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公开(公告)号：CN113832252B
公开(公告)日：2024-09-06
申请号：CN202111288746.3
申请日：2021-11-02
Applicant: 华南农业大学 , 广州瑞科基因科技有限公司
IPC: C12Q1/6895 , C12Q1/6869 , C12Q1/6806 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种籼粳稻SNP位点基因型检测的方法，涉及生物技术领域。通过对水稻全基因组进行超低深度测序，获取核心SNP位点的基因型，经过近距离SNP的基因型组成分析，校正后，综合判定核心SNP位点的基因型。本发明提供的方法可以在超低的测序深度(2‑10倍)下实现高达90％的检测正确率。极大程度上降低了抽样数量，降低了工作量，优化了测试区域，使得检测结果更为准确。
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公开(公告)号：CN117894369A
公开(公告)日：2024-04-16
申请号：CN202310615088.7
申请日：2023-05-26
Applicant: 华南农业大学
Abstract: 本发明公开了一种基于选择性清除SNP引导的植物环境适应性候选基因的筛选方法，先对不同环境适应性的植物品种进行比较基因组选择性清除分析，获得该植物环境适应性分化相关的选择性清除SNP位点的基因组学数据；再将获得的植物基因组SSNP信息与植物QTL数据库中环境适应性分化相关QTLs初步定位染色体区间的信息结合，即可快速筛选到与环境适应性相关的候选基因。相较于传统的图位克隆，本发明能快速确定植物环境适应性基因，实效性高。本发明同时为植物生态环境适应性差异下非生物胁迫的分子育种提供新思路。
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公开(公告)号：CN113930538B
公开(公告)日：2024-01-23
申请号：CN202111288744.4
申请日：2021-11-02
Applicant: 华南农业大学 , 广州瑞科基因科技有限公司
IPC: C12Q1/6895 , G16B20/20
Abstract: 本发明公开了一种用于鉴定水稻适种区域的试剂盒及其预测方法和预测模型的构建，涉及水稻种植环境检测技术领域，水稻是比较重要的粮食作物，本发明通过高通量测序的方法，检测和分析籼稻和粳稻群体中SNP位点的基因型，获得了特定的目标SNP位点，采用机器学习和人工智能的方法，构建分析模型，用于对待测水稻品种进行适种区预测。综合预测准确率超过90％，相对于常规的适种区域评价方法，具有成本低，时间短等技术优势。
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公开(公告)号：CN112375766B
公开(公告)日：2022-04-29
申请号：CN202011393838.3
申请日：2020-12-02
Applicant: 华南农业大学
Inventor： 张群宇
IPC: C12N15/29 , C07K14/415 , C12N15/82 , C12N15/84 , A01H5/00 , A01H5/10 , A01H6/46 , C12Q1/6895 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种水稻抗氧化能力相关基因BRHIS1及其应用。所述BRHIS1基因的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示，其编码的蛋白的氨基酸序列如SEQ ID NO:2所示。本发明提供了的水稻调控氧化胁迫基因BRHIS1，是一个新的水稻响应环境胁迫基因，该基因可以调控水稻耐氧化胁迫能力。所述BRHIS1基因对培育耐氧化胁迫植物新品种，特别是培育耐氧化胁迫水稻新品种具有重要意义。为水稻育种及发育机制研究提供了新的基因资源，可以在调控水稻耐氧化胁迫方面得到应用。
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公开(公告)号：CN109735646A
公开(公告)日：2019-05-10
申请号：CN201910012381.8
申请日：2019-01-07
Applicant: 华南农业大学
IPC: C12Q1/6895 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种鉴定水稻品种的CAPS分子标记和方法及其应用。所述CAPS分子标记在粳稻中的核苷酸序列如SEQ ID NO：1所示，在籼稻中的序列如SEQ ID NO：2所示。本发明还提供了一种用于检测上述CAPS分子标记的引物组，其序列如SEQ ID NO：3～SEQ ID NO：4所示。本发明所提供的CAPS分子标记特异性高，能方便准确的地将水稻栽培品种进行籼稻和粳稻的种质资源区分。本发明提供的CAPS分子标记在实际应用中，只需PCR结合酶切，成本低、通量高、特异性高，适用于生产实践。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN107641152A
公开(公告)日：2018-01-30
申请号：CN201710954813.8
申请日：2017-10-13
Applicant: 华南农业大学
IPC: C07K14/415 , C12N15/29 , C12N15/82 , A01H5/00 , A01H6/46
Abstract: 本发明公开了一种水稻mTERF转录终止因子基因V14，其籼稻型V14-I的核苷酸序列如SEQ ID NO：1所示，编码的氨基酸序列如SEQ ID NO：3所示；其粳稻型V14-J的核苷酸序列如SEQ ID NO：2所示，编码的氨基酸序列如SEQ ID NO：4所示；V14基因的正常表达保证了水稻叶绿体发育，V14-J和V14-I均能回复v14突变体白化表型；另外，V14是一个新的水稻响应环境温度基因，该基因可以调控水稻耐冷能力，所述基因对培育耐冷植物新品种，特别是培育耐冷水稻新品种具有重要意义；为水稻育种及发育机制研究提供了新的基因资源，在调控水稻籼稻耐冷方面具有应用价值。
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公开(公告)号：CN101514342B
公开(公告)日：2011-05-18
申请号：CN200810167024.0
申请日：2008-10-09
Applicant: 华南农业大学
Abstract: 本发明涉及植物基因工程技术领域，具体涉及一种水稻细胞质雄性不育基因及其应用。本发明提供一种从水稻的线粒体基因组克隆的野败型杂交稻的细胞质雄性不育基因、其编码的蛋白质、含有所述基因DNA序列的载体及所述载体转化的宿主细胞。本发明的不育基因可通过基因工程技术，转化各种植物培育雄性不育性系，用于杂交种子生产，培育植物不育系；也可以根据所述基因序列信息产生特异性分子标记；还可以用这些标记鉴定含有不育基因的栽培稻或野生稻，培育水稻不育系。
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公开(公告)号：CN109628444B
公开(公告)日：2022-11-15
申请号：CN201910012369.7
申请日：2019-01-07
Applicant: 华南农业大学
IPC: C12N15/11 , C12Q1/6895
Abstract: 本发明公开了一种鉴定水稻品种的微卫星分子标记和方法及其应用。所述微卫星分子标记在粳稻中的核苷酸序列如SEQ ID NO：1所示，在籼稻中的序列如SEQ ID NO：2所示。本发明还提供了一种用于检测上述微卫星分子标记的引物组，其序列如SEQ ID NO：3～SEQ ID NO：4所示。本发明所提供的微卫星分子标记特异性高，能方便准确的地将水稻栽培品种进行籼稻和粳稻的种质资源区分。本发明提供的微卫星分子标记在实际应用中，只需PCR结合酶切，成本低、通量高、特异性高，适用于生产实践。
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公开(公告)号：CN113832252A
公开(公告)日：2021-12-24
申请号：CN202111288746.3
申请日：2021-11-02
Applicant: 华南农业大学 , 广州瑞科基因科技有限公司
IPC: C12Q1/6895 , C12Q1/6869 , C12Q1/6806 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种籼粳稻SNP位点基因型检测的方法，涉及生物技术领域。通过对水稻全基因组进行超低深度测序，获取核心SNP位点的基因型，经过近距离SNP的基因型组成分析，校正后，综合判定核心SNP位点的基因型。本发明提供的方法可以在超低的测序深度(2‑10倍)下实现高达90％的检测正确率。极大程度上降低了抽样数量，降低了工作量，优化了测试区域，使得检测结果更为准确。
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公开(公告)号：CN107641152B
公开(公告)日：2021-03-12
申请号：CN201710954813.8
申请日：2017-10-13
Applicant: 华南农业大学
IPC: C07K14/415 , C12N15/29 , C12N15/82 , A01H5/00 , A01H6/46
Abstract: 本发明公开了一种水稻mTERF转录终止因子基因V14，其籼稻型V14‑I的核苷酸序列如SEQ ID NO：1所示，编码的氨基酸序列如SEQ ID NO：3所示；其粳稻型V14‑J的核苷酸序列如SEQ ID NO：2所示，编码的氨基酸序列如SEQ ID NO：4所示；V14基因的正常表达保证了水稻叶绿体发育，V14‑J和V14‑I均能回复v14突变体白化表型；另外，V14是一个新的水稻响应环境温度基因，该基因可以调控水稻耐冷能力，所述基因对培育耐冷植物新品种，特别是培育耐冷水稻新品种具有重要意义；为水稻育种及发育机制研究提供了新的基因资源，在调控水稻籼稻耐冷方面具有应用价值。
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