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公开(公告)号：CN112946274B
公开(公告)日：2024-03-26
申请号：CN202110153657.1
申请日：2021-02-04
Applicant: 复旦大学
IPC: G01N33/574
Abstract: 本发明涉及颅内动脉瘤诊断血清标志物以及预测颅内动脉瘤破裂潜能血清标志物。颅内动脉瘤诊断血清标志物选自以下蛋白因子中的一种或几种：PRTN3、CTSG、PDLIM1、MMP9、IGKV3‑20、MPO、PROC、LTF、FGA、FGB、PPBP或SERPINA1。预测颅内动脉瘤破裂潜能的血清标志物选自以下蛋白因子中的一种或几种：SAA1、LRG1、FGL1、PTGDS、COMP、IGKV4‑1、APOA4、FGA、FGB、FGG。与现有技术相比，本发明应用基于Orbitrap Exploris 480质谱仪的PRM质谱技术与生物信息学方法筛选出能够用于诊断颅内动脉瘤的血清标志物以及预测颅内动脉瘤破裂的血清标志物，为临床上颅内动脉瘤的诊治提供了新思路，具有较高的灵敏度、特异度和正确率。并且可以完善以及改良蛋白质质谱技术，降低检查费用，使之更适合于精准医学的临床应用。
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公开(公告)号：CN109425739A
公开(公告)日：2019-03-05
申请号：CN201710774080.X
申请日：2017-08-31
Applicant: 复旦大学
IPC: G01N33/574
Abstract: 本发明属生物学和医学检验领域，涉及一组肿瘤生物标志物及其应用，具体涉及一组蛋白作为新的肿瘤标志物以及用于诊断肿瘤的发生和预后的方法和制备试剂盒。本发明提供了特异的一组蛋白包括APOE、ITIH3、APOA1、APOL1作为诊断标志物以及APOE、ITIH3、APOA1、APOL1蛋白作为肿瘤标志物用于制备消化系统恶性肿瘤诊断试剂或试剂盒的用途。本发明的肿瘤标志物APOE、ITIH3、APOA1、APOL1经临床检测证实，所述蛋白标志物或者蛋白标志物与CA19-9联合，较传统的CA19-9具有更好的敏感性和特异性，可作为人群普查的肿瘤标志物及制备诊断试剂和试剂盒；本发明还涉及其基于质谱的检测方法。
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公开(公告)号：CN103454371B
公开(公告)日：2015-10-07
申请号：CN201310310332.5
申请日：2013-07-23
Applicant: 复旦大学
IPC: G01N30/89
Abstract: 本发明属生物技术领域，涉及基于一维长柱液相色谱串联质谱的蛋白质组分离鉴定方法。该鉴定方法使用50cm的反相色谱柱，采用一维长梯度对蛋白质组学样品进行分离，经电喷雾电离，串联质谱进行一维蛋白质组分离鉴定，使用结果表明，本鉴定方法的实验操作简单、不需预分馏分，一次实验可达到传统二维分离质谱鉴定的效果；特别是对于少量样品的处理，一次实验仅需几微克样品就可完成一次蛋白质组学的数据分析，所需样品量少,对复杂生物蛋白质组的仪器分析效率达到7小时内实现对4000个以上蛋白质的分析鉴定，实现蛋白质的快速高效鉴定。
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公开(公告)号：CN115112778B
公开(公告)日：2023-08-04
申请号：CN202110297187.6
申请日：2021-03-19
Applicant: 复旦大学
IPC: G01N30/02 , G01N30/06 , G01N30/32 , G01N30/34 , G01N30/72 , G01N30/86 , G01N33/68 , G16B20/00 , G16B40/00
Abstract: 本发明涉及一种疾病蛋白质生物标志物鉴定方法，包括以下步骤：S1、针对单一或复杂疾病筛选候选蛋白；S2、通过确认疾病靶蛋白，进而预测靶肽段以及其保留时间和可检出性；S3、通过预测靶肽段以及其保留时间和可检出性信息构建靶向蛋白组学方法列表；S4、进行靶向蛋白组学验证。与现有技术相比，本发明的方法可用于复杂疾病相关蛋白的独特性肽段筛选、保留时间预测以及可检出性信息获取，在大规模样本集中同时有效地精确测量大量候选蛋白质标志物。采用本发明的方法，一次PRM分析(60min)可同时采集300‑400条靶肽段，极大地缩短了时间成本与经济成本，说明该方法极其适用于复杂疾病成百上千候选标志物的验证工作，具有广泛适用性。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN109425739B
公开(公告)日：2022-03-18
申请号：CN201710774080.X
申请日：2017-08-31
Applicant: 复旦大学
IPC: G01N33/574
Abstract: 本发明属生物学和医学检验领域，涉及一组肿瘤生物标志物及其应用，具体涉及一组蛋白作为新的肿瘤标志物以及用于诊断肿瘤的发生和预后的方法和制备试剂盒。本发明提供了特异的一组蛋白包括APOE、ITIH3、APOA1、APOL1作为诊断标志物以及APOE、ITIH3、APOA1、APOL1蛋白作为肿瘤标志物用于制备消化系统恶性肿瘤诊断试剂或试剂盒的用途。本发明的肿瘤标志物APOE、ITIH3、APOA1、APOL1经临床检测证实，所述蛋白标志物或者蛋白标志物与CA19‑9联合，较传统的CA19‑9具有更好的敏感性和特异性，可作为人群普查的肿瘤标志物及制备诊断试剂和试剂盒；本发明还涉及其基于质谱的检测方法。
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公开(公告)号：CN112649490A
公开(公告)日：2021-04-13
申请号：CN202011429197.2
申请日：2020-12-09
Applicant: 复旦大学
Abstract: 本发明涉及一种一体化快速蛋白酶解方法，其特征在于，在一个容器中，顺序向细胞或组织样品中加入裂解液、还原烷基化试剂及酶解试剂，使得细胞或组织样品依次经过裂解、还原烷基化及酶解过程；所述裂解液为RapiGest和多种蛋白酶抑制剂组Cocktail。与现有技术相比，本发明为一体化裂解酶解方法，整个过程均在同一离心管内进行，无需换管，极大的减少了样品的损失，有利于微量样品的处理；本发明使用与质谱兼容的还原烷基化试剂，使原本需要3步的反应，集成为2步完成，减少了反应步骤和反应时间，从而减少了样品吸附和损失；该方法具有一体化、操作简单、快速、适用范围广等特点，能广泛应用于蛋白质组学的样品处理中。
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公开(公告)号：CN115112778A
公开(公告)日：2022-09-27
申请号：CN202110297187.6
申请日：2021-03-19
Applicant: 复旦大学
IPC: G01N30/02 , G01N30/06 , G01N30/32 , G01N30/34 , G01N30/72 , G01N30/86 , G01N33/68 , G16B20/00 , G16B40/00
Abstract: 本发明涉及一种疾病蛋白质生物标志物鉴定方法，包括以下步骤：S1、针对单一或复杂疾病筛选候选蛋白；S2、通过确认疾病靶蛋白，进而预测靶肽段以及其保留时间和可检出性；S3、通过预测靶肽段以及其保留时间和可检出性信息构建靶向蛋白组学方法列表；S4、进行靶向蛋白组学验证。与现有技术相比，本发明的方法可用于复杂疾病相关蛋白的独特性肽段筛选、保留时间预测以及可检出性信息获取，在大规模样本集中同时有效地精确测量大量候选蛋白质标志物。采用本发明的方法，一次PRM分析(60min)可同时采集300‑400条靶肽段，极大地缩短了时间成本与经济成本，说明该方法极其适用于复杂疾病成百上千候选标志物的验证工作，具有广泛适用性。
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公开(公告)号：CN103454371A
公开(公告)日：2013-12-18
申请号：CN201310310332.5
申请日：2013-07-23
Applicant: 复旦大学
IPC: G01N30/89
Abstract: 本发明属生物技术领域，涉及基于一维长柱液相色谱串联质谱的蛋白质组分离鉴定方法。该鉴定方法使用50cm的反相色谱柱，采用一维长梯度对蛋白质组学样品进行分离，经电喷雾电离，串联质谱进行一维蛋白质组分离鉴定，使用结果表明，本鉴定方法的实验操作简单、不需预分馏分，一次实验可达到传统二维分离质谱鉴定的效果；特别是对于少量样品的处理，一次实验仅需几微克样品就可完成一次蛋白质组学的数据分析，所需样品量少,对复杂生物蛋白质组的仪器分析效率达到7小时内实现对4000个以上蛋白质的分析鉴定，实现蛋白质的快速高效鉴定。
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公开(公告)号：CN112946274A
公开(公告)日：2021-06-11
申请号：CN202110153657.1
申请日：2021-02-04
Applicant: 复旦大学
IPC: G01N33/574
Abstract: 本发明涉及颅内动脉瘤诊断血清标志物以及预测颅内动脉瘤破裂潜能血清标志物。颅内动脉瘤诊断血清标志物选自以下蛋白因子中的一种或几种：PRTN3、CTSG、PDLIM1、MMP9、IGKV3‑20、MPO、PROC、LTF、FGA、FGB、PPBP或SERPINA1。预测颅内动脉瘤破裂潜能的血清标志物选自以下蛋白因子中的一种或几种：SAA1、LRG1、FGL1、PTGDS、COMP、IGKV4‑1、APOA4、FGA、FGB、FGG。与现有技术相比，本发明应用基于Orbitrap Exploris 480质谱仪的PRM质谱技术与生物信息学方法筛选出能够用于诊断颅内动脉瘤的血清标志物以及预测颅内动脉瘤破裂的血清标志物，为临床上颅内动脉瘤的诊治提供了新思路，具有较高的灵敏度、特异度和正确率。并且可以完善以及改良蛋白质质谱技术，降低检查费用，使之更适合于精准医学的临床应用。
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