一种基于糖蛋白非糖肽的质谱多反应监测定量糖蛋白方法

    公开(公告)号:CN107576733A

    公开(公告)日:2018-01-12

    申请号:CN201710495427.7

    申请日:2017-06-26

    Applicant: 复旦大学

    Abstract: 本发明属分析化学技术领域,涉及糖蛋白质谱相对/绝对定量的方法,具体涉及一种基于糖蛋白非糖肽的质谱多反应监测定量糖蛋白方法,其包括:利用肼化学法对样品中的糖蛋白进行富集,用蛋白酶释放糖蛋白的非糖肽,利用色谱-质谱鉴定技术对非糖肽进行鉴定,合成适用于MRM定量的标准肽段,然后对这些肽段的保留时间,能量,母子离子对进行质谱优化,并建立相应的数据库;并将肽段可用于样品中糖蛋白的绝对/相对定量。本发明方法步骤简单、操作方便、快速高效,可以实现糖基化的单个蛋白质/糖蛋白质组的快速、精准定量。

    一种L1CAM蛋白N979位点特异性核心岩藻糖基化的抑制剂的应用

    公开(公告)号:CN115078738A

    公开(公告)日:2022-09-20

    申请号:CN202210758436.1

    申请日:2022-06-30

    Applicant: 复旦大学

    Abstract: 本发明公开了一种L1CAM蛋白N979位点特异性核心岩藻糖基化的抑制剂的应用,涉及生物医药技术领域。一种检测L1CAM蛋白N979位点特异性核心岩藻糖基化水平的试剂在制备诊断肝癌转移可能性的产品中的应用。本发明还提供一种L1CAM蛋白N979位点特异性核心岩藻糖基化的抑制剂在制备治疗肝癌的药物中的应用。本发明研究发现可通过检测L1CAM蛋白N979位点特异性核心岩藻糖基化水平预测肝癌转移的可能性。本发明针对L1CAMN979位点及该位点糖基化修饰设计了一种siRNA,可以通过使L1CAM蛋白N979位点特异性核心岩藻糖基化下调,从而抑制肝癌细胞转移。

    一种富集N-糖肽或N-糖链的方法

    公开(公告)号:CN111841079A

    公开(公告)日:2020-10-30

    申请号:CN202010755849.5

    申请日:2020-07-31

    Applicant: 复旦大学

    Abstract: 本发明公开了一种富集N-糖肽或N-糖链的方法,所述方法为将细菌纤维素进行预处理,将蛋白质溶液进行变性和酶消化处理后,然后将预处理后的细菌纤维素加入到处理后的蛋白质溶液中,进行富集。本发明鉴定出IgG标准蛋白和人血清样品中的36和159种N-糖链和31和523条完整的N-糖肽,整个富集过程非常容易操作,而且速度超快(只需10min),具有高达94%的高特异性。富集不受盐的影响,可以使样品在酶消化后直接富集,而不经历脱盐过程。

    一种两性亲水富集糖基化肽段并质谱分析的方法

    公开(公告)号:CN106053199B

    公开(公告)日:2018-12-11

    申请号:CN201610302904.9

    申请日:2016-05-10

    Applicant: 复旦大学

    Abstract: 一种两性亲水富集糖基化肽段并质谱分析的方法。本发明属蛋白质分析领域,具体为一种糖基化肽段两性亲水富集并质谱分析的方法,其包括:首先对树枝状聚合物PAMAM进行磺酸化衍生反应使得末端氨基变为磺酸基,再利用碘甲烷将产物的骨架氮转为季铵基团,合成两性亲水的树枝状聚合物。利用该材料高效特异结合血清样品酶解物中的糖基化肽段,通过超滤辅助技术将未和纳米材料反应的非糖肽清洗除去,最后再利用去糖链酶将捕获的糖肽从材料上解离下来,送入液相色谱‑质谱分析糖基化肽。本发明方法步骤简单、操作方便、快速高效,可以实现糖基化肽的高特异性、高灵敏、高选择性质谱分析。

    检测N-糖基化修饰蛋白质的试剂在制备肝癌诊断产品中的应用

    公开(公告)号:CN117783529A

    公开(公告)日:2024-03-29

    申请号:CN202410002165.6

    申请日:2024-01-02

    Applicant: 复旦大学

    Inventor: 曹纬倩 谢晓凤

    Abstract: 本发明公开了检测N‑糖基化修饰蛋白质的试剂在制备肝癌诊断产品中的应用,属于生物医学技术领域,所述N‑糖基化修饰蛋白质包括高甘露糖型N‑糖基化修饰的CO3和/或唾液酸化修饰的ITB3。本发明发现高甘露糖型修饰的CO3在HCC和mLC患者外周血小板中蛋白质的表达水平提高了5倍以上,唾液酸化修饰的ITB3在HCC和mLC患者外周血小板中的表达水平均提高了3.1倍,证明了高甘露糖型修饰的CO3和唾液酸化修饰的ITB3对于肝癌具有更好的诊断效果,其AUC均达到0.99以上。基于蛋白质组和糖蛋白质组系统性分析筛选出的这两个糖型特异的糖蛋白质,在肝癌病人血小板中差异显著,可作区分肝癌与健康人的糖基化标志物。

    一种富集N-糖肽或N-糖链的方法

    公开(公告)号:CN111841079B

    公开(公告)日:2021-07-06

    申请号:CN202010755849.5

    申请日:2020-07-31

    Applicant: 复旦大学

    Abstract: 本发明公开了一种富集N‑糖肽或N‑糖链的方法,所述方法为将细菌纤维素进行预处理,将蛋白质溶液进行变性和酶消化处理后,然后将预处理后的细菌纤维素加入到处理后的蛋白质溶液中,进行富集。本发明鉴定出IgG标准蛋白和人血清样品中的36和159种N‑糖链和31和523条完整的N‑糖肽,整个富集过程非常容易操作,而且速度超快(只需10min),具有高达94%的高特异性。富集不受盐的影响,可以使样品在酶消化后直接富集,而不经历脱盐过程。

    检测N-糖基化修饰蛋白质的试剂在制备肝癌诊断产品中的应用

    公开(公告)号:CN117783529B

    公开(公告)日:2024-09-13

    申请号:CN202410002165.6

    申请日:2024-01-02

    Applicant: 复旦大学

    Inventor: 曹纬倩 谢晓凤

    Abstract: 本发明公开了检测N‑糖基化修饰蛋白质的试剂在制备肝癌诊断产品中的应用,属于生物医学技术领域,所述N‑糖基化修饰蛋白质包括高甘露糖型N‑糖基化修饰的CO3和/或唾液酸化修饰的ITB3。本发明发现高甘露糖型修饰的CO3在HCC和mLC患者外周血小板中蛋白质的表达水平提高了5倍以上,唾液酸化修饰的ITB3在HCC和mLC患者外周血小板中的表达水平均提高了3.1倍,证明了高甘露糖型修饰的CO3和唾液酸化修饰的ITB3对于肝癌具有更好的诊断效果,其AUC均达到0.99以上。基于蛋白质组和糖蛋白质组系统性分析筛选出的这两个糖型特异的糖蛋白质,在肝癌病人血小板中差异显著,可作区分肝癌与健康人的糖基化标志物。

    一种高通量简易细胞O-糖基化位点的富集、鉴定方法

    公开(公告)号:CN109738533B

    公开(公告)日:2022-06-21

    申请号:CN201811650406.9

    申请日:2018-12-31

    Applicant: 复旦大学

    Abstract: 本发明属于蛋白质分析技术领域,具体为一种高通量简易细胞O‑糖基化位点的富集、鉴定方法。本发明方法包括:通过在细胞培养环境中加入O‑GalNAc糖链合成抑制剂,使O‑GalNAc糖链合成抑制在单个GalNAc的水平;然后通过超滤辅助凝集素富集技术实现O‑GalNAc糖肽的富集,利用单糖竞争机制释放富集到的O‑糖肽;最后通过LC‑MS,高通量鉴定O‑GalNAc糖基化位点。本发明解决了因为O‑糖链释放酶的缺失和无保守的修饰位点序列等原因带来的O‑GalNAc位点高通量鉴定困难的问题,通过抑制剂简化O‑糖链策略、超滤辅助凝集素亲和富集技术,实现了O‑GalNAc位点的大规模鉴定。

    一种基于96孔板的高通量糖基化肽段除盐富集方法

    公开(公告)号:CN107576800A

    公开(公告)日:2018-01-12

    申请号:CN201710496621.7

    申请日:2017-06-26

    Applicant: 复旦大学

    Abstract: 本发明属于蛋白质糖基化修饰领域,涉及一种利用96孔板对肽段进行高通量除盐和糖基化富集的新方法,其包括:通过离心,样品的肽段溶液在填装C18材料的96孔脱盐板上实现溶液的脱盐和有机相转换,洗脱的高有机相溶液即为ZIC-HILIC材料的上样溶液,直接进入装填ZIC-HILIC填料的96孔板中进行富集,富集的洗脱液可以浓缩或者直接进入质谱分析。本发明在富集的过程中,无需浓缩和溶液相转化,减少样品损失。在保持了传统的基于移液枪头的亲水相互作用小柱富集方法高特异性的同时,实现了大规模样本的快速富集,节省了样品处理时间。

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