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公开(公告)号：CN115843318A
公开(公告)日：2023-03-24
申请号：CN202180026003.0
申请日：2021-12-14
Applicant: 中国医学科学院药用植物研究所
IPC: C12Q1/6895 , C12Q1/686 , C12Q1/6816
Abstract: 本发明公开了一种基于全基因组分析与基因组编辑的植物物种鉴定方法与应用，即GAGE法(Genome Analysis and Genome Editing)，所述方法具体包括：筛选待鉴定植物全基因组中带有PAM的序列，将其与混伪品及密切相关物种的基因组比对后选择仅存在于待鉴定植物基因组中的序列作为靶标序列，引入基因组编辑系统对其进行检测，根据所选靶标序列设计并合成crRNA(CRISPR RNA)，crRNA引导Cas蛋白与靶标序列结合形成复合体，之后Cas蛋白反式切割活性被激活并切割带有荧光信号基团的单链DNA，通过检测荧光信号鉴定植物物种。
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公开(公告)号：CN114350843A
公开(公告)日：2022-04-15
申请号：CN202210046294.6
申请日：2022-01-17
Applicant: 中国医学科学院药用植物研究所
IPC: C12Q1/6895 , C12Q1/686 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了用于鉴别木通及其两种混伪品的微滴数字PCR方法及应用。基于木通及其常见混伪品关木通和川木通的ITS2序列分别设计特异性引物和TaqMan探针，开发单重和三重微滴数字PCR技术。单重微滴数字PCR技术能够分别特异性检测木通、川木通和关木通，三重微滴数字PCR技术可以一次性在同一PCR反应体系中同时检测三种药材，不同引物组之间没有相互干扰，可用于市售木通药材及相关中成药检测。所述特异性引物和TaqMan探针为SEQ ID No.1‑9所示序列。该方法特异性强，灵敏度高，适用于痕量DNA的检测，可为中药质量控制和市场监管提供依据，保证中药安全性及有效性。
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公开(公告)号：CN113897415A
公开(公告)日：2022-01-07
申请号：CN202111223899.X
申请日：2021-10-21
Applicant: 中国医学科学院药用植物研究所
IPC: C12Q1/6806 , C12Q1/6895 , C12N15/11
Abstract: 本发明涉及大黄药材三个基原物种的鉴别及其应用，具体包括基于叶绿体基因组筛选高变区，以筛选的高变区rps16‑trnQ、psaA‑ycf3、psbE‑petL、ndhF‑rpl32与trnT‑trnL序列为模板设计引物1F/1R、2F/2R、3F/3R、4F/4R和5F/5R，并对42份样本进行PCR扩增，Sanger测序后利用MEGA7.0评价所筛选序列的物种鉴定能力，确定能够用于鉴定唐古特大黄、药用大黄与掌叶大黄的特异DNA条形码。本发明公开可有效扩增高变区rps16‑trnQ、psaA‑ycf3、psbE‑petL、ndhF‑rpl32与trnT‑trnL的5对通用引物，可用于大黄药材三个基原物种原植物、种子及药材的鉴定，为大黄药材三个基原物种分类鉴定、保证大黄药材临床用药安全及规范大黄药材市场提供依据。
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公开(公告)号：CN104304004A
公开(公告)日：2015-01-28
申请号：CN201410482874.5
申请日：2014-09-22
Applicant: 中国医学科学院药用植物研究所
IPC: A01H4/00
Abstract: 本发明旨在提供一种北缬草(Valeriana fauriei Briq.)组织培养繁殖方法。具体如下：一、用北缬草幼嫩的茎段作外植体，进行无菌处理；二、取无菌的北缬草的茎段置于固体培养基上诱导出不定芽；三、诱导出的不定芽接种到固体培养基上进行生根和壮苗；四、组培苗移栽至培养基质中炼苗培育。本发明不受自然条件的限制和影响，具有快速和易规模化的特点。本发明可以缓解野生北缬草资源紧缺和过度采挖破坏生态平衡的问题。
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公开(公告)号：CN118345184B
公开(公告)日：2025-05-20
申请号：CN202410528276.0
申请日：2023-03-03
Applicant: 中国医学科学院药用植物研究所
IPC: C12Q1/6895 , C12Q1/686 , C12Q1/6869 , C12N15/11
Abstract: 本申请公开了一种基于时珍法的大黄鉴定方法及应用，其中，利用中药基原物种的核、叶绿体和线粒体基因组得到标准特异性靶标序列，从而能够基于所述标准特异性靶标序列实现对待检测样品的物种鉴定。时珍法可筛选获得判定任意待检测中药样品与指定中药基原物种同一性的标准特异性靶标序列，消除了脱靶等失误风险，由此，时珍法可准确判定任意待检测中药样品与指定中药基原物种的同一性。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN118600086A
公开(公告)日：2024-09-06
申请号：CN202410791988.1
申请日：2024-06-19
Applicant: 中国医学科学院药用植物研究所
IPC: C12Q1/6895 , C12Q1/6869 , C12N15/11 , C12R1/67
Abstract: 本发明公开了一种黄曲霉在物种水平的鉴定方法及应用。属于真菌物种鉴定技术领域。本发明方法筛选得到了黄曲霉物种特异靶标序列。本发明方法为黄曲霉构建了包含超过四百万个候选靶标序列库，选择的特异靶标序列具有种内高保守、种间特异性的特点，能够用于广泛物种、曲霉属近缘物种的物种水平的准确鉴定。本发明充分考虑种内变异的影响，优化了生信分析策略和流程，使分析结果能够在广泛物种范围内适用，而不仅限于分析范围内的物种鉴定，具有更广阔的应用前景。同时，测序作为序列识别的金标准，不仅证明了每条特异靶标序列在黄曲霉种内的保守性，同时与近缘物种米曲霉同源序列的差异也证明了序列的特异性。
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公开(公告)号：CN116287416B
公开(公告)日：2024-03-15
申请号：CN202310362523.X
申请日：2023-04-06
Applicant: 中国医学科学院药用植物研究所
IPC: C12Q1/6895 , C12Q1/6806 , C12N15/11
Abstract: 本发明涉及一种基于时珍法的真菌物种鉴定方法及利用该方法开发的用于真菌物种鉴定的物种特异性靶标核苷酸、引物对或试剂盒。本发明能够用于对真菌样品或者含真菌的材料进行物种鉴定、区分真菌近缘物种、区分致病真菌及其易混淆真菌、区分真菌不同株系、或者用于药材或食品的安全监测或临床检测。采用本发明所述的方法或试剂盒进行物种鉴定时，具有特异性强、灵敏度高、重复性好、可不需要依靠大型专业仪器来实现真菌样品的物种的快速鉴定等优点，因此可具有广阔的应用前景。
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公开(公告)号：CN106498050A
公开(公告)日：2017-03-15
申请号：CN201610922312.7
申请日：2016-10-25
Applicant: 中国医学科学院药用植物研究所
IPC: C12Q1/68
CPC classification number: C12Q1/6869 , C12Q2531/113 , C12Q2563/185
Abstract: 本发明公开了一种基于SMRT的中成药生物物种组成成分监测方法，其包括如下步骤：1)提取待检样品基因组DNA；2)以上述DNA为模板，扩增其ITS2序列和psbA-trnH序列；3)基于Pacbio RSII测序平台，依照该平台标准操作流程，对上述PCR产物进行文库构建，并进行SMRT测序；4)应用SMRT Analysis Server 2.3.0软件对原始数据进行过滤，并基于RS_ReadsOfInsert.1操作流程获得环状一致性序列(circular-consensus sequencing，CCS)，用CD-HIT软件将CCS序列进行聚类，最终获得可用于后续分析的ITS2和psbA-trnH序列；5)将上述序列放入中药材DNA条形码鉴定系统(http：//www.tcmbarcode.cn/china/)，进行BLAST比对，获得物种鉴定结果。本发明能够实现对中成药生物物种组成成分的监测。
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公开(公告)号：CN104304004B
公开(公告)日：2017-01-11
申请号：CN201410482874.5
申请日：2014-09-22
Applicant: 中国医学科学院药用植物研究所
IPC: A01H4/00
Abstract: 本发明旨在提供一种北缬草(Valeriana fauriei Briq.)组织培养繁殖方法。具体如下：一、用北缬草幼嫩的茎段作外植体，进行无菌处理；二、取无菌的北缬草的茎段置于固体培养基上诱导出不定芽；三、诱导出的不定芽接种到固体培养基上进行生根和壮苗；四、组培苗移栽至培养基质中炼苗培育。本发明不受自然条件的限制和影响，具有快速和易规模化的特点。本发明可以缓解野生北缬草资源紧缺和过度采挖破坏生态平衡的问题。
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公开(公告)号：CN104878114A
公开(公告)日：2015-09-02
申请号：CN201510330543.4
申请日：2015-06-16
Applicant: 中国医学科学院药用植物研究所
CPC classification number: C12Q1/6895 , C12Q1/686 , C12Q1/6869 , C12Q2563/185 , C12Q2565/125
Abstract: 本发明公开了滇鸡血藤药材DNA条形码标准序列和滇鸡血藤药材快速分子鉴定的方法，其特征在于所述DNA条形码标准检测基因为叶绿体trnH-psbA基因，具有基因序列SEQ ID NO.1。该方法可以为滇鸡血藤药材提供分子身份证，从而对其进行准确快速的鉴定。该方法主要流程包括：滇鸡血藤实验样本首先由形态学专家鉴定，DNA分离提取及PCR扩增、测序，测序结果通过手工校对、序列拼接，所得序列与对照药材的序列进行比对，以确保结果的可靠性。本发明采用传统的形态学鉴定与分子鉴定相结合，可确保物种鉴定的准确性和可靠性。本发明提供的滇鸡血藤的DNA条形码标准基因序列及方法能够实现滇鸡血藤药材的快速准确鉴定，缩短鉴定时间。
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