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公开(公告)号：CN118638804A
公开(公告)日：2024-09-13
申请号：CN202410658846.8
申请日：2024-05-27
Applicant: 北京林业大学
IPC: C12N15/29 , C07K14/415 , C12N15/82 , A01H5/00 , A01H6/00
Abstract: 本发明提供了PopRAP2.3基因在调控植株木质素中的应用，属于植物基因工程技术领域。本发明所述PopRAP2.3基因核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示。本发明构建了PopRAP2.3过表达转基因84K银腺杨(Populus alba×P.glandulosa cv.)，揭示了该基因对杨树木质素含量与木质素积累的正调控功能及其对杨树木材品质性状的影响，提供了通过构建PopRAP2.3过表达杨树转基因植株，以获取具有优良木材品质性状的杨树材料的应用。
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公开(公告)号：CN117987423A
公开(公告)日：2024-05-07
申请号：CN202311194129.6
申请日：2023-09-15
Applicant: 北京林业大学
IPC: C12N15/29 , C07K14/415 , C12Q1/6895 , C12Q1/6858 , C12N15/11 , C12N15/82 , A01H5/00 , A01H6/00
Abstract: 本发明提供了一种与杨树气孔形态和抗旱性相关的候选基因和分子标记，可直接应用于杨树的分子标记辅助育种。并提供了用于扩增所述分子标记的引物对、分子标记的应用、杨树遗传改良方法，能够在分子水平上对杨树的气孔形态做出精准评价，以此为基础，精准、高效地筛选出具有显著抗旱性的树种，有效缩短杨树育种周期。
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公开(公告)号：CN115927711A
公开(公告)日：2023-04-07
申请号：CN202211001294.0
申请日：2022-08-19
Applicant: 北京林业大学
IPC: C12Q1/6895 , C12N15/11 , A01H1/04
Abstract: 本发明公开了一种鉴定毛白杨种质地理来源的分子标记及其应用，所述分子标记位于杨树基因组FPA基因第42位碱基处，具有C/A多态性，其中，所述分子标记的基因型为AA的毛白杨个体，具有较短的年平均日照时数，分子标记的基因型为CC的毛白杨个体，具有较长的年平均日照时数。本发明提供的分子标记，功能明确、效应显著，可直接应用于杨树的分子标记辅助育种；具有环境适应性，适用于杨树定向引种。
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公开(公告)号：CN111781343B
公开(公告)日：2023-03-21
申请号：CN202010690993.5
申请日：2020-07-17
Applicant: 北京林业大学
IPC: G01N33/53 , C12Q1/6827
Abstract: 本发明提供了一种检测DNA甲基化修饰影响转录因子与DNA序列结合的方法，涉及分子生物学技术领域。本发明所述方法中可排除杂蛋白对结合反应的影响，降低了实验假阳性，还可以快速精准的检测DNA甲基化修饰对转录因子结合的影响。以杨树OM47基因启动子区域DNA甲基化修饰对BPC2转录因子结合的影响为例，OM47基因启动子区域未被DNA甲基化修饰的DNA序列与BPC2蛋白具有明显的结合条带，并随着冷探针竞争浓度的增加逐渐变浅，而被DNA甲基化修饰的启动子序列与BPC2蛋白没有明显的结合条带，证明启动子区域的DNA甲基化修饰会抑制与转录因子蛋白的结合效率。
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公开(公告)号：CN113005215B
公开(公告)日：2022-07-26
申请号：CN202110217748.7
申请日：2021-02-26
Applicant: 北京林业大学
IPC: C12Q1/6895 , C12N15/11 , A01H1/04
Abstract: 本发明公开了一种与杨树木材产量相关的单体型分子标记，所述单体型分子标记由InDel1、InDel2、InDel3、InDel4和InDel5共五个标记组合而成，所述单体型分子标记包括单体型I和单体型II，所述单体型分子标记类型为I的杨树个体，相较于单体型分子标记类型为II的杨树个体，具有较大的树高、胸径和材积。本发明提供的与木材产量相关的单体型分子标记，不受杨树的生长阶段的限制，可在杨树幼苗期实现优良品种的早期选育，显著促进杨树的育种进程。本发明还公开了用于检测上述单体型分子标记的引物对、试剂盒、检测方法及应用，以及杨树育种方法，为杨树分子标记辅助选择育种提供了有效手段。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN108517367B
公开(公告)日：2021-10-26
申请号：CN201710230163.2
申请日：2017-04-10
Applicant: 北京林业大学
IPC: C12Q1/6895
Abstract: 本发明公开了确定林木次生生长过程中关键lncRNA及其功能的方法，其包括以下步骤：分别获得同一林木个体的维管形成层、未成熟木质部和成熟木质部的总RNA；分别针对所述维管形成层、未成熟木质部和成熟木质部的总RNA，进行cDNA文库构建及测序；基于测序结果进行lncRNA预测和注释；基于所述维管形成层、未成熟木质部和成熟木质部的lncRNA表达量，进行组织特异性表达分析，以便确定具有组织特异性的lncRNA；将所述具有组织特异性的lncRNA进行序列元件motif预测，以便确定具有组织特异性的lncRNA的motif；以及对具有组织特异性的lncRNA的motif进行功能分析。利用该方法能够有效确定林木次生生长过程中关键lncRNA及其功能，对于进一步挖掘lncRNA在林木次生生长过程中的调控作用意义重大。
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公开(公告)号：CN109487001B
公开(公告)日：2021-07-09
申请号：CN201910005388.7
申请日：2019-01-03
Applicant: 北京林业大学
IPC: C12Q1/6895 , C12N15/11
Abstract: 本发明提供了一种基于多位点联合评价杨树木材纤维长短的方法、引物组、试剂盒及其应用，属于植物分子育种技术领域，包括以下步骤：1)测定杨树样品基因组DNA中编码lncRNA LNC‑033373的基因内的第189位碱基，编码lncRNA LNC‑228084基因内的第346位碱基，Pto‑PO46基因内的第171位碱基和Pto‑COMT24基因内的第613位碱基；2)根据4个位点基因型的组合判断杨树样品纤维的长短；当所述基因型组合为CT‑AG‑GT‑AA时，杨树样品木材的纤维长度最长，当所述基因型组合为CT‑AA‑GT‑AC时，杨树样品木材的纤维长度最短。所述方法能够应用于杨树育种，缩短育种周期。
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公开(公告)号：CN113005215A
公开(公告)日：2021-06-22
申请号：CN202110217748.7
申请日：2021-02-26
Applicant: 北京林业大学
IPC: C12Q1/6895 , C12N15/11 , A01H1/04
Abstract: 本发明公开了一种与杨树木材产量相关的单体型分子标记，所述单体型分子标记由InDel1、InDel2、InDel3、InDel4和InDel5共五个标记组合而成，所述单体型分子标记包括单体型I和单体型II，所述单体型分子标记类型为I的杨树个体，相较于单体型分子标记类型为II的杨树个体，具有较大的树高、胸径和材积。本发明提供的与木材产量相关的单体型分子标记，不受杨树的生长阶段的限制，可在杨树幼苗期实现优良品种的早期选育，显著促进杨树的育种进程。本发明还公开了用于检测上述单体型分子标记的引物对、试剂盒、检测方法及应用，以及杨树育种方法，为杨树分子标记辅助选择育种提供了有效手段。
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公开(公告)号：CN106636389B
公开(公告)日：2020-10-02
申请号：CN201611163560.4
申请日：2016-12-15
Applicant: 北京林业大学
IPC: C12Q1/6858
Abstract: 本发明提供了一种木质素合成途径中上位性效应检测方法，包括以下步骤：1)根据已知木质素合成通路，选取参与合成木质素单体的基因作为目的基因；2)对待测样品目的基因进行InDel位点基因型分型，获得待测样品的基因型数据；3)根据待测样品的基因型数据和待测样品的木质素含量，用epiSNP软件计算目的基因的上位性效应位点；4)对上位性效应位点间的上位性效应的显著性进行检测验证。本发明所述方法利用InDel位点基因型分型，采用简单的PCR就可以精准、简便的测定木质素合成通路中的上位性效应，实验技术成熟，操作简便，检测通量高。
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公开(公告)号：CN109545278A
公开(公告)日：2019-03-29
申请号：CN201811549079.8
申请日：2018-12-18
Applicant: 北京林业大学
IPC: G16B20/00 , G16B30/00 , C12Q1/6895
Abstract: 本发明提供了一种鉴定植物lncRNA与基因互作的方法，涉及分子遗传学技术领域，包括获得lncRNA与基因的群体SNP基因型数据；获得基因在所研究组织的群体表达量数据；获得目标性状群体表型数据；将群体SNP基因型数据与目标性状群体表型数据关联分析；将群体SNP基因型数据与群体表达量数据关联分析；计算群体SNP基因型数据与所述目标性状群体表型数据的相关性系数r；当同时满足3个限定条件时，表明lncRNA与基因有相互作用，共同影响植物目标性状的表型变异。采用该方法准确检测毛白杨lncRNA LNC-0052611与基因Pto-COMT25之间存在互作关系，且该互作关系影响了毛白杨胸径的表型变异。
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