动脉粥样硬化的识别模型的构建方法

    公开(公告)号:CN110111841B

    公开(公告)日:2023-03-10

    申请号:CN201810010227.2

    申请日:2018-01-05

    Abstract: 本发明提供了一套基于宏基因组测序的动脉粥样硬化早期识别模型构建技术。本发明采用国际先进的Illumina NovaSeq平台,对人的粪便和口腔菌群宏基因组DNA采用Nextera转座子鸟枪宏基因组测序技术,配合传统的高通量测序,并产生宏基因组数据。进而运用数据库和系统等进行宏基因组测序数据分析。通过对数据进行训练集和验证机矫正,并配合机器学习和神经网络算法,产生可靠的早期动脉粥样硬化识别模型,并通过扩大宏基因组生物标志物进行验证。本发明基于较大规模的系统性队列研究,通过队列将病程变化和菌谱进行关联性分析,从而对早期标记物进行判断,在预防医学领域提供了更具价值的系统性研究方法。

    一种单细胞转录组的测序方法

    公开(公告)号:CN109971843A

    公开(公告)日:2019-07-05

    申请号:CN201711447883.0

    申请日:2017-12-27

    Abstract: 本发明属于生物技术领域,公开了一种单细胞转录组的测序方法。本发明使用了PAP/PGP在RNA链的尾部加入多聚A/G,使RNA稳定性增加,同时产一条可以用于逆转录和cDNA合成的延伸链。本发明在下游进行有效RNA富集时,采用标记核糖体DNA探针的磁珠纯化小片段PCR非特异性产物,使用半退火夹板杂交,去除5s,5.8s,18s和28s大小的cDNA形式存在的rRNA,并在测序时减少大量无效的Reads数。本发明可以对单个真核细胞进行一站式non‑coding RNA、microRNA和mRNA的总转录组测序并产生该转录组的表达矩阵,摆脱了一个细胞只能进行一种测序的应用局限。

    VANGL2突变基因及其检测方法和用途

    公开(公告)号:CN102168087A

    公开(公告)日:2011-08-31

    申请号:CN201010115179.7

    申请日:2010-02-26

    Applicant: 复旦大学

    Abstract: 本发明属基因检测技术领域,涉及神经管畸形相关VANGL2突变基因及其检测方法和用途,所述的VANGL2突变基因,其含有VANGL2基因序列,并且还含有18487C→T,20598C→T或24549T→C杂合或纯合突变中的一种或一种以上;本发明从待测样品中得到核苷酸序列与VANGL2正常基因的序列进行比较,核对突变是否为18487C→T,20598C→T或24549T→C中的一种或多种,以及按照正常读码框架进行翻译以确定是否存在84S→F,353R→C或者437F→S氨基酸突变位点;本发明还公开了通过测序或SNaPshot检测所述VANGL2突变基因的试剂盒。本发明所述VANGL2突变基因及检测方法将有利于进一步认识神经管畸形的发生机理,并通过在临床上开展孕前VANGL2突变筛查工作对神经管畸形的发生进行孕前预警。

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