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公开(公告)号:CN117238380A
公开(公告)日:2023-12-15
申请号:CN202311520926.9
申请日:2023-11-15
Applicant: 中国医学科学院北京协和医院
IPC: G16B40/00 , G16B20/00 , G06F18/2135 , G06F18/24
Abstract: 本申请公开了宏基因组病原识别的AI推荐方法、装置、设备及介质,涉及宏基因组病原技术领域,该方法包括:获取样本数据和样本数据的基因特征信息;将样本数据输入至推荐模型,在通过推荐模型的优化目标函数,得到与基因特征信息匹配度最高的模型参数后,基于样本数据、基因特征信息和模型参数对推荐模型进行训练,输出推荐结果,该推荐模型的模型算法为包括二阶导数的高维算法。由此,通过包含二阶导数的高维算法,能够避免当样本的数据集较为庞大,或,模型结构较为复杂时出现的可扩展性较差的问题,同时提升了宏基因组病原识别的人工智能推荐的准确度和灵敏度。
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公开(公告)号:CN116536447B
公开(公告)日:2023-09-22
申请号:CN202310759738.5
申请日:2023-06-26
Applicant: 中国医学科学院北京协和医院
IPC: C12Q1/6895 , C12Q1/686 , C12N15/11 , C12R1/645
Abstract: 本发明提供了一种拟平滑念珠菌微卫星位点、一种拟平滑念珠菌的微卫星位点的检测方法、一种用于扩增拟平滑念珠菌微卫星位点的引物组、一种用于检测拟平滑念珠菌的微卫星位点的试剂盒、拟平滑念珠菌微卫星位点及其检测方法在拟平滑念珠菌的分子分型、分子溯源、院感监测、群体遗传和系统进化分析中的应用。利用本发明提供的拟平滑念珠菌微卫星位点及其检测方法和特异性引物组对拟平滑念珠菌的型别进行检测,多态性高、特异型好,在拟平滑念珠菌分子流行病学、群体遗传研究等方面具有重要意义。
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公开(公告)号:CN116536447A
公开(公告)日:2023-08-04
申请号:CN202310759738.5
申请日:2023-06-26
Applicant: 中国医学科学院北京协和医院
IPC: C12Q1/6895 , C12Q1/686 , C12N15/11 , C12R1/645
Abstract: 本发明提供了一种拟平滑念珠菌微卫星位点、一种拟平滑念珠菌的微卫星位点的检测方法、一种用于扩增拟平滑念珠菌微卫星位点的引物组、一种用于检测拟平滑念珠菌的微卫星位点的试剂盒、拟平滑念珠菌微卫星位点及其检测方法在拟平滑念珠菌的分子分型、分子溯源、院感监测、群体遗传和系统进化分析中的应用。利用本发明提供的拟平滑念珠菌微卫星位点及其检测方法和特异性引物组对拟平滑念珠菌的型别进行检测,多态性高、特异型好,在拟平滑念珠菌分子流行病学、群体遗传研究等方面具有重要意义。
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公开(公告)号:CN115887698A
公开(公告)日:2023-04-04
申请号:CN202211385090.1
申请日:2022-11-07
Applicant: 中国医学科学院北京协和医院
Abstract: 本发明提供一种用于疾病治疗的载药递送系统、传递方法以及应用,所述系统包括:(1)基因编辑改造的低毒力新生隐球菌,利用小鼠感染模型从新生隐球菌基因敲除菌株库中筛选低毒菌株;(2)递送的物质可以是活性蛋白、多肽等治疗或预防作用的基因片段、质粒或药物。本申请同时提供用于疾病治疗的载药递送方法,采用所述递送系统,并通过静脉注射或者吸入方式给药。本发明利用隐球菌可穿越血脑屏障这一特性,通过基因编辑技术改造毒力,成为可稳定定植于疾病组织的递送系统,该技术将可以递送各种不同的药物,包括抗生素、抗肿瘤药物和神经肽。
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公开(公告)号:CN112646860A
公开(公告)日:2021-04-13
申请号:CN202110002930.0
申请日:2021-01-04
Applicant: 中国医学科学院北京协和医院
IPC: C12Q1/6806 , C12Q1/6895 , C12Q1/04 , C12R1/645
Abstract: 本发明公开了一种DNA甲基化靶向富集的方法,特异性富集甲基化修饰DNA片段。通过本发明所得到的靶向富集后的DNA可广泛应用于下游诸多分子诊断,如基于检测母体血浆中胎儿游离DNA的无创性产前分子诊断(NITP),病原微生物检测,肿瘤伴随诊断等。
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公开(公告)号:CN112633370A
公开(公告)日:2021-04-09
申请号:CN202011523426.7
申请日:2020-12-22
Applicant: 中国医学科学院北京协和医院 , 北京浩辰星月科技有限公司
Abstract: 本发明提供一种用于针对丝状真菌形态的检测方法、装置、设备及介质,所述方法包括建立各类丝状真菌的显微图像数据库;通过高信息区评价算法对所述丝状真菌的显微图像进行预处理;构建基于ResNet的神经网络模型,对预处理后的所述显微图像作为测试样本进行特征提取;调整所述神经网络模型;将带有丝状真菌结构特征的待测图像进行所述预处理,并输入到已训练完成的神经网络模型中,得到所述待测图像中丝状真菌的菌种类别及形态学描述。本申请通过引入计算机图像理解、机器学习等人工智能技术,可以大幅提高丝状真菌的检出率,使机器可以获得与人近似甚至高于人的图像鉴别能力。
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公开(公告)号:CN110438247B
公开(公告)日:2021-02-05
申请号:CN201910770927.6
申请日:2019-08-20
Applicant: 中国医学科学院北京协和医院 , 北京卓诚惠生生物科技股份有限公司
Abstract: 本公开涉及一种用于检测大肠埃希菌和肺炎克雷伯菌及其毒力因子和耐药基因的核酸试剂、试剂盒、系统及方法,所述核酸试剂包括分别彼此独立存放或互相任意混合存放的SEQIDNO.1‑26所示的引物和SEQIDNO.29‑41所示的探针。本公开通过以上所述的引物和探针建立了检测大肠埃希菌、肺炎克雷伯菌及其携带的6种毒力因子和5种耐药基因的核酸试剂、试剂盒、系统及方法,能够实现快速、全面、敏感、特异、自动的检测结果判定,显著提高了对上述目标检测基因同时进行检测的敏感性、特异性和简便性。
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公开(公告)号:CN110484641A
公开(公告)日:2019-11-22
申请号:CN201910727456.0
申请日:2019-08-07
Applicant: 中国医学科学院北京协和医院
IPC: C12Q1/6895 , C12Q1/686 , C12Q1/04 , C12R1/72
Abstract: 本发明提供一种高分辨率熔解曲线鉴定光滑念珠菌的方法,包括如下步骤:步骤一、准备待鉴定菌株包括光滑念珠菌、尼瓦利亚念珠菌、布加拉念珠菌和对照菌株的DNA模板;步骤二、设计上下游引物;步骤三、利用高分辨率溶解曲线技术HRM,获取各菌株高分辨溶解曲线图,具体为利用Real-time PCR技术,通过实时检测DNA熔解过程中荧光信号值的变化获取各菌株高分辨溶解曲线图;步骤四、利用分析软件分析鉴定待鉴定菌株的具体类型;步骤五、测定步骤三中结果为阳性菌株的核苷酸序列;步骤六、验证鉴定方法的灵敏度。本发明提供高分辨率熔解曲线鉴定光滑念珠菌的方法,可明确鉴定光滑念珠菌复合体中的不同物种,方法操作简单,准确高效。
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公开(公告)号:CN110438247A
公开(公告)日:2019-11-12
申请号:CN201910770927.6
申请日:2019-08-20
Applicant: 中国医学科学院北京协和医院 , 北京卓诚惠生生物科技股份有限公司
Abstract: 本公开涉及一种用于检测大肠埃希菌和肺炎克雷伯菌及其毒力因子和耐药基因的核酸试剂、试剂盒、系统及方法,所述核酸试剂包括分别彼此独立存放或互相任意混合存放的SEQIDNO.1-26所示的引物和SEQIDNO.29-41所示的探针。本公开通过以上所述的引物和探针建立了检测大肠埃希菌、肺炎克雷伯菌及其携带的6种毒力因子和5种耐药基因的核酸试剂、试剂盒、系统及方法,能够实现快速、全面、敏感、特异、自动的检测结果判定,显著提高了对上述目标检测基因同时进行检测的敏感性、特异性和简便性。
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公开(公告)号:CN107236782A
公开(公告)日:2017-10-10
申请号:CN201710414324.3
申请日:2017-06-05
Applicant: 中国医学科学院北京协和医院
IPC: C12Q1/04
CPC classification number: C12Q1/04 , G01N2333/195
Abstract: 一种革兰氏阴性菌阳性血培养分离胶及化学试剂前处理方法,抽取3.5ml血培养阳性液至3.5ml分离胶管中;把分离胶管放置到离心机中,离心机在4000g的离心力的作用下离心10min;在勿碰触分离胶管中的分离胶的表面菌膜的条件下对血培养阳性液进行吸弃上清;将1ml菌悬液转移至1.5mlEP管中,往EP管中加入200μl且浓度百分比为10%的SDS,把EP管放置在涡旋振荡仪上进行涡旋震荡1min后,再在室温的条件下把EP管静置5min;获得的菌悬液通过化学试剂处理后进行直接MALDI‑TOF质谱鉴定,有效避免了现有技术中整个过程耗时长的缺陷。
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