公开(公告)号：CN118345184B

公开(公告)日：2025-05-20

申请号：CN202410528276.0

申请日：2023-03-03

Applicant: 中国医学科学院药用植物研究所

Inventor： 宋经元 ,  郝利军 ,  许文杰 ,  齐桂红 ,  甘雨桐 ,  辛天怡

IPC: C12Q1/6895 ,  C12Q1/686 ,  C12Q1/6869 ,  C12N15/11

Abstract: 本申请公开了一种基于时珍法的大黄鉴定方法及应用，其中，利用中药基原物种的核、叶绿体和线粒体基因组得到标准特异性靶标序列，从而能够基于所述标准特异性靶标序列实现对待检测样品的物种鉴定。时珍法可筛选获得判定任意待检测中药样品与指定中药基原物种同一性的标准特异性靶标序列，消除了脱靶等失误风险，由此，时珍法可准确判定任意待检测中药样品与指定中药基原物种的同一性。

公开(公告)号：CN118600086A

公开(公告)日：2024-09-06

申请号：CN202410791988.1

申请日：2024-06-19

Applicant: 中国医学科学院药用植物研究所

Inventor： 宋经元 ,  齐桂红 ,  许文杰 ,  甘雨桐 ,  黄远浩 ,  辛天怡

IPC: C12Q1/6895 ,  C12Q1/6869 ,  C12N15/11 ,  C12R1/67

Abstract: 本发明公开了一种黄曲霉在物种水平的鉴定方法及应用。属于真菌物种鉴定技术领域。本发明方法筛选得到了黄曲霉物种特异靶标序列。本发明方法为黄曲霉构建了包含超过四百万个候选靶标序列库，选择的特异靶标序列具有种内高保守、种间特异性的特点，能够用于广泛物种、曲霉属近缘物种的物种水平的准确鉴定。本发明充分考虑种内变异的影响，优化了生信分析策略和流程，使分析结果能够在广泛物种范围内适用，而不仅限于分析范围内的物种鉴定，具有更广阔的应用前景。同时，测序作为序列识别的金标准，不仅证明了每条特异靶标序列在黄曲霉种内的保守性，同时与近缘物种米曲霉同源序列的差异也证明了序列的特异性。

公开(公告)号：CN116287416B

公开(公告)日：2024-03-15

申请号：CN202310362523.X

申请日：2023-04-06

Applicant: 中国医学科学院药用植物研究所

Inventor： 宋经元 ,  齐桂红 ,  郝利军 ,  甘雨桐 ,  许文杰 ,  辛天怡

IPC: C12Q1/6895 ,  C12Q1/6806 ,  C12N15/11

Abstract: 本发明涉及一种基于时珍法的真菌物种鉴定方法及利用该方法开发的用于真菌物种鉴定的物种特异性靶标核苷酸、引物对或试剂盒。本发明能够用于对真菌样品或者含真菌的材料进行物种鉴定、区分真菌近缘物种、区分致病真菌及其易混淆真菌、区分真菌不同株系、或者用于药材或食品的安全监测或临床检测。采用本发明所述的方法或试剂盒进行物种鉴定时，具有特异性强、灵敏度高、重复性好、可不需要依靠大型专业仪器来实现真菌样品的物种的快速鉴定等优点，因此可具有广阔的应用前景。

公开(公告)号：CN113088498B

公开(公告)日：2022-08-02

申请号：CN202010017042.1

申请日：2020-01-08

Applicant: 中国医学科学院药用植物研究所

Inventor： 宋经元 ,  浦香东 ,  徐志超

IPC: C12N9/02 ,  C12N15/53 ,  C12P7/26

Abstract: 本发明属于基因工程技术领域，涉及与挥发性成分形成密切相关的类胡萝卜素裂解双加氧酶LjCCD1b及其编码基因与功能。本发明公开了类胡萝卜素裂解双加氧酶LjCCD1b基因的开放阅读框序列以及其编码的氨基酸序列。基于金银花基因组和转录组数据，本发明筛选获得LjCCD1b基因，通过构建pET32a‑LjCCD1b原核表达载体，以β‑胡萝卜素、10′‑Apo‑β‑胡萝卜素醛和叶黄素为底物，体外鉴定LjCCD1b的催化功能。结果显示，LjCCD1b能够裂解β‑胡萝卜素和10′‑Apo‑β‑胡萝卜素醛生成β‑紫罗兰酮；催化叶黄素生成3‑羟基‑β‑紫罗兰酮和3‑羟基‑α‑紫罗兰酮。本发明揭示金银花中挥发性成分形成的内在分子机制，为金银花的香气成分调控及分子育种研究奠定基础。

公开(公告)号：CN112980988A

公开(公告)日：2021-06-18

申请号：CN202110277934.X

申请日：2021-03-15

Applicant: 中国医学科学院药用植物研究所

Inventor： 韩建萍 ,  白璇姣 ,  王刚 ,  宋经元

IPC: C12Q1/6895 ,  C12N15/11

Abstract: 本发明涉及分子生物学技术领域，具体涉及一种细辛属分子身份证及其应用。所述细辛属分子身份证中含有如SEQ ID NO.1或SEQ ID NO.1‑5所示的核苷酸序列。本发明还提供一种细辛属鉴定方法，包括通过检测高通量原始测序数据中是否含有如SEQ ID NO.1或SEQ ID NO.1‑5所示的核苷酸序列来判断混合样品中是否存在细辛属物种。利用本发明所提供的分子身份证和方法可以准确的鉴定细辛属，本发明所提供的方法适用性更广，可检测所有能提取出DNA的样品中是否含有细辛属物种。因此，能够实现细辛属原植物、药材、种子、种苗、粉末和食物混合品的快速、准确鉴定。

公开(公告)号：CN112239764A

公开(公告)日：2021-01-19

申请号：CN201910639359.6

申请日：2019-07-16

Applicant: 中国医学科学院药用植物研究所

Inventor： 宋经元 ,  浦香东 ,  徐志超

IPC: C12N15/53 ,  C12N9/02 ,  C12N15/82 ,  A01H5/02 ,  A01H6/00

Abstract: 本发明涉及了与金银花花色密切相关的类胡萝卜素裂解双加氧酶LjCCD4及其编码基因与功能。本发明属于基因工程技术领域。本发明公开了金银花类胡萝卜素裂解双加氧酶LjCCD4基因的开放阅读框序列以及其编码的氨基酸序列。本发明基于金银花基因组和转录组数据筛选获得LjCCD4基因，通过构建pET32a‑LjCCD4原核表达载体，以β‑胡萝卜素和叶黄素为底物在体外鉴定LjCCD4的催化机制。LjCCD4能够催化β‑胡萝卜素和叶黄素分别生成10’‑Apo‑β‑胡萝卜素醛、β‑紫罗兰酮和3‑羟基‑10’‑Apo‑β‑胡萝卜素醛、3‑OH‑10’‑Apo‑α‑胡萝卜素醛、3‑羟基‑β‑紫罗兰酮、3‑羟基‑α‑紫罗兰酮。本发明揭示金银花中类胡萝卜素类色素降解及其花色变化的内在分子机制，为金银花的花期调控及分子育种等奠定基础。

公开(公告)号：CN112143734A

公开(公告)日：2020-12-29

申请号：CN201910571110.6

申请日：2019-06-28

Applicant: 中国医学科学院药用植物研究所

Inventor： 罗红梅 ,  张建红 ,  张鑫 ,  季爱加 ,  吕海舟 ,  宋经元

IPC: C12N15/29 ,  C12N15/82 ,  C07K14/415 ,  A01H5/06 ,  A01H6/00

Abstract: 本发明公开了一条调控丹酚酸合成的丹参bHLH转录因子SmbHLH92的编码基因序列；本发明所提供的SmbHLH92基因具有SEQ ID No.1所示的核苷酸序列，所述基因编码蛋白质具有SEQ ID No.2所示的氨基酸序列。亚细胞定位实验表明SmbHLH92定位于细胞核；本发明构建了SmbHLH92‑RNAi载体，遗传转化丹参，获得转基因毛状根，与对照株系(转化RNAi空载体获得的株系)相比，SmbHLH92‑RNAi株系中四种酚酸类成分含量显著升高。实时荧光定量PCR结果显示丹酚酸途径关键酶基因的表达量在SmbHLH92‑RNAi株系中显著升高。本发明提供的SmbHLH92具有负调控丹酚酸类化合物生物合成的功能，该类化合物在治疗心脑血管疾病方面显示出突出疗效。本发明为利用基因工程提高丹酚酸类化合物的含量提供了一个新的研究思路，同时为开展丹参优良品种选育提供靶基因。

公开(公告)号：CN112076254A

公开(公告)日：2020-12-15

申请号：CN201910500979.1

申请日：2019-06-12

Applicant: 中国医学科学院药用植物研究所

Inventor： 任风鸣 ,  宋经元 ,  马国需

IPC: A61K36/66 ,  A61P1/16 ,  A61P29/00

Abstract: 本发明公开了一种从毛黄堇中提取制备总生物碱的方法。包括如下步骤：A：毛黄堇药材干燥后粉碎过筛；B：过筛后药材粉末置入提取器中，加热乙醇回流提取3次，每次2～3小时，合并提取液；C：提取液减压浓缩为流浸膏，蒸馏水混悬分散，依次以石油醚、二氯甲烷萃取，取水层，减压浓缩；D：浓缩残留物乙醇混悬分散，加热搅拌溶解，过滤；E：滤液冷却析出黄色粉末，过滤，预冷蒸馏水冲洗，真空干燥得毛黄堇总生物碱。本发明主要利用毛黄堇中生物碱成分溶解特性，通过萃取、除杂、乙醇溶液冷却沉淀、干燥等步骤，获得高纯度毛黄堇总生物碱。毛黄堇总生物碱具有多种药理活性，本发明首次公开其提取方法。

公开(公告)号：CN106636072B

公开(公告)日：2020-06-16

申请号：CN201710046634.4

申请日：2017-01-22

Applicant: 中国医学科学院药用植物研究所 ,  哈尔滨市食品药品检验检测中心

Inventor： 石林春 ,  刘金欣 ,  宋经元 ,  唐先明 ,  王洋 ,  刘旭朝 ,  孙志国 ,  刘相辉

IPC: C12N15/10 ,  C12Q1/6806

Abstract: 本发明公开了一种用于动物类中药分子鉴定的通用DNA提取方法，包括：步骤1、配制裂解液PE；步骤2、对动物类中药进行样品的预处理；步骤3、提取动物类中药的DNA；步骤3.1、将步骤2中经预处理的样品与步骤1中配制的裂解液PE混匀；步骤3.2、加入广谱蛋白酶，并使用酚氯仿抽提除去蛋白质等杂质；步骤3.3、使用沉淀剂得到动物类中药的DNA。本发明还公开了一种用于动物类中药分子鉴定的通用DNA提取试剂盒。本发明提供的DNA提取方法及试剂盒可用于除壳类、分泌物类、部分加工品外不同用药部位动物药的DNA提取，所获得DNA满足中药材分子鉴定后续实验要求，保障了中药材分子鉴定的推广应用。

公开(公告)号：CN107502614A

公开(公告)日：2017-12-22

申请号：CN201710168520.7

申请日：2017-03-22

Applicant: 中国医学科学院药用植物研究所

Inventor： 宋经元 ,  季爱加 ,  贾静 ,  徐志超

IPC: C12N15/53 ,  C12N9/02 ,  C12Q1/68

Abstract: 本发明涉及了参与栀子西红花苷合成的类胡萝卜素裂解双加氧酶CCD4a、其编码基因及其功能。属于基因工程技术领域。本发明公开了栀子类胡萝卜素裂解双加氧酶CCD4a基因的开放阅读框序列以及其编码的氨基酸序列。本发明基于转录组学筛选获得CCD4a基因，通过构建pET28a-CCD4a原核表达载体，以玉米黄质为底物在体外验证CCD4a的功能。结果证明CCD4a具有类胡萝卜素裂解双加氧酶的功能，为西红花苷生源途径的解析及合成生物学研究奠定基础。