-
公开(公告)号：CN115662523A
公开(公告)日：2023-01-31
申请号：CN202211295056.5
申请日：2022-10-21
Applicant: 哈尔滨工业大学
Abstract: 面向群体基因组索引表示与构建的方法及设备，属于基因技术与计算机技术结合领域。本发明为了解决现有基因组索引结构构建的方法无法对PB级群体基因组数据构建有效的索引结构的问题。本发明对参考基因组构建de Bruijn图模型索引表示，确定每个唯一路径unipath；将参考基因组按照固定长度区间进行有重叠划分，每两个相邻局部区域有部分重叠，针对某个体的单体型，收集每个局部区域内的变异，生成局部变异序列，进而生成变异序列索引文件alt string；分别将unipath以及alt string列表转换为字符串列表并基于minimizer进行群体基因组索引的表示与构建。
-
公开(公告)号：CN115641910A
公开(公告)日：2023-01-24
申请号：CN202211287317.9
申请日：2022-10-20
Applicant: 哈尔滨工业大学
Abstract: 一种三代群体基因组结构变异联合检测方法，涉及基因变异检测技术领域，针对现有技术中大规模的群体变异检测速度慢的问题，本申请提出一种基于三代测序的群体基因组SV联合检测方法，以多个个体VCF作为输入，通过对个体VCF文件中变异特征的提取与排序，使用基于二分图最大匹配算法的两轮合并，对不同个体之间的相似的SV进行合并，从而生成代表群体SV的群体VCF。本申请提出的群体基因组SV联合检测方法有效避免了SV整合中过度整合的问题，在保持联合检测高准确性的同时，提升了检出群体SV的多样性，同时，利用分块分治的策略对群体SV进行划分，合理使用计算资源的多核特性，大幅提升了大规模群体SV联合检测的速度。
-
公开(公告)号：CN115631789A
公开(公告)日：2023-01-20
申请号：CN202211313819.4
申请日：2022-10-25
Applicant: 哈尔滨工业大学
Abstract: 一种基于泛基因组的群体联合变异检测方法，涉及基因生物学技术领域。本发明是为了解决目前群体联合变异检测方法还存在比对效率低、变异检测灵敏度弱、检测结果不够准确的问题。本发明包括：获取参考基因组和被测样本基因组，并利用参考基因组和被测样本基因组识别被测样本基因组上的候选变异位点，并对候选变异点位进行分类；根据候选变异点位的类型利用候选变异位点构建局部单体型序列，并对构建好的局部单体型序列在样本间整合，获得整合后的单体型序列集合；利用整合后的单体型序列检测被测样本基因组的变异位点的基因型；遍历群体内所有被测样本基因组，并重复执行步骤一到三，获得群体内所有变异基因型。本发明用于群体基因组联合变异检测。
-
公开(公告)号：CN114093523B
公开(公告)日：2022-06-24
申请号：CN202111332027.7
申请日：2021-11-11
Applicant: 哈尔滨工业大学
Abstract: 一种新冠肺炎轻重症预测模型的构建方法及其应用，属于医学疾病预测技术领域。为了解决新冠肺炎轻重症患者预测技术中存在的问题，提供了新冠肺炎轻重症预测模型的构建方法，包括对缺失值和极端值进行处理，构建一组能反映患者轻重症发展风险的特征集FS，构建集成模型EM来将多个基线模型优势互补，根据功能关联特征扩展缺失特征四个步骤。结果表明本发明所述的构建方法能够很好的处理缺失值和极端值，提升预测模型的多个预测性能，多个预测指标上表现很好，能取得稳定的表现。利用本发明所述的构建方法获得的新冠肺炎轻重症预测模型能够在新冠肺炎患者感染的早期阶段较为准确地预测轻重症患者，有利于对重症患者提前进行重点护理和治疗。
-
公开(公告)号：CN114168708B
公开(公告)日：2022-06-14
申请号：CN202111351440.8
申请日：2021-11-15
Applicant: 哈尔滨工业大学
IPC: G06F16/33 , G06F16/335 , G16B50/30
Abstract: 本发明提供一种基于多域特征的个性化生物通路检索方法。属于生物通路检索技术领域。为了提供一种快速、准确和个性化的检索生物通路的方法。该方法会依据用户的在线操作不断优化检索系统内置的排序器，向用户提供快速、准确和个性化的生物通路检索服务。该方法的关键操作是构建通路查询请求与相关通路文档构成的二元组的生物通路检索特征。生物通路检索特征主要包括面向生物通路的自然语言特征、生物通路拓扑特征和用户历史行为相似度特征。
-
Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN113611366B
公开(公告)日：2022-04-29
申请号：CN202110854545.9
申请日：2021-07-26
Applicant: 哈尔滨工业大学(深圳)
Abstract: 本发明公开了一种基于图神经网络的基因模块挖掘方法、装置、计算机设备。其中，所述方法包括：根据基因表达谱数据，构造基因共表达网络，和基于该构造的基因共表达网络，通过图神经网络方式，配置社区隶属度矩阵，以及基于该配置的社区隶属度矩阵，通过设定阈值的方式，生成已知模块。通过上述方式，能够实现通过图神经网络表示学习的方式配置社区归属矩阵，再通过设定阈值的方式生成已知模块，实现在基因模块挖掘结果上能够允许有密集连接的多个基因可归属于不同的模块。
-
公开(公告)号：CN114301325A
公开(公告)日：2022-04-08
申请号：CN202111628343.9
申请日：2021-12-28
Applicant: 哈尔滨工业大学
Abstract: 基于旋转磁场抵消法提升网侧电感的三相集成充电系统，涉及三相集成充电系统网侧滤波电感提升领域。本发明为了解决九绕组电机及其配套的驱动逆变器复用为充电系统在充电模式下，如何提升充电模式下网侧等效滤波电感数值的问题。本发明充电系统包括电池、DC/DC变换器、九桥臂半桥逆变器、电容Cdc、九绕组电机、多个三相开关和双相开关，该系统在充电模式下，利用切换开关，改变九绕组的连接方式，从而将网侧等效滤波电感进行提升。本发明主要用于对三相集成充电系统网侧滤波电感进行提升。
-
公开(公告)号：CN114168708A
公开(公告)日：2022-03-11
申请号：CN202111351440.8
申请日：2021-11-15
Applicant: 哈尔滨工业大学
IPC: G06F16/33 , G06F16/335 , G16B50/30
Abstract: 本发明提供一种基于多域特征的个性化生物通路检索方法。属于生物通路检索技术领域。为了提供一种快速、准确和个性化的检索生物通路的方法。该方法会依据用户的在线操作不断优化检索系统内置的排序器，向用户提供快速、准确和个性化的生物通路检索服务。该方法的关键操作是构建通路查询请求与相关通路文档构成的二元组的生物通路检索特征。生物通路检索特征主要包括面向生物通路的自然语言特征、生物通路拓扑特征和用户历史行为相似度特征。
-
公开(公告)号：CN110782954B
公开(公告)日：2021-05-04
申请号：CN201911058898.7
申请日：2019-10-31
Applicant: 哈尔滨工业大学
Abstract: 本发明公开了一种预测癌细胞株中药物反应的权重模块化映射方法。所述癌细胞株中的药物反应计算所有药物与细胞株构成的关联对得分包括以下步骤：步骤1：首先计算药物di和药物dj之间的关系；步骤2：选择任意一个细胞株cseed作为种子结点，利用该细胞株cseed将药物集合划分为m个模块{M1,M2,...,Mm}，其中M1对应着s1个药物，M2对应着s2个药物，...Mm对应着sm个药物，并计算cseed的度m；步骤3：计算细胞株cseed与模块{M1,M2,...,Mm}中药物的关联得分集合本发明用以解决生物实验检测药物反应不仅费时费力，而且耗费大量资金的问题，且在预测效果上更优。
-
公开(公告)号：CN110782954A
公开(公告)日：2020-02-11
申请号：CN201911058898.7
申请日：2019-10-31
Applicant: 哈尔滨工业大学
Abstract: 本发明公开了一种预测癌细胞株中药物反应的权重模块化映射方法。所述癌细胞株中的药物反应计算所有药物与细胞株构成的关联对得分包括以下步骤：步骤1：首先计算药物di和药物dj之间的关系；步骤2：选择任意一个细胞株cseed作为种子结点，利用该细胞株cseed将药物集合划分为m个模块{M1,M2,...,Mm}，其中M1对应着s1个药物，M2对应着s2个药物，...Mm对应着sm个药物，并计算cseed的度m；步骤3：计算细胞株cseed与模块{M1,M2,...,Mm}中药物的关联得分集合本发明用以解决生物实验检测药物反应不仅费时费力，而且耗费大量资金的问题，且在预测效果上更优。
-
-
-
-
-
-
-
-
-
Search Results
91
records
(took 0.037 seconds)
