一种中性粒细胞分化轨迹推断方法及系统

    公开(公告)号:CN119993281A

    公开(公告)日:2025-05-13

    申请号:CN202510460330.7

    申请日:2025-04-14

    Abstract: 本发明提供了一种中性粒细胞分化轨迹推断方法及系统,涉及细胞分化轨迹分析技术领域,该中性粒细胞分化轨迹推断方法包括以下步骤:获取中性粒细胞的基因表达数据,对中性粒细胞的基因表达数据进行特征选择处理;基于深度学习法对基因表达数据集进行特征映射处理;并利用贝叶斯信息准则评估备选模型的评分,根据评分结果筛选评分最高的备选模型作为最佳因果模型;根据最佳模型中的因果关系网络构建分化轨迹网络,并根据分化轨迹网络对中性粒细胞进行分化轨迹推断,得到中性粒细胞分化轨迹的预测结果。本发明能够得到中性粒细胞分化轨迹的预测结果,有助于揭示中性粒细胞分化的动态过程和调控机制。

    一种敲除金属硫蛋白基因的sgRNA在制备治疗肿瘤双硫仑药物中的应用

    公开(公告)号:CN119464299A

    公开(公告)日:2025-02-18

    申请号:CN202411703793.3

    申请日:2024-11-26

    Applicant: 南通大学

    Inventor: 吴圆圆 范义辉

    Abstract: 本发明公开了一种敲除金属硫蛋白基因的sgRNA在制备治疗肿瘤双硫仑药物中的应用,通过RNA测序及数据分析寻找影响DSF耐药的分子机制,测序结果表明DSF处理组上调的基因有多个富集基因属于金属硫蛋白基因MTs家族,通过Real‑time PCR检测发现DSF处理的肿瘤细胞MTs的mRNA表达增加,结果与测序结果一致;为了明确MTs表达的上调是否与肿瘤细胞DSF耐药相关,利用基因敲除技术下调MTs基因家族中MT1X和MT2A的表达,敲除MT1X和MT2A的肿瘤细胞系对DSF敏感性增加,表明MTs可以作为DSF抗肿瘤治疗的靶点。

    一种鉴定N4BP1核糖内切酶活性的EGFP报告系统的开发和应用

    公开(公告)号:CN118222701A

    公开(公告)日:2024-06-21

    申请号:CN202410453594.5

    申请日:2024-04-16

    Applicant: 南通大学

    Abstract: 本发明提供一种鉴定N4BP1核糖内切酶活性的EGFP报告系统的开发和应用,涉及生物医学技术领域,利用改造后的EGFP荧光蛋白鉴定N4BP1的内切酶活性。通过实验,发现确定了N4BP1降解靶基因FosC的核心序列,将此序列连接到EGFP的mRNA的C端,构建成新EGFP‑mRNA序列。N4BP1过表达质粒共表达在HEK293T细胞,然后比较荧光信号的强度就可以判断N4BP1的内切酶活性。改造后的EGFP,由于连接了N4BP1识别的靶序列,EGFP的表达量会N4BP1酶活力的多少进行改变。通过检测EGFP的强度,就能判断N4BP1蛋白的量及酶活性。因此,N4BP1的GFP报告系统可以用于检测N4BP1的酶活力。由于N4BP1基因在免疫、炎症及肿瘤中发挥关键作用。该细胞可以检测相关疾病细胞中N4BP1的核糖内切酶活性。

    一种组蛋白去乙酰化酶抑制剂的新用途

    公开(公告)号:CN116440129A

    公开(公告)日:2023-07-18

    申请号:CN202310359607.8

    申请日:2023-04-06

    Applicant: 南通大学

    Abstract: 本发明公开了一种组蛋白去乙酰化酶抑制剂的新用途,具体涉及组蛋白去乙酰化酶抑制剂NCH‑51在抑制BRD4与MYC相互作用中的应用。本发明通过蛋白质结构建模获得BRD4L(aa:823‑1044)与MYC(aa:144‑163)的结构,基于老药新用的思路将CMAP数据库获得的小分子通过分子对接进行虚拟筛选,发现HDAC抑制剂NCH‑51可以稳定的结合在BRD4与MYC的结合界面,或可抑制BRD4与MYC的相互作用,挖掘HDAC抑制剂NCH‑51的新用途。本发明为BRD4靶向抑制剂的快速开发提供了新的范例。

    小分子抑制剂ML385在抑制肿瘤细胞PD-L1方面的应用

    公开(公告)号:CN114588153A

    公开(公告)日:2022-06-07

    申请号:CN202210336542.0

    申请日:2022-04-01

    Applicant: 南通大学

    Abstract: 本发明公开一种小分子抑制剂ML385在抑制肿瘤细胞PD‑L1方面的应用。进一步的,所述ML385抑制剂抑制肿瘤细胞中PD‑L1的功能,激活T细胞的抗肿瘤免疫功能。本发明的实施例还提出一种小分子抑制剂ML385在抑制肿瘤细胞PD‑L1和PD‑L2方面的应用。进一步的,所述ML385抑制剂通过抑制NRF2和MAF的结合,破坏NRF2识别PD‑L1L2‑SE的核心位点,从而抑制PD‑L1和PD‑L2的表达。本发明的实施例另外还提出一种杀伤肿瘤细胞的药物,其特征在于,包括小分子抑制剂ML385。进一步的,所述药物还包括抗PD‑L1抗体或抗PD‑L2抗体。本发明的实施例中通过实验验证了在乳腺癌细胞SUM159和MDA‑MB‑231中,小分子抑制剂ML385明显抑制了PDL1的表达。

    TAK1抑制剂抑制PDL1的检测方法及其在制备抗PDL1药物中的应用

    公开(公告)号:CN112501239B

    公开(公告)日:2021-12-24

    申请号:CN202011466323.1

    申请日:2020-12-14

    Applicant: 南通大学

    Abstract: 本发明提供一种TAK1抑制剂抑制PDL1的检测方法,包括如下步骤:(1)探究肿瘤细胞中PDL1分子的表达调控机制:利用小分子抑制剂处理肿瘤细胞,分别通过基因水平和蛋白水平来表征PDL1的表达;(2)检测肿瘤细胞中ERK的磷酸化水平;(3)验证TAK1抑制剂对肿瘤细胞PDL1的抑制作用:用TAK1抑制剂处理肿瘤细胞后,用免疫荧光技术检测细胞中PDL1的蛋白表达水平。本发明采用的TAK1抑制剂是一种具有良好开发前景的潜在的抗肿瘤药物,在基因水平明显下调PDL1的表达,有望为临床上治疗乳腺癌提供可行性和理论依据。

    RGDfK抑制PDL1的检测方法及其在制备抗PDL1药物中的应用

    公开(公告)号:CN112481362B

    公开(公告)日:2021-11-19

    申请号:CN202011467072.9

    申请日:2020-12-14

    Applicant: 南通大学

    Abstract: 本发明提供一种RGDfK抑制PDL1的检测方法,包括如下步骤:(1)探究肿瘤细胞表面PDL1分子的表达调控机制:利用小分子抑制剂处理肿瘤细胞,分别通过基因和蛋白水平来表征PDL1的表达;(2)检测肿瘤细胞中ERK的磷酸化水平;(3)验证RGDfK对肿瘤细胞PDL1的抑制作用:用RGDfK抑制剂处理肿瘤细胞后,用免疫荧光技术检测细胞中PDL1的蛋白表达水平。本发明提出整合素αvβ3的抑制剂RGDfK可以增强T细胞在乳腺癌中的免疫治疗效果,有望为临床上治疗乳腺癌提供可行性和理论依据。

    一种银屑病抑制基因及其应用

    公开(公告)号:CN112501175A

    公开(公告)日:2021-03-16

    申请号:CN202011461788.8

    申请日:2020-12-14

    Applicant: 南通大学

    Abstract: 本发明提供了一种银屑病抑制基因,为N4BP1基因。同时提供了基因N4BP1在制备治疗银屑病药物中的应用及在制备检测银屑病试剂盒中的应用。N4BP1在皮肤的角质细胞和中性粒细胞中高表达。N4BP1缺失后,角质细胞增殖加快,中性粒细胞数量和反映增强。因此N4BP1是银屑病发展的关键基因,N4BP1的功能缺失会加重疾病的进展。本发明通过过表达N4BP1基因,或用药物稳定、促进N4BP1的功能,为银屑病的发展研究及治疗药物的制备提供理论依据。

    一种USP7抑制剂在治疗ABC-DLBCL药物中的应用

    公开(公告)号:CN111840562A

    公开(公告)日:2020-10-30

    申请号:CN202010859627.8

    申请日:2020-08-24

    Applicant: 南通大学

    Inventor: 吴圆圆 范义辉

    Abstract: 本发明公开了一种USP7抑制剂在治疗ABC-DLBCL药物中的应用,研究USP7在DLBCL细胞系中的表达情况,然后通过数据库分析显示,用USP7小分子抑制剂抑制USP7活性,CCK-8法观察ABC型DLBCL细胞增殖、PI染色和流式细胞术检测细胞凋亡的影响及其对ABC型DLBCL BCR信号通路的影响,USP7是目前研究最为广泛的一个泛素特异性蛋白酶,研究表明USP7参与调节细胞多种蛋白底物的活性和功能,USP7表达异常或者活性改变对疾病及肿瘤的发生发展均有重要作用,将会具有良好的应用前景和市场竞争力,对改善我国民生和社会具有良好的促进作用。

Patent Agency Ranking