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公开(公告)号：CN114350748A
公开(公告)日：2022-04-15
申请号：CN202111659745.5
申请日：2021-12-30
Applicant: 厦门大学
IPC: C12Q1/6806 , C12N15/10 , C40B50/06
Abstract: 本发明提供了一种快速单细胞建库方法，该方法包括：1)裂解单细胞，释放所述单细胞中的全基因组DNA；2)向第1)步所得全基因组DNA加入Tn5转座酶，将DNA切割为DNA片段；3)对所得DNA片段进行PCR扩增，在扩增过程中引入索引条形码，为每个单细胞添加细胞索引条形码，PCR扩增试剂中还包含片段化终止液，以终止片段化；4)纯化扩增后的DNA片段，得到单细胞基因组文库。本发明还提供了集成于数字微流控芯片的快速单细胞全基因组建库方法，在前述方法基础上，将该方法集成于数字微流控芯片，实现自动化的文库构建。本发明方法免去预扩增步骤，但仍能降低扩增偏倚，并获得更好的测序覆盖率，为CNV和SNV分析提供有利信息，并大大缩短测序时间、试剂和人力成本。
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公开(公告)号：CN111440696A
公开(公告)日：2020-07-24
申请号：CN202010121341.X
申请日：2020-02-26
Applicant: 厦门大学
Abstract: 本发明涉及胎儿细胞捕获模块、用于胎儿细胞捕获的微流控芯片，及它们的使用方法。所述胎儿细胞捕获模块包括细胞捕获载体和用于特异性捕获所述细胞的识别分子，该识别分子经由包含二硫键的有机偶联体连接至载体表面。所述用于胎儿细胞捕获的微流控芯片表面经由包含二硫键的有机偶联体修饰以特异性捕获胎儿细胞的识别分子，该识别分子在捕获细胞后，通过化学切割所述有机偶联体中的二硫键实现对所述细胞的释放。本发明的捕获模块、微流控芯片及它们的使用可实现未经预处理全血的胎儿细胞捕获，捕获率高，细胞损失小，且细胞释放操作简单、作用准确，使胎儿细胞的高效、无损释放及全基因组分析成为可能。
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公开(公告)号：CN103819501B
公开(公告)日：2015-11-04
申请号：CN201410101673.6
申请日：2014-03-19
Applicant: 厦门大学
IPC: C07F9/141 , C07H21/04 , C07H1/00 , C08F290/00 , C08F220/56 , C12Q1/68
Abstract: 一种甲基丙烯基亚磷酰胺单体及其合成方法，涉及水凝胶。所述甲基丙烯基亚磷酰胺单体的分子式为C(38+n1)H(50+2n1)N3O6P，其中，n1为CH2基团的个数，n1=1～3。先制备acrylic-OH2，再制备acylic-DMT，最后在氮气保护下，将acylic-DMT和N,N-二异丙基乙基胺混合后，用二氯甲烷溶解，再加入2-氰乙基N,N-二异丙基氯代亚磷酰胺反应后用硅胶柱层析分离，得甲基丙烯基亚磷酰胺单体。合成原料廉价，步骤简单可行；合成DNA后纯化效率更高，进而可以得到更高的聚合效率；可以根据需要嵌入到DNA序列的任何一个位置。
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公开(公告)号：CN103435648A
公开(公告)日：2013-12-11
申请号：CN201310383256.0
申请日：2013-08-29
Applicant: 厦门大学
IPC: C07F9/645
Abstract: 具有光交联基团双吖丙啶的DNA碱基类似物及合成方法，涉及一种DNA碱基类似物及其合成方法。所述具有光交联基团双吖丙啶的DNA碱基类似物为双吖丙啶亚磷酰胺单体。在化合物1的基础上连接带有两个羟基的中间产物，引入原料1-氨基-己二醇，利用二环己基碳二亚胺和1-羟基苯并三氮唑的缩合作用下形成酰胺键，得到中间产物2，再引入原料4-4’-二甲氧基三苯基氯甲烷，以吡啶和二氯甲烷为溶剂，4-二甲氨基吡啶的催化作用下，得到中间产物3并引入原料2-氰乙基N,N-二异丙基氯代亚磷酰胺，以N,N-二异丙基乙基胺为碱和催化剂，二氯甲烷为溶剂，在无水无氧反应条件下，得到最终产物。
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公开(公告)号：CN103435648B
公开(公告)日：2015-09-23
申请号：CN201310383256.0
申请日：2013-08-29
Applicant: 厦门大学
IPC: C07F9/645
Abstract: 具有光交联基团双吖丙啶的DNA碱基类似物及合成方法，涉及一种DNA碱基类似物及其合成方法。所述具有光交联基团双吖丙啶的DNA碱基类似物为双吖丙啶亚磷酰胺单体。在化合物1的基础上连接带有两个羟基的中间产物，引入原料1-氨基-己二醇，利用二环己基碳二亚胺和1-羟基苯并三氮唑的缩合作用下形成酰胺键，得到中间产物2，再引入原料4-4’-二甲氧基三苯基氯甲烷，以吡啶和二氯甲烷为溶剂，4-二甲氨基吡啶的催化作用下，得到中间产物3并引入原料2-氰乙基N,N-二异丙基氯代亚磷酰胺，以N,N-二异丙基乙基胺为碱和催化剂，二氯甲烷为溶剂，在无水无氧反应条件下，得到最终产物。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN103819501A
公开(公告)日：2014-05-28
申请号：CN201410101673.6
申请日：2014-03-19
Applicant: 厦门大学
IPC: C07F9/141 , C07H21/04 , C07H1/00 , C08F290/00 , C08F220/56 , C12Q1/68
Abstract: 一种甲基丙烯基亚磷酰胺单体及其合成方法，涉及水凝胶。所述甲基丙烯基亚磷酰胺单体的分子式为C(38+n1)H(50+2n1)N3O6P，其中，n1为CH2基团的个数，n1=1～3。先制备acrylic-OH2，再制备acylic-DMT，最后在氮气保护下，将acylic-DMT和N,N-二异丙基乙基胺混合后，用二氯甲烷溶解，再加入2-氰乙基N,N-二异丙基氯代亚磷酰胺反应后用硅胶柱层析分离，得甲基丙烯基亚磷酰胺单体。合成原料廉价，步骤简单可行；合成DNA后纯化效率更高，进而可以得到更高的聚合效率；可以根据需要嵌入到DNA序列的任何一个位置。
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公开(公告)号：CN119432990A
公开(公告)日：2025-02-14
申请号：CN202411881341.4
申请日：2024-12-19
Applicant: 厦门大学
IPC: C12Q1/6869
Abstract: 一种组织切片的空间转录组原位测序方法，涉及基因测序领域，包括：1)原位捕获mRNA；2)逆转录得cDNA；3)去组织保留cDNA；4)cDNA探针杂交；5)原位扩增；6)荧光探针解码测序；7)清洗探针，多轮测序。本发明原位捕获RNA并逆转录为cDNA，实现核酸印迹转移，去除背景干扰，解决RNA降解问题，允许多轮杂交增检测通量。核酸序列共价结合玻片，防信号点移位脱落。用DNA编码挂锁探针识别基因，扩增放大信号，测序解码揭示基因表达。清洗探针后，换探针杂交扩增，提高通量，减少空间拥挤和荧光信号拥挤。
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公开(公告)号：CN108535228A
公开(公告)日：2018-09-14
申请号：CN201810289478.9
申请日：2018-04-03
Applicant: 厦门大学
Abstract: 本发明涉及一种从孕妇外周血中分离游离胎儿细胞的方法。该方法利用微流控芯片的细胞分离作用以及特异性亲和识别原理，实现了孕妇外周血中游离胎儿细胞(胎儿有核红细胞、滋养层细胞等)的高效率、高纯度捕获分离。在微流控芯片内，设计了具有特定几何排布方式的微阵列结构，以及修饰上具有亲和识别作用的分子基团如核酸适体、抗体、多肽等。调节微阵列结构的参数，可以调控不同尺寸的胎儿细胞与微阵列的碰撞效率，进而实现不同尺寸胎儿细胞的捕获富集。
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公开(公告)号：CN115881222A
公开(公告)日：2023-03-31
申请号：CN202211036695.X
申请日：2022-08-26
Applicant: 厦门大学
Abstract: 本发明公开了一种原位DNA微阵列合成系统的合成序列计算方法，包括：得到整数序列集；构建概率数据库，构建概率索引数据库；进入迭代过程，扩增结点中的序列，更新扩增后结点的匹配位置，更新迭代结点集；计算迭代结点集中所有结点的指导值；从迭代结点集中，选出主导结点集，根据主导结点集进行分枝修剪；清空候选结点集，按指导值从大到小从迭代结点集中选取指定个数个候选结点，添加入候选结点集；从迭代结点集中随机选选取指定个数个候选结点，添加入候选结点集中；对扩增完成的整数序列进行检验，若为序列集编码后的整数序列集的公共超序列，则按编码规则进行译码，得到一串字符串。它能有效提高原位DNA微阵列合成系统的效率。
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