一种单细胞转录组的测序方法

    公开(公告)号:CN109971843B

    公开(公告)日:2022-11-11

    申请号:CN201711447883.0

    申请日:2017-12-27

    Abstract: 本发明属于生物技术领域,公开了一种单细胞转录组的测序方法。本发明使用了PAP/PGP在RNA链的尾部加入多聚A/G,使RNA稳定性增加,同时产一条可以用于逆转录和cDNA合成的延伸链。本发明在下游进行有效RNA富集时,采用标记核糖体DNA探针的磁珠纯化小片段PCR非特异性产物,使用半退火夹板杂交,去除5s,5.8s,18s和28s大小的cDNA形式存在的rRNA,并在测序时减少大量无效的Reads数。本发明可以对单个真核细胞进行一站式non‑coding RNA、microRNA和mRNA的总转录组测序并产生该转录组的表达矩阵,摆脱了一个细胞只能进行一种测序的应用局限。

    用于法医学个体识别的分子标记和试剂盒

    公开(公告)号:CN106566873B

    公开(公告)日:2022-08-23

    申请号:CN201510953000.8

    申请日:2015-12-17

    Applicant: 复旦大学

    Abstract: 本发明属法医遗传学技术领域,具体涉及用于法医学个体识别与亲子鉴定的分子标记和试剂盒。所述分子标记包含177个高分辨率单核苷酸多态遗传标记位点,其中的35个可由其它分子标记位点替代,具有非常明显优于其它分子标记系统的鉴别能力(达到2.096×10‑71到7.590×10‑71);所述分子标记适用于不同分型技术平台,且与当前主要使用的短片段重复遗传标记试剂盒兼容。所述分子标记中所有40及以上的分子标记可组合应用,或其中的一个或多个分子标记可与其它相同应用的分子标记构成应用。本发明还提供基于第二代测序平台Ion Torrent的试剂盒。

    单核苷酸多态位点分型算法

    公开(公告)号:CN106570350A

    公开(公告)日:2017-04-19

    申请号:CN201510955436.0

    申请日:2015-12-17

    Applicant: 复旦大学

    Inventor: 金力 李士林 王一

    CPC classification number: G06F19/22

    Abstract: 本发明属于生物信息学领域,具体涉及用于从原始测序数据中对单核苷酸多态位点(Single nucleotide polymorphisms,SNP)进行精确分型的算法。该算法基于统计学和群体遗传学原理,可对样本的指定SNP位点进行分型,且对该分型结果进行相应的质量评估。本发明的标准质量分数能精确的评价分型的准确率,且非常容易在实际工作中使用。可进一步作为实际法医学工作中标准化的质量统计量。

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