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公开(公告)号:CN115843318A
公开(公告)日:2023-03-24
申请号:CN202180026003.0
申请日:2021-12-14
Applicant: 中国医学科学院药用植物研究所
IPC: C12Q1/6895 , C12Q1/686 , C12Q1/6816
Abstract: 本发明公开了一种基于全基因组分析与基因组编辑的植物物种鉴定方法与应用,即GAGE法(Genome Analysis and Genome Editing),所述方法具体包括:筛选待鉴定植物全基因组中带有PAM的序列,将其与混伪品及密切相关物种的基因组比对后选择仅存在于待鉴定植物基因组中的序列作为靶标序列,引入基因组编辑系统对其进行检测,根据所选靶标序列设计并合成crRNA(CRISPR RNA),crRNA引导Cas蛋白与靶标序列结合形成复合体,之后Cas蛋白反式切割活性被激活并切割带有荧光信号基团的单链DNA,通过检测荧光信号鉴定植物物种。
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公开(公告)号:CN118345184B
公开(公告)日:2025-05-20
申请号:CN202410528276.0
申请日:2023-03-03
Applicant: 中国医学科学院药用植物研究所
IPC: C12Q1/6895 , C12Q1/686 , C12Q1/6869 , C12N15/11
Abstract: 本申请公开了一种基于时珍法的大黄鉴定方法及应用,其中,利用中药基原物种的核、叶绿体和线粒体基因组得到标准特异性靶标序列,从而能够基于所述标准特异性靶标序列实现对待检测样品的物种鉴定。时珍法可筛选获得判定任意待检测中药样品与指定中药基原物种同一性的标准特异性靶标序列,消除了脱靶等失误风险,由此,时珍法可准确判定任意待检测中药样品与指定中药基原物种的同一性。
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公开(公告)号:CN118600086A
公开(公告)日:2024-09-06
申请号:CN202410791988.1
申请日:2024-06-19
Applicant: 中国医学科学院药用植物研究所
IPC: C12Q1/6895 , C12Q1/6869 , C12N15/11 , C12R1/67
Abstract: 本发明公开了一种黄曲霉在物种水平的鉴定方法及应用。属于真菌物种鉴定技术领域。本发明方法筛选得到了黄曲霉物种特异靶标序列。本发明方法为黄曲霉构建了包含超过四百万个候选靶标序列库,选择的特异靶标序列具有种内高保守、种间特异性的特点,能够用于广泛物种、曲霉属近缘物种的物种水平的准确鉴定。本发明充分考虑种内变异的影响,优化了生信分析策略和流程,使分析结果能够在广泛物种范围内适用,而不仅限于分析范围内的物种鉴定,具有更广阔的应用前景。同时,测序作为序列识别的金标准,不仅证明了每条特异靶标序列在黄曲霉种内的保守性,同时与近缘物种米曲霉同源序列的差异也证明了序列的特异性。
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公开(公告)号:CN116287416B
公开(公告)日:2024-03-15
申请号:CN202310362523.X
申请日:2023-04-06
Applicant: 中国医学科学院药用植物研究所
IPC: C12Q1/6895 , C12Q1/6806 , C12N15/11
Abstract: 本发明涉及一种基于时珍法的真菌物种鉴定方法及利用该方法开发的用于真菌物种鉴定的物种特异性靶标核苷酸、引物对或试剂盒。本发明能够用于对真菌样品或者含真菌的材料进行物种鉴定、区分真菌近缘物种、区分致病真菌及其易混淆真菌、区分真菌不同株系、或者用于药材或食品的安全监测或临床检测。采用本发明所述的方法或试剂盒进行物种鉴定时,具有特异性强、灵敏度高、重复性好、可不需要依靠大型专业仪器来实现真菌样品的物种的快速鉴定等优点,因此可具有广阔的应用前景。
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公开(公告)号:CN118345184A
公开(公告)日:2024-07-16
申请号:CN202410528276.0
申请日:2023-03-03
Applicant: 中国医学科学院药用植物研究所
IPC: C12Q1/6895 , C12Q1/686 , C12Q1/6869 , C12N15/11
Abstract: 本申请公开了一种基于时珍法的大黄鉴定方法及应用,其中,利用中药基原物种的核、叶绿体和线粒体基因组得到标准特异性靶标序列,从而能够基于所述标准特异性靶标序列实现对待检测样品的物种鉴定。时珍法可筛选获得判定任意待检测中药样品与指定中药基原物种同一性的标准特异性靶标序列,消除了脱靶等失误风险,由此,时珍法可准确判定任意待检测中药样品与指定中药基原物种的同一性。
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公开(公告)号:CN115843318B
公开(公告)日:2023-07-18
申请号:CN202180026003.0
申请日:2021-12-14
Applicant: 中国医学科学院药用植物研究所
IPC: C12Q1/6895 , C12Q1/686 , C12Q1/6816
Abstract: 本发明公开了一种基于全基因组分析与基因组编辑的植物物种鉴定方法与应用,即GAGE法(Genome Analysis and Genome Editing),所述方法具体包括:筛选待鉴定植物全基因组中带有PAM的序列,将其与混伪品及密切相关物种的基因组比对后选择仅存在于待鉴定植物基因组中的序列作为靶标序列,引入基因组编辑系统对其进行检测,根据所选靶标序列设计并合成crRNA(CRISPR RNA),crRNA引导Cas蛋白与靶标序列结合形成复合体,之后Cas蛋白反式切割活性被激活并切割带有荧光信号基团的单链DNA,通过检测荧光信号鉴定植物物种。
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公开(公告)号:CN116083602B
公开(公告)日:2023-10-24
申请号:CN202310030583.1
申请日:2023-01-10
Applicant: 中国医学科学院药用植物研究所
IPC: C12Q1/6888 , C12N15/11 , C12Q1/686 , C12Q1/6844
Abstract: 本申请公开了基于时珍法的用于鹿科动物鉴定的物种特异性靶标序列、引物对、试剂盒、它们的应用及物种鉴定方法,其中,基于通过时珍法筛选得到的鹿科动物的物种特异性靶标序列,实现了对待检测样品的物种鉴定。本发明的物种鉴定方法特异性强,灵敏度高,重复性好,可实现物种的快速鉴定,具有广阔的应用前景。
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公开(公告)号:CN116287416A
公开(公告)日:2023-06-23
申请号:CN202310362523.X
申请日:2023-04-06
Applicant: 中国医学科学院药用植物研究所
IPC: C12Q1/6895 , C12Q1/6806 , C12N15/11
Abstract: 本发明涉及一种基于时珍法的真菌物种鉴定方法及利用该方法开发的用于真菌物种鉴定的物种特异性靶标核苷酸、引物对或试剂盒。本发明能够用于对真菌样品或者含真菌的材料进行物种鉴定、区分真菌近缘物种、区分致病真菌及其易混淆真菌、区分真菌不同株系、或者用于药材或食品的安全监测或临床检测。采用本发明所述的方法或试剂盒进行物种鉴定时,具有特异性强、灵敏度高、重复性好、可不需要依靠大型专业仪器来实现真菌样品的物种的快速鉴定等优点,因此可具有广阔的应用前景。
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公开(公告)号:CN116083602A
公开(公告)日:2023-05-09
申请号:CN202310030583.1
申请日:2023-01-10
Applicant: 中国医学科学院药用植物研究所
IPC: C12Q1/6888 , C12N15/11 , C12Q1/686 , C12Q1/6844
Abstract: 本申请公开了基于时珍法的用于鹿科动物鉴定的物种特异性靶标序列、引物对、试剂盒、它们的应用及物种鉴定方法,其中,基于通过时珍法筛选得到的鹿科动物的物种特异性靶标序列,实现了对待检测样品的物种鉴定。本发明的物种鉴定方法特异性强,灵敏度高,重复性好,可实现物种的快速鉴定,具有广阔的应用前景。
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公开(公告)号:CN115087750B
公开(公告)日:2023-05-02
申请号:CN202280002592.3
申请日:2022-03-30
Applicant: 中国医学科学院药用植物研究所
IPC: C12Q1/6895 , C12Q1/6888 , C12Q1/6806 , C12Q1/6844 , C12Q1/6869 , C12N15/11 , C12R1/645
Abstract: 本申请公开了一种基于全基因组分析的真核生物样品的物种鉴定方法及其应用,其中,通过筛选得到的物种特异性靶标序列,实现了对待检测样品的物种鉴定。本发明的物种鉴定方法特异性强,灵敏度高,重复性好,可不需要依靠大型专业仪器来实现物种的快速鉴定,因此,具有广阔的应用前景。
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