一种基于多维分子指纹预测化合物hERG心脏毒性的方法

    公开(公告)号:CN114582438A

    公开(公告)日:2022-06-03

    申请号:CN202210202646.2

    申请日:2022-03-02

    Applicant: 辽宁大学

    Abstract: 一种基于多维分子指纹预测化合物hERG心脏毒性的方法,该方法包括:第一步,对心脏毒性数据集中的化合物进行分子动力学模拟;第二步,分析分子动力学模拟结果,计算基于分子动力学模拟的分子指纹;第三步,通过分子指纹软件计算化合物的分子指纹,与分子动力学模拟指纹组成多维分子指纹;第四步,采用特征选择方法从多维分子指纹中寻找最优特征子集;第五步,采用多种机器学习方法构建化合物hERG心脏毒性预测模型。实验结果显示,采用了多维分子指纹建立的模型具更高的预测性能。该方法可以实现更高的化合物hERG心脏毒性预测精度,可用于药物设计中的早期毒性筛查。

    一种杀虫脒检测试剂盒及其应用

    公开(公告)号:CN109917127A

    公开(公告)日:2019-06-21

    申请号:CN201910203633.5

    申请日:2019-03-18

    Applicant: 辽宁大学

    Abstract: 本发明公开了一种杀虫脒检测试剂盒及其应用。所述试剂盒包括:含有包被了杀虫脒-OVA偶联物的微量测试孔的酶标板、系列杀虫脒标准溶液、杀虫脒-BSA多克隆抗体、清洗缓冲液、抗体稀释液、HRP标记的山羊抗兔二抗、底物溶液A、底物溶液B和反应终止液。本发明还公开了使用上述试剂盒检测杀虫脒的方法。本发明的杀虫脒检测试剂盒,可用于检测水产品及饲养水产品的水样。该试剂盒简化了样品处理方式,使用简便,整个操作过程一个小时左右,回收率和灵敏度较高。

    一种水产养殖动物体内溶藻弧菌的PCR检测方法

    公开(公告)号:CN106755550A

    公开(公告)日:2017-05-31

    申请号:CN201710157709.6

    申请日:2017-03-16

    Applicant: 辽宁大学

    Abstract: 本发明涉及一种水产养殖动物体内溶藻弧菌的PCR检测方法。提取水产养殖动物组织的总DNA;以所提取的DNA为模板,采用溶藻弧菌特异性引物,进行PCR扩增;所述的溶藻弧菌特异性引物是针对菌种溶藻弧菌的topA基因的特异性引物P1、toxR基因的特异性引物P2、toxR基因的特异性引物P3;根据PCR扩增产物的琼脂糖凝胶呈像结果判断水产养殖动物是否被溶藻弧菌感染。本发明使得水产养殖动物体内残留溶藻弧菌的检测更为简便,为今后水产养殖动物体内残留溶藻弧菌检测和分析提供了必要的理论依据和完善的方法体系,同时为我国水产品病原菌检测和我国食品进出口安全奠定基础。

    一种嗜水气单胞菌特异性引物及其在大菱鲆养殖过程中的应用

    公开(公告)号:CN105969850A

    公开(公告)日:2016-09-28

    申请号:CN201610311630.X

    申请日:2016-05-11

    Applicant: 辽宁大学

    CPC classification number: C12Q1/689 C12Q1/686 C12Q2565/125 C12Q2527/101

    Abstract: 本发明涉及一种嗜水气单胞菌特异性引物及其在大菱鲆养殖过程中的应用。本发明所设计的嗜水气单胞菌特异性引物由上游引物F:CGACGTGTTTGGCGATATTTTTG和下游引物R:GTCTTGGTCTTCTGGTAGCGA构成。本发明设计的嗜水气单胞菌特异性引物,能有效从各常见致病菌株中区分出嗜水气单胞菌,表现出很强的特异性和灵敏性。本发明所提供的在大菱鲆养殖过程中嗜水气单胞菌的PCR检测方法,使得养殖过程中嗜水气单胞菌的检测更为简便。本发明方法的确立为今后大菱鲆养殖过程中高发致病菌的检测和分析提供了必要的理论依据和完善的方法体系,同时为促进我国养殖产业的规模化健康发展奠定了基础。

    一种温和气单胞菌特异性引物及其在大菱鲆养殖过程中的应用

    公开(公告)号:CN105886637A

    公开(公告)日:2016-08-24

    申请号:CN201610311622.5

    申请日:2016-05-11

    Applicant: 辽宁大学

    CPC classification number: C12Q1/689 C12Q1/686

    Abstract: 本发明涉及一种温和气单胞菌特异性引物及其在大菱鲆养殖过程中的应用。本发明所提供的温和气单胞菌特异性引物由上游引物F:GCTGATTTTGGTGATGCGTTCA和下游引物R:TACGTACAGATCCCCAGCCC构成。本发明设计的温和气单胞菌特异性引物,能有效从各常见致病菌株中区分出温和气单胞菌,表现出很强的特异性和灵敏性。本发明所提供的在大菱鲆养殖过程中温和气单胞菌的PCR检测方法,使得养殖过程中温和气单胞菌的检测更为简便,为今后大菱鲆养殖过程中高发致病菌的检测和分析提供了必要的理论依据和完善的方法体系为促进我国养殖产业的规模化健康发展奠定了基础。

    一种多重PCR引物及其在大菱鲆养殖过程中的应用

    公开(公告)号:CN105734166A

    公开(公告)日:2016-07-06

    申请号:CN201610308352.2

    申请日:2016-05-11

    Applicant: 辽宁大学

    Abstract: 本发明涉及一种多重PCR引物及其在大菱鲆养殖过程中的应用。本发明提供的一种多重PCR引物,由嗜水气单胞菌特异性引物H、温和气单胞菌特异性引物S和舒伯特气单胞菌特异性引物Sc组成。采用该多重PCR引物在大菱鲆养殖过程中快速鉴定致病菌的方法如下:提取大菱鲆病灶部位细菌的总DNA;以所提取的DNA为模板,采用上述的多重PCR引物,进行PCR扩增;根据PCR扩增产物的琼脂糖凝胶呈像结果判断。本发明经过一次PCR反应可以同时检测三种大菱鲆养殖过程中常见的致病菌,表现出很强的特异性和灵敏性。在大菱鲆养殖过程中,一旦有被这三种气单胞菌感染的风险,即能够做到快速鉴定致病源,为养殖户挽回大量损失。

    生物防治链霉菌及其应用
    48.
    发明公开

    公开(公告)号:CN104357369A

    公开(公告)日:2015-02-18

    申请号:CN201410691633.1

    申请日:2014-11-25

    Applicant: 辽宁大学

    CPC classification number: C12R1/465 A01N63/02

    Abstract: 本发明涉及生物防治链霉菌及其应用。本发明的生物防治链霉菌,命名为链霉菌Lnu-12(Streptomyces sp.lnu-12),保藏编号为CCTCC NO:M2014554。本发明采用平板对峙法,检测Lnu-12对多种植物病原菌具有拮抗作用,其中对瓜类枯萎病菌抑制作用最强,抑菌带平均宽度达到19~21mm,对番茄叶霉病菌、番茄早疫病菌有很强的抑制作用,抑菌带宽分别为15mm和17mm,对辣椒根腐病菌有一定的抑制作用,抑菌带宽13mm,链霉菌Lnu-12在大棚蔬菜土传病害的生物防治中具有很好的应用前景。

    一种从“太岁”中提取基因组的方法

    公开(公告)号:CN101705224A

    公开(公告)日:2010-05-12

    申请号:CN200910220112.7

    申请日:2009-11-24

    Applicant: 辽宁大学

    Abstract: 本发明涉及一种从“太岁”中提取基因组的方法。采用的技术方案是:a)将“太岁”组织经裂解液研磨,得研成碎末的“太岁”组织液;b)向研成碎末的“太岁”组织液中加入氯仿-异戊醇,摇匀,离心,取上清液;c)在约72℃水浴中停留约3min,置于冰浴中,取出自然升温至室温;d)加入2~7mol/L的除蛋白溶剂,使除蛋白溶剂终浓度为约1mol/L;e)重复b)至d)步骤,直至加入氯仿-异戊醇,离心后,两层界面看不到蛋白物质,取上清液;f)加入经-20℃预冷的95%乙醇,混匀,有絮状沉淀析出,离心收集沉淀。应用本发明,成功的从“太岁”中获得了基因组,为“太岁”的分子生物学研究打下了基础。

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