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公开(公告)号：CN109633092A
公开(公告)日：2019-04-16
申请号：CN201811591475.7
申请日：2018-12-25
Applicant: 北京林业大学
IPC: G01N33/00
CPC classification number: G01N33/0098
Abstract: 本发明提供了一种检测杨树干旱胁迫临界值的方法，属于杨树抗旱研究技术领域，所述方法包括以下步骤：1)将杨树苗移栽至土壤中进行管理，所述管理包括每2～4天浇水一次，浇至土壤透水；2)选取距杨树苗枝条顶端第3～5片功能叶中的1片进行叶片的生理特性参数测定；3)每36～60h重复步骤2)所述的操作；4)利用统计学方法分析步骤2)和步骤3)获得的生理特性参数，当叶片的叶水势、净光合速率、气孔导度、超氧化物歧化酶活性、过氧化物酶活性、过氧化氢酶活性显著降低，并且相对电导率、丙二醛含量、脯氨酸含量显著提高时，记录的土壤含水量即为杨树干旱胁迫临界值。本发明所述方法能够科学准确地检测杨树干旱胁迫的临界值。
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公开(公告)号：CN108509766A
公开(公告)日：2018-09-07
申请号：CN201710621910.5
申请日：2017-07-27
Applicant: 北京林业大学
Abstract: 本发明公开了确定lncRNA是否来源于假基因的方法，其包括以下步骤：分别获得待测lncRNA的基础生物信息和所述待测lncRNA所属物种的所有假基因的基础生物信息；基于所述待测lncRNA与各假基因在染色体上的物理位置关系，进行第一来源确定处理，其中，当不存在与所述待测lncRNA具有序列重合情形的假基因时，判定所述待测lncRNA不是假基因来源；当存在与所述待测lncRNA具有序列重合情形的假基因时，选择与所述待测lncRNA具有序列重合情形的假基因作为所述待测lncRNA的候选假基因，并按照如下步骤进行第二来源确定处理：计算待测lncRNA与候选假基因的序列重合度I；以及基于序列重合度I，确定待测lncRNA是否来源于所述候选假基因。利用该方法可在全基因组水平批量检测假基因来源的lncRNA。
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公开(公告)号：CN108508207A
公开(公告)日：2018-09-07
申请号：CN201710245597.X
申请日：2017-04-14
Applicant: 北京林业大学
IPC: G01N33/68
Abstract: 本发明提出了确定蛋白质-DNA结合位点的方法以及确定蛋白质-DNA结合位点的装置。所述方法包括：分别将参考蛋白质集的氨基酸序列和待测蛋白质的氨基酸序列拆分为具有预定氨基酸数目的多个候选单元；确定所述多个候选单元每一个的氨基酸属性，确定所述待测蛋白质的蛋白质-DNA结合位点。利用本发明的确定蛋白质-DNA结合位点的方法及装置能够准确地确定蛋白质-DNA结合位点，且步骤简单，操作方便，极大地降低了成本。
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公开(公告)号：CN108467900A
公开(公告)日：2018-08-31
申请号：CN201710100726.6
申请日：2017-02-23
Applicant: 北京林业大学
IPC: C12Q1/6895 , A01H1/04 , C12M1/34
Abstract: 本发明提出了预测杨树生长性状的方法、杨树选育方法、用于预测杨树生长性状的试剂盒、用于预测杨树生长性状的设备、杨树选育系统以及预定位点的基因型在预测杨树生长性状中的用途。所述方法包括：(1)确定所述杨树下列预定位点的基因型：Lnc-CK基因的第221位、Pto-CKX6基因的第1490位和2153位；以及(2)基于所述预定位点的基因型，预测所述杨树的生长性状。利用本发明的方法能够预测出杨树的生长性状，选育出速生杨树，缩短育种周期。
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公开(公告)号：CN106636389A
公开(公告)日：2017-05-10
申请号：CN201611163560.4
申请日：2016-12-15
Applicant: 北京林业大学
IPC: C12Q1/68
CPC classification number: C12Q1/6858 , C12Q2537/165 , C12Q2563/107
Abstract: 本发明提供了一种木质素合成途径中上位性效应检测方法，包括以下步骤：1)根据已知木质素合成通路，选取参与合成木质素单体的基因作为目的基因；2)对待测样品目的基因进行InDel位点基因型分型，获得待测样品的基因型数据；3)根据待测样品的基因型数据和待测样品的木质素含量，用epiSNP软件计算目的基因的上位性效应位点；4)对上位性效应位点间的上位性效应的显著性进行检测验证。本发明所述方法利用InDel位点基因型分型，采用简单的PCR就可以精准、简便的测定木质素合成通路中的上位性效应，实验技术成熟，操作简便，检测通量高。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN104293896A
公开(公告)日：2015-01-21
申请号：CN201310298870.7
申请日：2013-07-16
Applicant: 北京林业大学
IPC: C12Q1/68
CPC classification number: C12Q1/6858 , C12Q2525/101 , C12Q2531/113
Abstract: 本发明公开了一种SNP位点基因型分型的方法。该方法包括以下步骤：S1，对目标区域的DNA序列进行克隆测序和多重比对，确定待测SNP位点；S2，针对SNP位点设计PCR扩增引物，PCR扩增引物中的正向引物或反向引物的3'末端对应待测SNP位点，将对应待测SNP位点的3'末端上的核苷酸进行LNA修饰；S3，采用PCR扩增引物对待测样本的DNA进行扩增，并根据扩增产物中目的条带的有无确定待测样本的SNP位点基因型。应用本发明的技术方案，采用锁核酸引物进行PCR扩增以确定SNP位点的基因型，不仅增加了检测结果的精确性和可靠性，而且极大地提高了实验的灵活性，简化了配套条件并显著地降低了实验成本。
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公开(公告)号：CN104293895A
公开(公告)日：2015-01-21
申请号：CN201310298854.8
申请日：2013-07-16
Applicant: 北京林业大学
IPC: C12Q1/68
CPC classification number: C12Q1/6895 , C12Q2600/13 , C12Q2600/156
Abstract: 本发明公开了一种利用微卫星DNA分子标记技术构建杨树核心种质的方法及试剂盒。该方法包括以下步骤：S1，收集毛白杨种质资源；S2，提取步骤S1中毛白杨的基因组DNA；S3，PCR扩增在毛白杨全基因组区域开发的多态性微卫星DNA标记；S4，利用UPGMA-聚类分析逐次随机取样及STRUCTURE模型重检测联合分析法构建8%～30%不等规模的候选核心种质群体；S5，通过比较候选核心种质群体与原群体在分子遗传多样性及数量性状变异水平上的差异，确定15%的核心种质群体。一方面可以较好的反映该物种表型性状多样性，避免遗漏珍贵的种质资源，另一方面，能够为后期开展分子标记定向选择育种提供较好的种质资源材料。
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公开(公告)号：CN104293890A
公开(公告)日：2015-01-21
申请号：CN201310298633.0
申请日：2013-07-16
Applicant: 北京林业大学
IPC: C12Q1/68
CPC classification number: C12Q1/6858 , C12Q2525/191 , C12Q2521/301 , C12Q2531/113
Abstract: 本发明公开了一种检测植物花器官特异性DNA甲基化修饰位点的方法及试剂盒。其中，包括以下步骤：S1，提取植物花器官基因组DNA；S2，对植物花器官基因组DNA进行酶切；S3，分别对酶切产物连接上限制性内切酶的接头；S4，以接头为模板设计的预扩增引物进行PCR预扩增，得PCR预扩增产物；S5，将PCR预扩增产物稀释后，加入带有选择性碱基的筛选引物进行PCR扩增；S6，电泳检测PCR扩增产物，统计并分析DNA条带，S7，回收、克隆S6中得到的DNA甲基化差异条带并进行测序。采用本发明提供的接头、预扩增引物和筛选引物，能够稳定、高效地检测植物花器官特异性DNA甲基化修饰位点。
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公开(公告)号：CN104293889A
公开(公告)日：2015-01-21
申请号：CN201310298603.X
申请日：2013-07-16
Applicant: 北京林业大学
IPC: C12Q1/68
CPC classification number: C12Q1/6869 , C12Q2535/122 , C12Q2525/207
Abstract: 本发明公开了一种雌雄异株植物中雌雄花器官差异表达的microRNA的筛选方法，该方法包括：S101，选取具有相同基因型的雌性花器官和雄性花器官；S102，分别从雌性花器官和雄性花器官中提取总RNA，得到雌花总RNA和雄花总RNA；S103，根据提取出总RNA建立cDNA；S104，对建立的cDNA文库进行测序；S105，根据测序结果及microRNA评估标准，判断雌花和雌花cDNA文库所对应的microRNA种类及数量;以及S106，根据microRNA种类及数量，筛选出雌性花器官与雄性花器官差异表达的microRNA。本发明的方法快速高效，易于自动化，具有实用价值和广泛的应用前景。
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公开(公告)号：CN118441089B
公开(公告)日：2025-03-14
申请号：CN202410666316.8
申请日：2024-05-27
Applicant: 北京林业大学
IPC: C12Q1/6895 , C12N15/11
Abstract: 本发明提供了一种Pto‑RAD50基因单倍型在评价植物光合效率中的应用，属于植物分子育种技术领域。本发明所述Pto‑RAD50基因的核苷酸序列如SEQ ID NO：1所示；所述Pto‑RAD50基因单倍型根据SNP1、SNP2和InDel的核苷酸确定，所述SNP1为SEQ ID NO：1的第172位的核苷酸，所述核苷酸为C或A；所述SNP2为SEQ ID NO：1的第442位的核苷酸，所述核苷酸为A或G；所述InDel为SEQ ID NO：1的第422位后的核苷酸为ATTATTTTAATA或缺失ATTATTTTAATA。通过测定上述三个位点的基因型组合能够准确地判断杨树的光合效率，在杨树生长早期准确、高效筛选高光合效率的优株，有效缩短育种周期。
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