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公开(公告)号:CN111118038B
公开(公告)日:2020-10-30
申请号:CN202010041623.9
申请日:2020-01-15
Applicant: 南京林业大学
IPC: C12N15/31 , C07K14/37 , C12Q1/6895 , C12Q1/6844 , C12Q1/04 , C12N15/11 , C12R1/645
Abstract: 本发明公开了一种冬生疫霉的检测新靶标Phibe_s00003g00002.1及其专用检测引物和检测方法,该检测靶标Phibe_s00003g00002.1的DNA序列如SEQ ID NO:1所示,蛋白序列如SEQ ID NO:2所示。同时,公开了特异性检测靶标Phibe_s00003g00002.1的RPA检测技术的特异性引物及探针组合,其正向引物序列如SEQ ID NO:3所示,反向引物序列如SEQ ID NO:4所示,探针序列如SEQ ID NO:5所示。本发明发现了新的检测靶标,且基于该靶标的快速检测方法准确性高、特异性强、操作方便、实用性好、实现了恒温扩增,同时本发明设计的引物及探针组合用于RPA‑LFD检测技术,其特异性强,灵敏度高,为冬生疫霉(Phytophthora hibernalis)的检测提供了新的技术平台。
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公开(公告)号:CN109825627B
公开(公告)日:2019-10-22
申请号:CN201910241234.8
申请日:2019-03-28
Applicant: 南京林业大学
IPC: C12Q1/6895 , C12Q1/6844 , C12Q1/04 , C12N15/11 , C12R1/645
Abstract: 本发明公开了一种RPA‑侧流层析检测丁香疫霉的引物和探针组合及其应用。本发明所使用的引物探针组RPA扩增效果好,条带特异性强,与其他病菌无交叉反应,在检测区的有阳性反应,增加了检测的灵敏性。本发明系首次采用RPA层析技术建立快速检测丁香疫霉的方法,并通过特异性和灵敏度评价,可用于实际样品检测,同时为检疫性疫霉菌的检测提供了新的技术平台,在病害侵染初期鉴定出病原物,能够对出入境水果中的丁香疫霉进行检测。本发明对丁香疫霉引起的疫病和对减少农药盲目使用,降低生产成本,减少农药的环境污染也具有重要意义。
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公开(公告)号:CN110093446A
公开(公告)日:2019-08-06
申请号:CN201910467152.5
申请日:2019-05-31
Applicant: 南京林业大学
IPC: C12Q1/6895 , C12Q1/6844 , C12Q1/6804 , C12N15/11 , C12R1/645
Abstract: 本发明公开了一种RPA-LFD技术检测樟疫霉的引物和探针组合及其应用方法。采用所述引物及探针组合检测樟疫霉的具体方法为:1)提取待测样本DNA;2)以DNA为模板,进行RPA扩增;3)应用LFD进行扩增产物检测;当试纸条出现两条棕色条带,一条位于质控区内,一条位于检测区,则结果为阳性,表明样本中含有樟疫霉;当试纸条只有质控区出现一条棕色条带,检测区没有条带,则结果是阴性,表明样本中不含有樟疫霉。本发明所提供的引物及探针组合RPA扩增效果好,条带特异性强、灵敏度高,为樟疫霉的检测提供了新的技术手段。
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公开(公告)号:CN110079631A
公开(公告)日:2019-08-02
申请号:CN201910391877.0
申请日:2019-05-10
Applicant: 南京林业大学
IPC: C12Q1/6895 , C12Q1/6844 , C12Q1/04 , C12R1/645
Abstract: 本发明公开了一种高通量检测8种疫霉菌的分子检测方法。在本发明中,将LAMP技术与96孔板结合建立了一种能够同时检测8种疫霉菌的高通量检测技术。针对8种疫霉菌(寄生疫霉Phytophthora parasitica、Phytophthora tentaculata、致病疫霉Phytophthora infestans、草莓疫霉Phytophthora fragariae、辣椒疫霉Phytophthora capsici、掘氏疫霉Phytophthora drechsleri、恶疫霉Phytophthora cactorum、大雄疫霉Phytophthora megasperma)的同一个靶标基因Ypt1建立了Ypt1-LAMP检测引物、试剂盒和方法。本发明的检测方法准确性高、特异性强、操作方便、实用性好,为疫霉菌的检测提供了高通量快速检测技术,对疫霉菌疫病防治和监测具有重要和深远意义。
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公开(公告)号:CN109897910A
公开(公告)日:2019-06-18
申请号:CN201910230115.2
申请日:2019-03-25
Applicant: 南京林业大学
IPC: C12Q1/6895 , C12Q1/6844 , C12Q1/04 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种基于RPA-侧流层析试纸条技术快速精准检测尖镰孢菌的方法,包括1)提取待测样本DNA;2)以DNA为模板,进行RPA扩增;3)应用侧流层析试纸条进行扩增产物检测;当试纸条出现两条棕色条带,一条位于质控区内,一条位于检测区,则结果为阳性,表明样本中含有尖镰孢菌;当试纸条只有质控区出现一条棕色条带,检测区没有条带,则结果是阴性,表明样本中不含有尖镰孢菌。本发明所使用的引物探针组RPA扩增效果好,条带特异性强,与其他病菌无交叉反应,在检测区的有阳性反应,增加了检测的灵敏性,为尖镰孢菌的检测提供了新的技术平台,同时在病害侵染初期鉴定出病原物,能够对苗圃地或者发病植株中的尖镰孢菌进行检测。
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公开(公告)号:CN117004751B
公开(公告)日:2024-03-01
申请号:CN202310380212.6
申请日:2023-04-11
Applicant: 南京林业大学
IPC: C12Q1/6895 , C12Q1/6844 , C07K14/37 , C12N15/31 , C12N15/11 , C12R1/77
Abstract: 本 发 明 公 开 了 一 种 茄 镰 孢 菌(Fusariumsolani)的检测新靶标g7594及其检测引物、检测方法和检测试剂盒,该检测靶标g7594的蛋白序列如SEQ ID NO:1所示,编码该蛋白的DNA序列如SEQ ID NO:2所示。同时,本发明还公开了特异性检测靶标g7594的引物及探针组合,其正向引物Fsg7594RPA‑F1序列如SEQ ID NO:3所示,其反向引物Fsg7594RPA‑R1序列如SEQ ID NO:4所示,ssDNArepoter序列如SEQ ID NO:5所示,FsCrRNA如SEQ ID NO:6所示。建立CRISPR‑Cas12a荧光检测,其特异性强,灵敏度高,证明g7594适合作为茄镰孢菌(Fusariumsolani)的检测靶标,从而实现对于植物上携带的有害病原茄镰孢菌F.solani实现分子检测。
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公开(公告)号:CN117004751A
公开(公告)日:2023-11-07
申请号:CN202310380212.6
申请日:2023-04-11
Applicant: 南京林业大学
IPC: C12Q1/6895 , C12Q1/6844 , C07K14/37 , C12N15/31 , C12N15/11 , C12R1/77
Abstract: 本发明公开了一种茄镰孢菌(Fusariumsolani)的检测新靶标g7594及其检测引物、检测方法和检测试剂盒,该检测靶标g7594的蛋白序列如SEQ ID NO:1所示,编码该蛋白的DNA序列如SEQ ID NO:2所示。同时,本发明还公开了特异性检测靶标g7594的引物及探针组合,其正向引物Fsg7594RPA‑F1序列如SEQ ID NO:3所示,其反向引物Fsg7594RPA‑R1序列如SEQ ID NO:4所示,ssDNArepoter序列如SEQ ID NO:5所示,FsCrRNA如SEQ ID NO:6所示。建立CRISPR‑Cas12a荧光检测,其特异性强,灵敏度高,证明g7594适合作为茄镰孢菌(Fusariumsolani)的检测靶标,从而实现对于植物上携带的有害病原茄镰孢菌F.solani实现分子检测。
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公开(公告)号:CN116083449B
公开(公告)日:2023-07-28
申请号:CN202310283320.1
申请日:2023-03-22
Abstract: 本发明公开了一种旋柄腐霉(Phytopythiumhelicoides)的检测新靶标Phe_g13067及其检测引物,该检测靶标Phe_g13067的DNA序列如SEQ IDNO:1所示,蛋白序列如SEQ ID NO:2所示。同时,还公开了特异性检测靶标Phe_g13067的PCR检测技术的特异性引物组合,其正向引物序列如SEQ ID NO:3所示,反向引物序列如SEQ ID NO:4所示。同时,本发明所发掘的检测靶标和其设计的引物组合用于普通PCR,其特异性强,灵敏度高,证明Phe_g13067适合旋柄腐霉(Phytopythiumhelicoides)的检测靶标。本发明发掘的新靶标和基于该靶标建立的检测方法对于港口的进境植物上携带的Pp.helicoides实现即检即防,保护我国生态安全具有重要作用。
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公开(公告)号:CN116120412B
公开(公告)日:2023-07-18
申请号:CN202310162180.2
申请日:2023-02-24
Applicant: 南京林业大学
Abstract: 本发明公开了一种来源于樟疫霉的效应子蛋白SCR83830及其编码基因和应用。效应子蛋白SCR83830的氨基酸序列为SEQ ID No.1,编码该氨基酸的核苷酸序列为SEQ ID No.2。该基因控制表达的蛋白质能够参与疫霉侵染本氏烟草的过程,诱导死亡前体蛋白Bax诱导的植物细胞死亡。利用其诱导植物细胞死亡的功能可使植物细胞在致死因素存在时失去生理活性,可在农林复合经营体中降低有害植物的数量,为经营提供有利的理论基础和实际的经济效益,也为更加全面的了解樟疫霉的基因功能提供了实践应用价值。
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公开(公告)号:CN114685631B
公开(公告)日:2023-04-14
申请号:CN202210450845.5
申请日:2022-04-27
Applicant: 南京林业大学
Abstract: 本发明公开了一种来源于樟疫霉的SCR效应子蛋白SCR93258及其编码基因和应用。该蛋白的氨基酸序列为SEQIDNo.1,编码改氨基酸的核苷酸序列为SEQIDNo.2,实验证明,该基因控制表达的蛋白质能够参与疫霉侵染本氏烟草的过程,引起凋亡前体蛋白Bax诱导的植物植物细胞死亡。本发明对于充实植物樟疫霉与寄主互作的分子机制,以及建立植物樟疫霉病害的综合防治技术都有重要意义。
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