一种自动解析稳定同位素标记糖链定量质谱数据的方法

    公开(公告)号:CN109738532B

    公开(公告)日:2022-07-22

    申请号:CN201811650390.1

    申请日:2018-12-31

    Applicant: 复旦大学

    Abstract: 本发明属蛋白质分析技术领域,具体为一种自动解析稳定同位素标记糖链定量质谱数据的方法。本发明利用工具gQuant对MALDI‑MS产出的同位素标记的糖链质量校正从而进行准确相对定量;该工具充分考虑了同位素标记相对定量数据的特点,对同位素交叠进行了准确的校正,并且特别地利用糖链的理论同位素分布模式和质谱碎裂特性设了基于最高理论同位素强度峰定量的算法,对高分子量和低丰度的糖链组分具有更高的定量准确性和鲁棒性。

    一种外膜蛋白酶T酶解组蛋白并进行质谱分析的方法

    公开(公告)号:CN109884163B

    公开(公告)日:2021-09-17

    申请号:CN201910177711.9

    申请日:2019-03-10

    Applicant: 复旦大学

    Abstract: 本发明属蛋白质分析技术领域,具体为一种外膜蛋白酶T酶解组蛋白并进行质谱分析的方法。本发明方法包括:从细胞或组织样本中采用酸提法抽提核心组蛋白,超滤纯化组蛋白后与外膜蛋白酶T进行特定条件下的孵育酶解,最后将酶解完成的肽段经过除盐处理,送入液相色谱‑质谱鉴定和定量翻译后修饰。本发明方法操作方便,步骤简单,避免了传统组蛋白分析中的衍生化步骤,可实现对组蛋白翻译后修饰的精确鉴定和定量。

    二维液相色谱接口在线浓缩溶剂交换装置

    公开(公告)号:CN109541051B

    公开(公告)日:2021-08-17

    申请号:CN201811336383.4

    申请日:2018-11-12

    Applicant: 复旦大学

    Abstract: 本发明提供一种二维液相色谱接口在线浓缩溶剂交换装置。所述二维液相色谱接口在线浓缩装置包括:一维液相色谱,溶剂稀释腔,在线浓缩柱,洗脱溶剂,二维液相色谱,废液收集装置。一维液相色谱用于样品第一维分离,分离开的馏分依次注入各溶剂稀释腔中。溶剂稀释腔预先注入远大于馏分体积的稀释溶剂,从而实现溶剂切换,将稀释后的馏分依次注入浓缩柱,目标物将全部浓缩于浓缩柱上,随后用小体积洗脱溶液将目标物从浓缩柱上洗脱进行后续二维分离或者进入检测器进行检测。本装置实现在线溶剂交换,避免线下冻干复溶等繁琐操作及不必要的样品损失;在线浓缩的特性,避免了一维样品馏分浓度过低不易被检测的问题,提高后续检测水平。

    一种一体化快速蛋白酶解方法

    公开(公告)号:CN112649490A

    公开(公告)日:2021-04-13

    申请号:CN202011429197.2

    申请日:2020-12-09

    Applicant: 复旦大学

    Abstract: 本发明涉及一种一体化快速蛋白酶解方法,其特征在于,在一个容器中,顺序向细胞或组织样品中加入裂解液、还原烷基化试剂及酶解试剂,使得细胞或组织样品依次经过裂解、还原烷基化及酶解过程;所述裂解液为RapiGest和多种蛋白酶抑制剂组Cocktail。与现有技术相比,本发明为一体化裂解酶解方法,整个过程均在同一离心管内进行,无需换管,极大的减少了样品的损失,有利于微量样品的处理;本发明使用与质谱兼容的还原烷基化试剂,使原本需要3步的反应,集成为2步完成,减少了反应步骤和反应时间,从而减少了样品吸附和损失;该方法具有一体化、操作简单、快速、适用范围广等特点,能广泛应用于蛋白质组学的样品处理中。

    一种基质辅助激光解吸离子源装置

    公开(公告)号:CN112582250A

    公开(公告)日:2021-03-30

    申请号:CN202011274432.3

    申请日:2020-11-15

    Applicant: 复旦大学

    Abstract: 本发明属于激光解吸电离技术领域,具体涉为一种基质辅助激光解吸离子源装置。本发明装置。本发明装置由二维运动机构、密封垫、密封垫安装座、绝缘板、靶板安装座、靶板、离子通道密封座、靶板舱门、离子引入装置、离子源密封盖板、离子源腔体配合连接组成。本装置通过简单巧妙的机械设计和靶板移动策略,可以方便快速地完成基质辅助激光解吸离子源靶板更换,结构简单可靠;在更换靶板时,无需复杂的机械装置实现真空密封。

    一种新型静电离子阱离子切向引入轨道偏转装置

    公开(公告)号:CN112185798A

    公开(公告)日:2021-01-05

    申请号:CN202011036181.5

    申请日:2020-09-27

    Applicant: 复旦大学

    Abstract: 本发明涉及一种新型静电离子阱离子切向引入轨道偏转装置,包括构成同心圆筒状的偏转外轨和偏转内轨,所述偏转外轨的电势高于所述偏转内轨的电势,所述偏转外轨和所述偏转内轨组成离子高势储存偏转腔O‑trap,所述高势储存偏转腔O‑trap的外端设有用以切向引入离子束的离子引入轨道,所述偏转内轨的中心处设有静电离子阱内电极,所述偏转内轨与所述静电离子阱内电极构成静电离子阱分析腔,所述偏转内轨上设有供离子引入静电离子阱分析腔中的离子变轨引入通道。与现有技术相比,本发明具有减少离子损失,提高信号强度,控制简单等优点。

    一种基于糖蛋白非糖肽的质谱多反应监测定量糖蛋白方法

    公开(公告)号:CN107576733B

    公开(公告)日:2020-11-24

    申请号:CN201710495427.7

    申请日:2017-06-26

    Applicant: 复旦大学

    Abstract: 本发明属分析化学技术领域,涉及糖蛋白质谱相对/绝对定量的方法,具体涉及一种基于糖蛋白非糖肽的质谱多反应监测定量糖蛋白方法,其包括:利用肼化学法对样品中的糖蛋白进行富集,用蛋白酶释放糖蛋白的非糖肽,利用色谱‑质谱鉴定技术对非糖肽进行鉴定,合成适用于MRM定量的标准肽段,然后对这些肽段的保留时间,能量,母子离子对进行质谱优化,并建立相应的数据库;并将肽段可用于样品中糖蛋白的绝对/相对定量。本发明方法步骤简单、操作方便、快速高效,可以实现糖基化的单个蛋白质/糖蛋白质组的快速、精准定量。

    一种基于96孔板的高通量糖基化肽段除盐富集方法

    公开(公告)号:CN107576800B

    公开(公告)日:2020-07-14

    申请号:CN201710496621.7

    申请日:2017-06-26

    Applicant: 复旦大学

    Abstract: 本发明属于蛋白质糖基化修饰领域,涉及一种利用96孔板对肽段进行高通量除盐和糖基化富集的新方法,其包括:通过离心,样品的肽段溶液在填装C18材料的96孔脱盐板上实现溶液的脱盐和有机相转换,洗脱的高有机相溶液即为ZIC‑HILIC材料的上样溶液,直接进入装填ZIC‑HILIC填料的96孔板中进行富集,富集的洗脱液可以浓缩或者直接进入质谱分析。本发明在富集的过程中,无需浓缩和溶液相转化,减少样品损失。在保持了传统的基于移液枪头的亲水相互作用小柱富集方法高特异性的同时,实现了大规模样本的快速富集,节省了样品处理时间。

    一种基质辅助激光解析质谱大批量上样装置

    公开(公告)号:CN109585254B

    公开(公告)日:2020-04-28

    申请号:CN201811356938.1

    申请日:2018-11-15

    Applicant: 复旦大学

    Abstract: 本发明涉及一种基质辅助激光解析质谱大批量上样装置。该上样装置包括可伸缩支架、上样孔道板、样品刮板和样品压板组成。可伸缩支架可调节大小以适应各种不同规格的靶板,调节高度以控制上样孔道板及靶板的距离。上样孔道板上孔道阵列与靶点阵列一致。用样品刮板将倾倒在上样孔道板上的待测样品简单快速的平均分配到各个孔道中,再使用样品压板使孔道中的样品在外加压力的作用下,同时上样至靶点上。该装置可实现基质辅助激光解析质谱的大批量同时上样,缩短点靶及等待结晶的时间,提高质谱检测效率。

    一种高通量简易细胞O-糖基化位点的富集、鉴定方法

    公开(公告)号:CN109738533A

    公开(公告)日:2019-05-10

    申请号:CN201811650406.9

    申请日:2018-12-31

    Applicant: 复旦大学

    Abstract: 本发明属于蛋白质分析技术领域,具体为一种高通量简易细胞O-糖基化位点的富集、鉴定方法。本发明方法包括:通过在细胞培养环境中加入O-GalNAc糖链合成抑制剂,使O-GalNAc糖链合成抑制在单个GalNAc的水平;然后通过超滤辅助凝集素富集技术实现O-GalNAc糖肽的富集,利用单糖竞争机制释放富集到的O-糖肽;最后通过LC-MS,高通量鉴定O-GalNAc糖基化位点。本发明解决了因为O-糖链释放酶的缺失和无保守的修饰位点序列等原因带来的O-GalNAc位点高通量鉴定困难的问题,通过抑制剂简化O-糖链策略、超滤辅助凝集素亲和富集技术,实现了O-GalNAc位点的大规模鉴定。

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