1/686 , C12Q1/6869 , C12N15/11
Abstract: 本申请公开了一种基于时珍法的大黄鉴定方法及应用,其中,利用中药基原物种的核、叶绿体和线粒体基因组得到标准特异性靶标序列,从而能够基于所述标准特异性靶标序列实现对待检测样品的物种鉴定。时珍法可筛选获得判定任意待检测中药样品与指定中药基原物种同一性的标准特异性靶标序列,消除了脱靶等失误风险,由此,时珍法可准确判定任意待检测中药样品与指定中药基原物种的同一性。
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公开(公告)号:CN118600086A
公开(公告)日:2024-09-06
申请号:CN202410791988.1
申请日:2024-06-19
Applicant: 中国医学科学院药用植物研究所
IPC: C12Q1/6895 , C12Q1/6869 , C12N15/11 , C12R1/67
Abstract: 本发明公开了一种黄曲霉在物种水平的鉴定方法及应用。属于真菌物种鉴定技术领域。本发明方法筛选得到了黄曲霉物种特异靶标序列。本发明方法为黄曲霉构建了包含超过四百万个候选靶标序列库,选择的特异靶标序列具有种内高保守、种间特异性的特点,能够用于广泛物种、曲霉属近缘物种的物种水平的准确鉴定。本发明充分考虑种内变异的影响,优化了生信分析策略和流程,使分析结果能够在广泛物种范围内适用,而不仅限于分析范围内的物种鉴定,具有更广阔的应用前景。同时,测序作为序列识别的金标准,不仅证明了每条特异靶标序列在黄曲霉种内的保守性,同时与近缘物种米曲霉同源序列的差异也证明了序列的特异性。
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公开(公告)号:CN116287416B
公开(公告)日:2024-03-15
申请号:CN202310362523.X
申请日:2023-04-06
Applicant: 中国医学科学院药用植物研究所
IPC: C12Q1/6895 , C12Q1/6806 , C12N15/11
Abstract: 本发明涉及一种基于时珍法的真菌物种鉴定方法及利用该方法开发的用于真菌物种鉴定的物种特异性靶标核苷酸、引物对或试剂盒。本发明能够用于对真菌样品或者含真菌的材料进行物种鉴定、区分真菌近缘物种、区分致病真菌及其易混淆真菌、区分真菌不同株系、或者用于药材或食品的安全监测或临床检测。采用本发明所述的方法或试剂盒进行物种鉴定时,具有特异性强、灵敏度高、重复性好、可不需要依靠大型专业仪器来实现真菌样品的物种的快速鉴定等优点,因此可具有广阔的应用前景。
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公开(公告)号:CN113088498B
公开(公告)日:2022-08-02
申请号:CN202010017042.1
申请日:2020-01-08
Applicant: 中国医学科学院药用植物研究所
Abstract: 本发明属于基因工程技术领域,涉及与挥发性成分形成密切相关的类胡萝卜素裂解双加氧酶LjCCD1b及其编码基因与功能。本发明公开了类胡萝卜素裂解双加氧酶LjCCD1b基因的开放阅读框序列以及其编码的氨基酸序列。基于金银花基因组和转录组数据,本发明筛选获得LjCCD1b基因,通过构建pET32a‑LjCCD1b原核表达载体,以β‑胡萝卜素、10′‑Apo‑β‑胡萝卜素醛和叶黄素为底物,体外鉴定LjCCD1b的催化功能。结果显示,LjCCD1b能够裂解β‑胡萝卜素和10′‑Apo‑β‑胡萝卜素醛生成β‑紫罗兰酮;催化叶黄素生成3‑羟基‑β‑紫罗兰酮和3‑羟基‑α‑紫罗兰酮。本发明揭示金银花中挥发性成分形成的内在分子机制,为金银花的香气成分调控及分子育种研究奠定基础。
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公开(公告)号:CN112980988A
公开(公告)日:2021-06-18
申请号:CN202110277934.X
申请日:2021-03-15
Applicant: 中国医学科学院药用植物研究所
IPC: C12Q1/6895 , C12N15/11
Abstract: 本发明涉及分子生物学技术领域,具体涉及一种细辛属分子身份证及其应用。所述细辛属分子身份证中含有如SEQ ID NO.1或SEQ ID NO.1‑5所示的核苷酸序列。本发明还提供一种细辛属鉴定方法,包括通过检测高通量原始测序数据中是否含有如SEQ ID NO.1或SEQ ID NO.1‑5所示的核苷酸序列来判断混合样品中是否存在细辛属物种。利用本发明所提供的分子身份证和方法可以准确的鉴定细辛属,本发明所提供的方法适用性更广,可检测所有能提取出DNA的样品中是否含有细辛属物种。因此,能够实现细辛属原植物、药材、种子、种苗、粉末和食物混合品的快速、准确鉴定。
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公开(公告)号:CN112239764A
公开(公告)日:2021-01-19
申请号:CN201910639359.6
申请日:2019-07-16
Applicant: 中国医学科学院药用植物研究所
Abstract: 本发明涉及了与金银花花色密切相关的类胡萝卜素裂解双加氧酶LjCCD4及其编码基因与功能。本发明属于基因工程技术领域。本发明公开了金银花类胡萝卜素裂解双加氧酶LjCCD4基因的开放阅读框序列以及其编码的氨基酸序列。本发明基于金银花基因组和转录组数据筛选获得LjCCD4基因,通过构建pET32a‑LjCCD4原核表达载体,以β‑胡萝卜素和叶黄素为底物在体外鉴定LjCCD4的催化机制。LjCCD4能够催化β‑胡萝卜素和叶黄素分别生成10’‑Apo‑β‑胡萝卜素醛、β‑紫罗兰酮和3‑羟基‑10’‑Apo‑β‑胡萝卜素醛、3‑OH‑10’‑Apo‑α‑胡萝卜素醛、3‑羟基‑β‑紫罗兰酮、3‑羟基‑α‑紫罗兰酮。本发明揭示金银花中类胡萝卜素类色素降解及其花色变化的内在分子机制,为金银花的花期调控及分子育种等奠定基础。
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