一种L1CAM蛋白N979位点特异性核心岩藻糖基化的抑制剂的应用

    公开(公告)号:CN115078738A

    公开(公告)日:2022-09-20

    申请号:CN202210758436.1

    申请日:2022-06-30

    Applicant: 复旦大学

    Abstract: 本发明公开了一种L1CAM蛋白N979位点特异性核心岩藻糖基化的抑制剂的应用,涉及生物医药技术领域。一种检测L1CAM蛋白N979位点特异性核心岩藻糖基化水平的试剂在制备诊断肝癌转移可能性的产品中的应用。本发明还提供一种L1CAM蛋白N979位点特异性核心岩藻糖基化的抑制剂在制备治疗肝癌的药物中的应用。本发明研究发现可通过检测L1CAM蛋白N979位点特异性核心岩藻糖基化水平预测肝癌转移的可能性。本发明针对L1CAMN979位点及该位点糖基化修饰设计了一种siRNA,可以通过使L1CAM蛋白N979位点特异性核心岩藻糖基化下调,从而抑制肝癌细胞转移。

    一种两性亲水富集糖基化肽段并质谱分析的方法

    公开(公告)号:CN106053199B

    公开(公告)日:2018-12-11

    申请号:CN201610302904.9

    申请日:2016-05-10

    Applicant: 复旦大学

    Abstract: 一种两性亲水富集糖基化肽段并质谱分析的方法。本发明属蛋白质分析领域,具体为一种糖基化肽段两性亲水富集并质谱分析的方法,其包括:首先对树枝状聚合物PAMAM进行磺酸化衍生反应使得末端氨基变为磺酸基,再利用碘甲烷将产物的骨架氮转为季铵基团,合成两性亲水的树枝状聚合物。利用该材料高效特异结合血清样品酶解物中的糖基化肽段,通过超滤辅助技术将未和纳米材料反应的非糖肽清洗除去,最后再利用去糖链酶将捕获的糖肽从材料上解离下来,送入液相色谱‑质谱分析糖基化肽。本发明方法步骤简单、操作方便、快速高效,可以实现糖基化肽的高特异性、高灵敏、高选择性质谱分析。

    一种基于糖蛋白非糖肽的质谱多反应监测定量糖蛋白方法

    公开(公告)号:CN107576733A

    公开(公告)日:2018-01-12

    申请号:CN201710495427.7

    申请日:2017-06-26

    Applicant: 复旦大学

    Abstract: 本发明属分析化学技术领域,涉及糖蛋白质谱相对/绝对定量的方法,具体涉及一种基于糖蛋白非糖肽的质谱多反应监测定量糖蛋白方法,其包括:利用肼化学法对样品中的糖蛋白进行富集,用蛋白酶释放糖蛋白的非糖肽,利用色谱-质谱鉴定技术对非糖肽进行鉴定,合成适用于MRM定量的标准肽段,然后对这些肽段的保留时间,能量,母子离子对进行质谱优化,并建立相应的数据库;并将肽段可用于样品中糖蛋白的绝对/相对定量。本发明方法步骤简单、操作方便、快速高效,可以实现糖基化的单个蛋白质/糖蛋白质组的快速、精准定量。

    一种高通量简易细胞O-糖基化位点的富集、鉴定方法

    公开(公告)号:CN109738533B

    公开(公告)日:2022-06-21

    申请号:CN201811650406.9

    申请日:2018-12-31

    Applicant: 复旦大学

    Abstract: 本发明属于蛋白质分析技术领域,具体为一种高通量简易细胞O‑糖基化位点的富集、鉴定方法。本发明方法包括:通过在细胞培养环境中加入O‑GalNAc糖链合成抑制剂,使O‑GalNAc糖链合成抑制在单个GalNAc的水平;然后通过超滤辅助凝集素富集技术实现O‑GalNAc糖肽的富集,利用单糖竞争机制释放富集到的O‑糖肽;最后通过LC‑MS,高通量鉴定O‑GalNAc糖基化位点。本发明解决了因为O‑糖链释放酶的缺失和无保守的修饰位点序列等原因带来的O‑GalNAc位点高通量鉴定困难的问题,通过抑制剂简化O‑糖链策略、超滤辅助凝集素亲和富集技术,实现了O‑GalNAc位点的大规模鉴定。

    一种基于96孔板的高通量糖基化肽段除盐富集方法

    公开(公告)号:CN107576800A

    公开(公告)日:2018-01-12

    申请号:CN201710496621.7

    申请日:2017-06-26

    Applicant: 复旦大学

    Abstract: 本发明属于蛋白质糖基化修饰领域,涉及一种利用96孔板对肽段进行高通量除盐和糖基化富集的新方法,其包括:通过离心,样品的肽段溶液在填装C18材料的96孔脱盐板上实现溶液的脱盐和有机相转换,洗脱的高有机相溶液即为ZIC-HILIC材料的上样溶液,直接进入装填ZIC-HILIC填料的96孔板中进行富集,富集的洗脱液可以浓缩或者直接进入质谱分析。本发明在富集的过程中,无需浓缩和溶液相转化,减少样品损失。在保持了传统的基于移液枪头的亲水相互作用小柱富集方法高特异性的同时,实现了大规模样本的快速富集,节省了样品处理时间。

    一种两性亲水富集糖基化肽段并质谱分析的方法

    公开(公告)号:CN106053199A

    公开(公告)日:2016-10-26

    申请号:CN201610302904.9

    申请日:2016-05-10

    Applicant: 复旦大学

    CPC classification number: G01N1/405 G01N1/34 G01N33/6851

    Abstract: 一种两性亲水富集糖基化肽段并质谱分析的方法。本发明属蛋白质分析领域,具体为一种糖基化肽段两性亲水富集并质谱分析的方法,其包括:首先对树枝状聚合物PAMAM进行磺酸化衍生反应使得末端氨基变为磺酸基,再利用碘甲烷将产物的骨架氮转为季铵基团,合成两性亲水的树枝状聚合物。利用该材料高效特异结合血清样品酶解物中的糖基化肽段,通过超滤辅助技术将未和纳米材料反应的非糖肽清洗除去,最后再利用去糖链酶将捕获的糖肽从材料上解离下来,送入液相色谱‑质谱分析糖基化肽。本发明方法步骤简单、操作方便、快速高效,可以实现糖基化肽的高特异性、高灵敏、高选择性质谱分析。

    一种自动解析稳定同位素标记糖链定量质谱数据的方法

    公开(公告)号:CN109738532B

    公开(公告)日:2022-07-22

    申请号:CN201811650390.1

    申请日:2018-12-31

    Applicant: 复旦大学

    Abstract: 本发明属蛋白质分析技术领域,具体为一种自动解析稳定同位素标记糖链定量质谱数据的方法。本发明利用工具gQuant对MALDI‑MS产出的同位素标记的糖链质量校正从而进行准确相对定量;该工具充分考虑了同位素标记相对定量数据的特点,对同位素交叠进行了准确的校正,并且特别地利用糖链的理论同位素分布模式和质谱碎裂特性设了基于最高理论同位素强度峰定量的算法,对高分子量和低丰度的糖链组分具有更高的定量准确性和鲁棒性。

    一种基于糖蛋白非糖肽的质谱多反应监测定量糖蛋白方法

    公开(公告)号:CN107576733B

    公开(公告)日:2020-11-24

    申请号:CN201710495427.7

    申请日:2017-06-26

    Applicant: 复旦大学

    Abstract: 本发明属分析化学技术领域,涉及糖蛋白质谱相对/绝对定量的方法,具体涉及一种基于糖蛋白非糖肽的质谱多反应监测定量糖蛋白方法,其包括:利用肼化学法对样品中的糖蛋白进行富集,用蛋白酶释放糖蛋白的非糖肽,利用色谱‑质谱鉴定技术对非糖肽进行鉴定,合成适用于MRM定量的标准肽段,然后对这些肽段的保留时间,能量,母子离子对进行质谱优化,并建立相应的数据库;并将肽段可用于样品中糖蛋白的绝对/相对定量。本发明方法步骤简单、操作方便、快速高效,可以实现糖基化的单个蛋白质/糖蛋白质组的快速、精准定量。

    一种基于96孔板的高通量糖基化肽段除盐富集方法

    公开(公告)号:CN107576800B

    公开(公告)日:2020-07-14

    申请号:CN201710496621.7

    申请日:2017-06-26

    Applicant: 复旦大学

    Abstract: 本发明属于蛋白质糖基化修饰领域,涉及一种利用96孔板对肽段进行高通量除盐和糖基化富集的新方法,其包括:通过离心,样品的肽段溶液在填装C18材料的96孔脱盐板上实现溶液的脱盐和有机相转换,洗脱的高有机相溶液即为ZIC‑HILIC材料的上样溶液,直接进入装填ZIC‑HILIC填料的96孔板中进行富集,富集的洗脱液可以浓缩或者直接进入质谱分析。本发明在富集的过程中,无需浓缩和溶液相转化,减少样品损失。在保持了传统的基于移液枪头的亲水相互作用小柱富集方法高特异性的同时,实现了大规模样本的快速富集,节省了样品处理时间。

    一种高通量简易细胞O-糖基化位点的富集、鉴定方法

    公开(公告)号:CN109738533A

    公开(公告)日:2019-05-10

    申请号:CN201811650406.9

    申请日:2018-12-31

    Applicant: 复旦大学

    Abstract: 本发明属于蛋白质分析技术领域,具体为一种高通量简易细胞O-糖基化位点的富集、鉴定方法。本发明方法包括:通过在细胞培养环境中加入O-GalNAc糖链合成抑制剂,使O-GalNAc糖链合成抑制在单个GalNAc的水平;然后通过超滤辅助凝集素富集技术实现O-GalNAc糖肽的富集,利用单糖竞争机制释放富集到的O-糖肽;最后通过LC-MS,高通量鉴定O-GalNAc糖基化位点。本发明解决了因为O-糖链释放酶的缺失和无保守的修饰位点序列等原因带来的O-GalNAc位点高通量鉴定困难的问题,通过抑制剂简化O-糖链策略、超滤辅助凝集素亲和富集技术,实现了O-GalNAc位点的大规模鉴定。

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