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公开(公告)号:CN107099531A
公开(公告)日:2017-08-29
申请号:CN201710369461.X
申请日:2017-05-23
Applicant: 华南农业大学
IPC: C12N15/113 , C12N15/82 , A01H5/00
Abstract: 本发明公开了一种花药特异表达启动子PV4及其应用。该启动子PV4的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示;或是在严格条件下与SEQ ID NO:1限定的DNA序列杂交的DNA分子;或是与SEQ ID NO:1限定的DNA序列具有90%以上相似性,且能调控目的基因在花药中特异表达的DNA分子。本发明还提供了含有该启动子的用于无筛选标记的植物重组表达载体。该载体能在单子叶植物中去除筛选标记基因,培育无筛选标记转基因植物,在基因工程领域具有重要的应用前景。
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公开(公告)号:CN113832252B
公开(公告)日:2024-09-06
申请号:CN202111288746.3
申请日:2021-11-02
Applicant: 华南农业大学 , 广州瑞科基因科技有限公司
IPC: C12Q1/6895 , C12Q1/6869 , C12Q1/6806 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种籼粳稻SNP位点基因型检测的方法,涉及生物技术领域。通过对水稻全基因组进行超低深度测序,获取核心SNP位点的基因型,经过近距离SNP的基因型组成分析,校正后,综合判定核心SNP位点的基因型。本发明提供的方法可以在超低的测序深度(2‑10倍)下实现高达90%的检测正确率。极大程度上降低了抽样数量,降低了工作量,优化了测试区域,使得检测结果更为准确。
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公开(公告)号:CN115725596B
公开(公告)日:2024-07-09
申请号:CN202111016957.1
申请日:2021-08-31
Applicant: 华南农业大学
Abstract: 本发明公开了S58控制亚非稻种间杂种不育的关键基因及其应用。本发明通过图位克隆、基因预测及表达分析,在亚非稻种间杂种不育遗传座位S58的定位区间中鉴定到了相关的候选基因,并明确了在非洲稻特异且紧密连锁的基因S58A1和S58A3是控制S58座位介导的亚非稻种间杂种不育的关键基因。在此基础上,通过将非洲稻中的S58A1和S58A3同时功能敲除,获得了自身育性正常的纯合突变系,利用此突变系与亚洲稻亲本杂交,可消除S58座位介导的杂种不育效应,获得育性恢复正常的突变型杂种,为实现水稻种间杂种优势利用,提高水稻产量提供了新的分子育种策略,具有重要应用价值。
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公开(公告)号:CN114990144B
公开(公告)日:2024-06-14
申请号:CN202210521633.1
申请日:2022-05-13
Applicant: 华南农业大学
Abstract: 本发明公开了一种由特异核苷酸序列引导的缺刻酶介导的DNA组装载体及其应用。本发明所述DNA组装载体包含一个由特异核苷酸序列、具有筛选标记功能的基因表达盒和缺刻酶位点组成的一种由特异核苷酸序列引导的缺刻酶组装元件(UNiE),可用于长片段DNA克隆和多基因片段的高效组装。本发明同时将UNiE元件与多基因叠加系统(TGSII)相结合,构建了一个组装效率更高的新型多基因叠加系统(TGSII‑UNiE),实现了对多基因的高效组装,具有效率高、操作简便和成本低的特点。
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公开(公告)号:CN113832147B
公开(公告)日:2024-06-14
申请号:CN202111051247.2
申请日:2021-09-08
Applicant: 华南农业大学
IPC: C12N15/11 , C12P19/34 , C12Q1/6848
Abstract: 本发明公开了一种高效、特异地合成与扩增大片段DNA的PCR引物、方法及应用。本发明通过特别设计扩增引物,在正向引物和反向引物5'端添加相同的任意短序列,使扩增序列的单链DNA末端形成反向重复序列并配对产生发夹结构,对引物二聚体和短小的非特异DNA片段的扩增有良好的抑制效果;而较大的目标DNA片段末端难以相互配对不产生发夹结构,因而可避免非特异产物的竞争而被高效地特异性扩增。进一步,本发明使用嵌套式交错变温内循环,可优化目标序列的不同GC含量区间的有效延伸,与上述抑制效果的倍加效应最终提高PCR的扩增效率和特异性;本发明可提高大片段DNA序列从头合成的能力,从不同物种的基因组等各种模板扩增大片段目标DNA,扩增的DNA片段可应用于载体克隆、表达和基因组测序等目的,在分子生物学、合成生物学和生物技术领域具有重要的应用价值。
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公开(公告)号:CN117894369A
公开(公告)日:2024-04-16
申请号:CN202310615088.7
申请日:2023-05-26
Applicant: 华南农业大学
Abstract: 本发明公开了一种基于选择性清除SNP引导的植物环境适应性候选基因的筛选方法,先对不同环境适应性的植物品种进行比较基因组选择性清除分析,获得该植物环境适应性分化相关的选择性清除SNP位点的基因组学数据;再将获得的植物基因组SSNP信息与植物QTL数据库中环境适应性分化相关QTLs初步定位染色体区间的信息结合,即可快速筛选到与环境适应性相关的候选基因。相较于传统的图位克隆,本发明能快速确定植物环境适应性基因,实效性高。本发明同时为植物生态环境适应性差异下非生物胁迫的分子育种提供新思路。
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公开(公告)号:CN117659210A
公开(公告)日:2024-03-08
申请号:CN202311635845.3
申请日:2023-11-30
Applicant: 华南农业大学
IPC: C07K19/00 , C12N15/82 , C12N15/113 , C12N15/12
Abstract: 本发明公开了一种用作植物双碱基编辑器的重组融合蛋白及其应用,所述重组融合蛋白包含从N端到C端依次连接的1个胞嘧啶脱氨酶、1个腺嘌呤脱氨酶、1个单链DNA结合结构域、1个SpCas9变体和2个尿嘧啶糖基化酶抑制蛋白。本发明克服了目前单碱基编辑器的碱基替换类型单一以及双碱基编辑器的编辑成功率低的技术缺陷,提供了一种高效的植物双碱基编辑器,同时编辑双碱基的效率高,具有无靶序列偏好性、编辑窗口窄且脱靶率低的优势,能够广靶向识别NG‑PAM并进行多靶点编辑,在植物的基因功能的研究和遗传改良方面具有广泛的应用前景。
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公开(公告)号:CN113930538B
公开(公告)日:2024-01-23
申请号:CN202111288744.4
申请日:2021-11-02
Applicant: 华南农业大学 , 广州瑞科基因科技有限公司
IPC: C12Q1/6895 , G16B20/20
Abstract: 本发明公开了一种用于鉴定水稻适种区域的试剂盒及其预测方法和预测模型的构建,涉及水稻种植环境检测技术领域,水稻是比较重要的粮食作物,本发明通过高通量测序的方法,检测和分析籼稻和粳稻群体中SNP位点的基因型,获得了特定的目标SNP位点,采用机器学习和人工智能的方法,构建分析模型,用于对待测水稻品种进行适种区预测。综合预测准确率超过90%,相对于常规的适种区域评价方法,具有成本低,时间短等技术优势。
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公开(公告)号:CN114480443B
公开(公告)日:2023-06-20
申请号:CN202210248417.4
申请日:2022-03-14
Applicant: 华南农业大学
Abstract: 本发明提供了一种水稻株高株型调节基因OsUBR7的应用。SEQ ID NO:1所示OsUBR7基因或SEQ ID NO:2所示OsUBR7蛋白在调节水稻株高株型中的应用。本发明利用CRISPR/Cas敲除水稻OsUBR7基因或编辑其表达调控区,可使突变体株高适度降低,但保持其单株稻谷产量。本发明研究表明OsUBR7基因能有效调节水稻株高株型发育,可成为水稻半矮化育种和株型改良的新基因资源,保持水稻遗传的多样性,提高水稻的生产潜力,实现对水稻株高的定向改良。
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公开(公告)号:CN115925969A
公开(公告)日:2023-04-07
申请号:CN202210810655.X
申请日:2022-07-11
Applicant: 华南农业大学
Abstract: 本发明公开了一种可实现DNA小片段精准删除的腺嘌呤碱基编辑器及其构建与应用。所述腺嘌呤单碱基编辑器包含融合蛋白ABE8e‑EndoV,所述融合蛋白从N端到C端,依次包含腺嘌呤脱氨酶、Cas核酸酶的缺刻酶变体及肌苷I碱基删除修复核酸内切酶。本发明所述DNA小片段精准删除腺嘌呤碱基编辑器除了具有高效A‑G的碱基替换外,还具有可以产生从被脱氨的A碱基到Cas核酸酶蛋白切割位点区间的9‑13bp的小片段删除的特点。所述腺嘌呤碱基编辑器特别适用于动植物基因组中顺式作用元件的挖掘和研究,同时在目标基因的单碱基替换与饱和突变筛选等方面具有广泛的应用前景。
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