一种三代群体基因组结构变异联合检测方法

    公开(公告)号:CN115641910B

    公开(公告)日:2023-05-12

    申请号:CN202211287317.9

    申请日:2022-10-20

    Abstract: 一种三代群体基因组结构变异联合检测方法,涉及基因变异检测技术领域,针对现有技术中大规模的群体变异检测速度慢的问题,本申请提出一种基于三代测序的群体基因组SV联合检测方法,以多个个体VCF作为输入,通过对个体VCF文件中变异特征的提取与排序,使用基于二分图最大匹配算法的两轮合并,对不同个体之间的相似的SV进行合并,从而生成代表群体SV的群体VCF。本申请提出的群体基因组SV联合检测方法有效避免了SV整合中过度整合的问题,在保持联合检测高准确性的同时,提升了检出群体SV的多样性,同时,利用分块分治的策略对群体SV进行划分,合理使用计算资源的多核特性,大幅提升了大规模群体SV联合检测的速度。

    面向群体基因组索引表示与构建的方法及设备

    公开(公告)号:CN115662523A

    公开(公告)日:2023-01-31

    申请号:CN202211295056.5

    申请日:2022-10-21

    Abstract: 面向群体基因组索引表示与构建的方法及设备,属于基因技术与计算机技术结合领域。本发明为了解决现有基因组索引结构构建的方法无法对PB级群体基因组数据构建有效的索引结构的问题。本发明对参考基因组构建de Bruijn图模型索引表示,确定每个唯一路径unipath;将参考基因组按照固定长度区间进行有重叠划分,每两个相邻局部区域有部分重叠,针对某个体的单体型,收集每个局部区域内的变异,生成局部变异序列,进而生成变异序列索引文件alt string;分别将unipath以及alt string列表转换为字符串列表并基于minimizer进行群体基因组索引的表示与构建。

    一种三代群体基因组结构变异联合检测方法

    公开(公告)号:CN115641910A

    公开(公告)日:2023-01-24

    申请号:CN202211287317.9

    申请日:2022-10-20

    Abstract: 一种三代群体基因组结构变异联合检测方法,涉及基因变异检测技术领域,针对现有技术中大规模的群体变异检测速度慢的问题,本申请提出一种基于三代测序的群体基因组SV联合检测方法,以多个个体VCF作为输入,通过对个体VCF文件中变异特征的提取与排序,使用基于二分图最大匹配算法的两轮合并,对不同个体之间的相似的SV进行合并,从而生成代表群体SV的群体VCF。本申请提出的群体基因组SV联合检测方法有效避免了SV整合中过度整合的问题,在保持联合检测高准确性的同时,提升了检出群体SV的多样性,同时,利用分块分治的策略对群体SV进行划分,合理使用计算资源的多核特性,大幅提升了大规模群体SV联合检测的速度。

    一种基于泛基因组的群体联合变异检测方法

    公开(公告)号:CN115631789A

    公开(公告)日:2023-01-20

    申请号:CN202211313819.4

    申请日:2022-10-25

    Abstract: 一种基于泛基因组的群体联合变异检测方法,涉及基因生物学技术领域。本发明是为了解决目前群体联合变异检测方法还存在比对效率低、变异检测灵敏度弱、检测结果不够准确的问题。本发明包括:获取参考基因组和被测样本基因组,并利用参考基因组和被测样本基因组识别被测样本基因组上的候选变异位点,并对候选变异点位进行分类;根据候选变异点位的类型利用候选变异位点构建局部单体型序列,并对构建好的局部单体型序列在样本间整合,获得整合后的单体型序列集合;利用整合后的单体型序列检测被测样本基因组的变异位点的基因型;遍历群体内所有被测样本基因组,并重复执行步骤一到三,获得群体内所有变异基因型。本发明用于群体基因组联合变异检测。

    基于图神经网络的基因模块挖掘方法、装置、计算机设备

    公开(公告)号:CN113611366B

    公开(公告)日:2022-04-29

    申请号:CN202110854545.9

    申请日:2021-07-26

    Abstract: 本发明公开了一种基于图神经网络的基因模块挖掘方法、装置、计算机设备。其中,所述方法包括:根据基因表达谱数据,构造基因共表达网络,和基于该构造的基因共表达网络,通过图神经网络方式,配置社区隶属度矩阵,以及基于该配置的社区隶属度矩阵,通过设定阈值的方式,生成已知模块。通过上述方式,能够实现通过图神经网络表示学习的方式配置社区归属矩阵,再通过设定阈值的方式生成已知模块,实现在基因模块挖掘结果上能够允许有密集连接的多个基因可归属于不同的模块。

    高功率因数横向磁通永磁同步直线电机

    公开(公告)号:CN113300564A

    公开(公告)日:2021-08-24

    申请号:CN202110655314.5

    申请日:2021-06-11

    Abstract: 高功率因数横向磁通永磁同步直线电机,属于永磁电机领域,本发明为解决现有横向磁通永磁同步直线电机永磁体利用率低、永磁体和电枢漏磁大、功率因数低的问题。本发明包括初级和次级,初级设置于次级外部;初级包括h个沿轴向并列排布、结构相同的圆盘型电枢铁心,每个圆盘型电枢铁心沿周向设置m×k个U型电枢模块,初级中所有U型电枢模块上设置m相初级电枢,各相沿圆周方向均布且依次占360°/m角度;每相包括k个电枢单元;k个电枢单元中绕组可以通过串联或者并联构成一相绕组;每个电枢单元由h个沿轴向方向均匀分布的U型电枢模块构成,相邻U型电枢模块的绕组反向串联,且相邻U型电枢模块中心的轴向距离为τ。

    一种基于电磁超声发射换能器的Lamb波模式控制方法

    公开(公告)号:CN103308609B

    公开(公告)日:2015-05-20

    申请号:CN201310259795.3

    申请日:2013-06-26

    Abstract: 一种基于电磁超声发射换能器的Lamb波模式控制方法,属于电磁波领域,为解决在非接触型超声无损检测的过程中,由于电磁超声Lamb波的多模式特性导致的回波信号复杂、无法检测的问题。获取Lamb波群速度曲线和相速度曲线;设置激发脉冲电流频率和脉冲周期,计算频厚积;确定产生的Lamb波模式;计算波长并建模求解单根导线产生的各模式Lamb波的振动位移和振动位移峰值;确定曲折线圈的根数并计算它的各模式振动位移和振动位移峰值;判断l是否大于λmax;若是,则对所有振动位移峰值做归一化处理,得到l与归一化值之间的对应关系完成电磁超声Lamb波模式控制,否则令N的值加1。用于对Lamb波模式的控制。

    微生物电辅助系统强化降解含偶氮染料废水的处理装置及水处理方法

    公开(公告)号:CN103951056A

    公开(公告)日:2014-07-30

    申请号:CN201410213661.2

    申请日:2014-05-20

    Abstract: 微生物电辅助系统强化降解含偶氮染料废水的处理装置及水处理方法,它属于印染废水处理领域,主要涉及一种废水的处理装置及方法。本发明是为了解决现有处理含偶氮染料废水的方法废水脱色率低和COD去除能力差的技术问题。本发明装置装置,包括反应器阳极集电板、反应器阴极集电板、参比电极、反应器进水口、排泥口、反应器穿孔布水板、回流管、回流泵、导线、出水口、阳极填料层隔板、阴极填料层隔板和集气口。水处理方法如下:废水从反应器进水口进入微生物电辅助系统强化降解含偶氮染料废水的处理装置,出水口出水,即完成水处理。本发明方法处理含偶氮染料废水脱色率高和COD去除能力强。

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