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公开(公告)号：CN113832252B
公开(公告)日：2024-09-06
申请号：CN202111288746.3
申请日：2021-11-02
Applicant: 华南农业大学 , 广州瑞科基因科技有限公司
IPC: C12Q1/6895 , C12Q1/6869 , C12Q1/6806 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种籼粳稻SNP位点基因型检测的方法，涉及生物技术领域。通过对水稻全基因组进行超低深度测序，获取核心SNP位点的基因型，经过近距离SNP的基因型组成分析，校正后，综合判定核心SNP位点的基因型。本发明提供的方法可以在超低的测序深度(2‑10倍)下实现高达90％的检测正确率。极大程度上降低了抽样数量，降低了工作量，优化了测试区域，使得检测结果更为准确。
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公开(公告)号：CN117894369A
公开(公告)日：2024-04-16
申请号：CN202310615088.7
申请日：2023-05-26
Applicant: 华南农业大学
Abstract: 本发明公开了一种基于选择性清除SNP引导的植物环境适应性候选基因的筛选方法，先对不同环境适应性的植物品种进行比较基因组选择性清除分析，获得该植物环境适应性分化相关的选择性清除SNP位点的基因组学数据；再将获得的植物基因组SSNP信息与植物QTL数据库中环境适应性分化相关QTLs初步定位染色体区间的信息结合，即可快速筛选到与环境适应性相关的候选基因。相较于传统的图位克隆，本发明能快速确定植物环境适应性基因，实效性高。本发明同时为植物生态环境适应性差异下非生物胁迫的分子育种提供新思路。
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公开(公告)号：CN113930538B
公开(公告)日：2024-01-23
申请号：CN202111288744.4
申请日：2021-11-02
Applicant: 华南农业大学 , 广州瑞科基因科技有限公司
IPC: C12Q1/6895 , G16B20/20
Abstract: 本发明公开了一种用于鉴定水稻适种区域的试剂盒及其预测方法和预测模型的构建，涉及水稻种植环境检测技术领域，水稻是比较重要的粮食作物，本发明通过高通量测序的方法，检测和分析籼稻和粳稻群体中SNP位点的基因型，获得了特定的目标SNP位点，采用机器学习和人工智能的方法，构建分析模型，用于对待测水稻品种进行适种区预测。综合预测准确率超过90％，相对于常规的适种区域评价方法，具有成本低，时间短等技术优势。
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公开(公告)号：CN113870946B
公开(公告)日：2025-04-25
申请号：CN202111290339.6
申请日：2021-11-02
Applicant: 华南农业大学 , 广州瑞科基因科技有限公司
IPC: G16B20/20
Abstract: 本发明公开了一种水稻SNP位点的筛选方法以及鉴定水稻品种的方法，涉及生物分子技术领域，本申请提出在筛选用于鉴定水稻品种的SNP位点前，先对用于获取SNP位点的水稻样本进行过滤，先过滤掉非核心群体样本后，再对SNP位点进行筛选和检测，这样能够显著提高SNP位点对于鉴定和分析特定水稻品种的针对性和有效性，为特定水稻品种的有效鉴定以及水稻优质异种基因图谱的构建提供了途径。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN117431266A
公开(公告)日：2024-01-23
申请号：CN202210857352.3
申请日：2022-07-20
Applicant: 华南农业大学
Abstract: 本发明公开了Osa‑miR166e‑3pi基因在调控籼稻抽穗期中的应用。本发明提供了一种能定向改造控制籼稻抽穗期的关键基因及其应用，即Osa‑miR166e‑3pi基因在调控籼稻抽穗期和创建水稻短生育期种质中的应用，为水稻育种及发育机制的研究提供新的基因资源。本发明还提供了一种使籼稻抽穗期提前的方法，利用所述方法可以创建得到抽穗期提前的籼稻，对培育不同全生育期的籼稻新品种、增强籼稻品种适应性具有重要意义。
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公开(公告)号：CN113870946A
公开(公告)日：2021-12-31
申请号：CN202111290339.6
申请日：2021-11-02
Applicant: 华南农业大学 , 广州瑞科基因科技有限公司
IPC: G16B20/20
Abstract: 本发明公开了一种水稻SNP位点的筛选方法以及鉴定水稻品种的方法，涉及生物分子技术领域，本申请提出在筛选用于鉴定水稻品种的SNP位点前，先对用于获取SNP位点的水稻样本进行过滤，先过滤掉非核心群体样本后，再对SNP位点进行筛选和检测，这样能够显著提高SNP位点对于鉴定和分析特定水稻品种的针对性和有效性，为特定水稻品种的有效鉴定以及水稻优质异种基因图谱的构建提供了途径。
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公开(公告)号：CN113930538A
公开(公告)日：2022-01-14
申请号：CN202111288744.4
申请日：2021-11-02
Applicant: 华南农业大学 , 广州瑞科基因科技有限公司
IPC: C12Q1/6895 , G16B20/20
Abstract: 本发明公开了一种用于鉴定水稻适种区域的试剂盒及其预测方法和预测模型的构建，涉及水稻种植环境检测技术领域，水稻是比较重要的粮食作物，本发明通过高通量测序的方法，检测和分析籼稻和粳稻群体中SNP位点的基因型，获得了特定的目标SNP位点，采用机器学习和人工智能的方法，构建分析模型，用于对待测水稻品种进行适种区预测。综合预测准确率超过90％，相对于常规的适种区域评价方法，具有成本低，时间短等技术优势。
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公开(公告)号：CN113832252A
公开(公告)日：2021-12-24
申请号：CN202111288746.3
申请日：2021-11-02
Applicant: 华南农业大学 , 广州瑞科基因科技有限公司
IPC: C12Q1/6895 , C12Q1/6869 , C12Q1/6806 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种籼粳稻SNP位点基因型检测的方法，涉及生物技术领域。通过对水稻全基因组进行超低深度测序，获取核心SNP位点的基因型，经过近距离SNP的基因型组成分析，校正后，综合判定核心SNP位点的基因型。本发明提供的方法可以在超低的测序深度(2‑10倍)下实现高达90％的检测正确率。极大程度上降低了抽样数量，降低了工作量，优化了测试区域，使得检测结果更为准确。
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公开(公告)号：CN116555463A
公开(公告)日：2023-08-08
申请号：CN202210109298.4
申请日：2022-01-28
Applicant: 华南农业大学 , 广州瑞科基因科技有限公司
IPC: C12Q1/6895 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种用于鉴别日本晴、台中65和中花11的InDel分子标记及其应用。本发明通过对日本晴、台中65和中花11这三个粳稻品种的全基因组序列进行双端比对等一系列比对筛选，获得了可用于鉴别上述三个粳稻品种的特异性InDel分子标记。在此基础上，本发明通过设计筛选检测所述InDel分子标记的引物组，开发了能快速、准确地对日本晴、台中65和中花11这三个粳稻品种进行区分，同时还可用于鉴定这三个粳稻品种纯度及其杂交F1代真伪的试剂盒和方法，且检测特异性高，鉴定成本低，通量高，适用于生产实践。
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