颅内动脉瘤诊断血清标志物以及预测颅内动脉瘤破裂潜能血清标志物

    公开(公告)号:CN112946274B

    公开(公告)日:2024-03-26

    申请号:CN202110153657.1

    申请日:2021-02-04

    Applicant: 复旦大学

    Abstract: 本发明涉及颅内动脉瘤诊断血清标志物以及预测颅内动脉瘤破裂潜能血清标志物。颅内动脉瘤诊断血清标志物选自以下蛋白因子中的一种或几种:PRTN3、CTSG、PDLIM1、MMP9、IGKV3‑20、MPO、PROC、LTF、FGA、FGB、PPBP或SERPINA1。预测颅内动脉瘤破裂潜能的血清标志物选自以下蛋白因子中的一种或几种:SAA1、LRG1、FGL1、PTGDS、COMP、IGKV4‑1、APOA4、FGA、FGB、FGG。与现有技术相比,本发明应用基于Orbitrap Exploris 480质谱仪的PRM质谱技术与生物信息学方法筛选出能够用于诊断颅内动脉瘤的血清标志物以及预测颅内动脉瘤破裂的血清标志物,为临床上颅内动脉瘤的诊治提供了新思路,具有较高的灵敏度、特异度和正确率。并且可以完善以及改良蛋白质质谱技术,降低检查费用,使之更适合于精准医学的临床应用。

    一种疾病蛋白质生物标志物鉴定方法

    公开(公告)号:CN115112778A

    公开(公告)日:2022-09-27

    申请号:CN202110297187.6

    申请日:2021-03-19

    Applicant: 复旦大学

    Abstract: 本发明涉及一种疾病蛋白质生物标志物鉴定方法,包括以下步骤:S1、针对单一或复杂疾病筛选候选蛋白;S2、通过确认疾病靶蛋白,进而预测靶肽段以及其保留时间和可检出性;S3、通过预测靶肽段以及其保留时间和可检出性信息构建靶向蛋白组学方法列表;S4、进行靶向蛋白组学验证。与现有技术相比,本发明的方法可用于复杂疾病相关蛋白的独特性肽段筛选、保留时间预测以及可检出性信息获取,在大规模样本集中同时有效地精确测量大量候选蛋白质标志物。采用本发明的方法,一次PRM分析(60min)可同时采集300‑400条靶肽段,极大地缩短了时间成本与经济成本,说明该方法极其适用于复杂疾病成百上千候选标志物的验证工作,具有广泛适用性。

    一种疾病蛋白质生物标志物鉴定方法

    公开(公告)号:CN115112778B

    公开(公告)日:2023-08-04

    申请号:CN202110297187.6

    申请日:2021-03-19

    Applicant: 复旦大学

    Abstract: 本发明涉及一种疾病蛋白质生物标志物鉴定方法,包括以下步骤:S1、针对单一或复杂疾病筛选候选蛋白;S2、通过确认疾病靶蛋白,进而预测靶肽段以及其保留时间和可检出性;S3、通过预测靶肽段以及其保留时间和可检出性信息构建靶向蛋白组学方法列表;S4、进行靶向蛋白组学验证。与现有技术相比,本发明的方法可用于复杂疾病相关蛋白的独特性肽段筛选、保留时间预测以及可检出性信息获取,在大规模样本集中同时有效地精确测量大量候选蛋白质标志物。采用本发明的方法,一次PRM分析(60min)可同时采集300‑400条靶肽段,极大地缩短了时间成本与经济成本,说明该方法极其适用于复杂疾病成百上千候选标志物的验证工作,具有广泛适用性。

    一种一体化快速蛋白酶解方法

    公开(公告)号:CN112649490A

    公开(公告)日:2021-04-13

    申请号:CN202011429197.2

    申请日:2020-12-09

    Applicant: 复旦大学

    Abstract: 本发明涉及一种一体化快速蛋白酶解方法,其特征在于,在一个容器中,顺序向细胞或组织样品中加入裂解液、还原烷基化试剂及酶解试剂,使得细胞或组织样品依次经过裂解、还原烷基化及酶解过程;所述裂解液为RapiGest和多种蛋白酶抑制剂组Cocktail。与现有技术相比,本发明为一体化裂解酶解方法,整个过程均在同一离心管内进行,无需换管,极大的减少了样品的损失,有利于微量样品的处理;本发明使用与质谱兼容的还原烷基化试剂,使原本需要3步的反应,集成为2步完成,减少了反应步骤和反应时间,从而减少了样品吸附和损失;该方法具有一体化、操作简单、快速、适用范围广等特点,能广泛应用于蛋白质组学的样品处理中。

    一种基质辅助激光解吸离子源装置

    公开(公告)号:CN112582250A

    公开(公告)日:2021-03-30

    申请号:CN202011274432.3

    申请日:2020-11-15

    Applicant: 复旦大学

    Abstract: 本发明属于激光解吸电离技术领域,具体涉为一种基质辅助激光解吸离子源装置。本发明装置。本发明装置由二维运动机构、密封垫、密封垫安装座、绝缘板、靶板安装座、靶板、离子通道密封座、靶板舱门、离子引入装置、离子源密封盖板、离子源腔体配合连接组成。本装置通过简单巧妙的机械设计和靶板移动策略,可以方便快速地完成基质辅助激光解吸离子源靶板更换,结构简单可靠;在更换靶板时,无需复杂的机械装置实现真空密封。

    一种基质辅助激光解吸离子源装置

    公开(公告)号:CN112582250B

    公开(公告)日:2021-09-17

    申请号:CN202011274432.3

    申请日:2020-11-15

    Applicant: 复旦大学

    Abstract: 本发明属于激光解吸电离技术领域,具体涉为一种基质辅助激光解吸离子源装置。本发明装置。本发明装置由二维运动机构、密封垫、密封垫安装座、绝缘板、靶板安装座、靶板、离子通道密封座、靶板舱门、离子引入装置、离子源密封盖板、离子源腔体配合连接组成。本装置通过简单巧妙的机械设计和靶板移动策略,可以方便快速地完成基质辅助激光解吸离子源靶板更换,结构简单可靠;在更换靶板时,无需复杂的机械装置实现真空密封。

    颅内动脉瘤诊断血清标志物以及预测颅内动脉瘤破裂潜能血清标志物

    公开(公告)号:CN112946274A

    公开(公告)日:2021-06-11

    申请号:CN202110153657.1

    申请日:2021-02-04

    Applicant: 复旦大学

    Abstract: 本发明涉及颅内动脉瘤诊断血清标志物以及预测颅内动脉瘤破裂潜能血清标志物。颅内动脉瘤诊断血清标志物选自以下蛋白因子中的一种或几种:PRTN3、CTSG、PDLIM1、MMP9、IGKV3‑20、MPO、PROC、LTF、FGA、FGB、PPBP或SERPINA1。预测颅内动脉瘤破裂潜能的血清标志物选自以下蛋白因子中的一种或几种:SAA1、LRG1、FGL1、PTGDS、COMP、IGKV4‑1、APOA4、FGA、FGB、FGG。与现有技术相比,本发明应用基于Orbitrap Exploris 480质谱仪的PRM质谱技术与生物信息学方法筛选出能够用于诊断颅内动脉瘤的血清标志物以及预测颅内动脉瘤破裂的血清标志物,为临床上颅内动脉瘤的诊治提供了新思路,具有较高的灵敏度、特异度和正确率。并且可以完善以及改良蛋白质质谱技术,降低检查费用,使之更适合于精准医学的临床应用。

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