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公开(公告)号:CN104903463B
公开(公告)日:2018-02-06
申请号:CN201380062971.2
申请日:2013-10-04
Applicant: 贝斯4创新公司
Inventor: 卡梅伦·亚历山大·弗雷林 , 巴纳比·巴姆福思 , 布鲁诺·弗拉维奥·诺盖拉·德·索萨·苏亚 , 雷斯 , 托马斯·亨利·艾萨克 , 鲍里斯·布赖纳 , 亚历山德拉·纳塔莱 , 米歇尔·阿马西奥
IPC: C12Q1/68
CPC classification number: C12Q1/6874 , C12Q1/6869 , C12Q2521/101 , C12Q2521/301 , C12Q2521/319 , C12Q2521/501 , C12Q2525/301 , C12Q2563/159 , C12Q2565/1015 , C12Q2565/629
Abstract: 本发明公开了用于测序多核苷酸分析物的方法,所述方法包括:·a.产生含有单核苷酸的小滴流,其中在所述小滴流中的单核苷酸的顺序与所述分析物中核苷酸的序列对应;·b.向每个小滴中引入多个生物探针类型,每个类型包含处于不可检测状态的不同的标记且适于捕获不同的单核苷酸;·c.使包含在所述小滴中的单核苷酸与其互补探针结合;·d.使所述标记以可检测状态从已经结合单核苷酸的探针释放。所述探针是哑铃形状的探针,其包含荧光供体和猝灭剂标记和单核苷酸缺口。在通过聚合酶和连接酶修复缺口后,通过限制酶切割限制酶识别位点,然后进行外切核酸酶消化,以释放所述标记。
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公开(公告)号:CN107090492A
公开(公告)日:2017-08-25
申请号:CN201611163633.X
申请日:2014-04-09
Inventor: 卡梅伦·亚历山大·弗雷林 , 巴纳比·巴姆福思 , 布鲁诺·弗拉维奥·诺盖拉·德·索萨·苏亚雷斯 , 托马斯·亨利·艾萨克 , 鲍里斯·布赖纳 , 亚历山德拉·纳塔莱 , 米歇尔·阿马西奥 , 保罗·迪尔
Abstract: 本发明提供一种微流体核酸测序设备,其特征在于包括:第一区;第一和第二微流体通路;与所述第二微流体通路连接的第二区;第三和第四微流体通路;至少一种接触装置,和与所述第四微流体通路连接的荧光检测系统。本发明还提供所述微流体测序设备对DNA或RNA进行测序的用途。
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公开(公告)号:CN104884635A
公开(公告)日:2015-09-02
申请号:CN201380062825.X
申请日:2013-10-04
Applicant: 贝斯4创新公司
Inventor: 卡梅伦·亚历山大·弗雷林 , 巴纳比·巴姆福思 , 布鲁诺·弗拉维奥·诺盖拉·德·索萨·苏亚雷斯 , 托马斯·亨利·艾萨克 , 鲍里斯·布赖纳 , 亚历山德拉·纳塔莱 , 米歇尔·阿马西奥
IPC: C12Q1/68
CPC classification number: C12Q1/6876 , C12Q1/6823 , C12Q1/6869 , C12Q2521/301 , C12Q2521/319 , C12Q2525/301 , C12Q2563/107 , C12Q2565/1015 , C12Q2521/101 , C12Q2521/501
Abstract: 本发明公开了生物探针,其特征在于包含末端连接两个不同寡核苷酸区的单链核苷酸区其中寡核苷酸区中至少一个包含具有特征性检测特性的可检测元件且其中可检测元件被布置在寡核苷酸区上以致可检测特性的可检测性低于当相同数量的可检测元件结合到相应数量的单个核苷酸时。该生物探针尤其可用于捕获单个核苷酸或单链核苷酸以产生可由限制酶和外切核酸酶降解的占用探针从而产生携带可检测形式的可检测元件的单个核苷酸。典型地可检测元件是荧光团且通过如使用多个相邻的荧光团或荧光团和与其连接的猝灭剂的混合物使探针中相应的特征性荧光不可检测。优选地单链核苷酸区由单个核苷酸组成,其关联的核苷酸碱基是DNA或RNA中发现的特征性核苷酸碱基之一。
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公开(公告)号:CN108220146A
公开(公告)日:2018-06-29
申请号:CN201711464744.9
申请日:2013-10-04
Applicant: 贝斯4创新公司
Inventor: 卡梅伦·亚历山大·弗雷林 , 巴纳比·巴姆福思 , 布鲁诺·弗拉维奥·诺盖拉·德·索萨·苏亚雷斯 , 托马斯·亨利·艾萨克 , 鲍里斯·布赖纳 , 亚历山德拉·纳塔莱 , 米歇尔·阿马西奥
IPC: C12M1/34 , C12Q1/6869
CPC classification number: C12Q1/6874 , C12Q1/6869 , C12Q2521/101 , C12Q2521/301 , C12Q2521/319 , C12Q2521/501 , C12Q2525/301 , C12Q2563/159 , C12Q2565/1015 , C12Q2565/629
Abstract: 本发明公开了用于核酸测序的微流体设备,其特征在于包括:第一区,分析物被包含在其中并且被逐步消化成作为其组成的单核苷酸的流;与第一区连接的一级微流体路径,其适于允许包含一级水性微滴的有序流的载体溶剂通过,一级水性微滴中的至少一些包含单核苷酸中的一种;第二区,其放置在一级微流体路径内,并且包含微滴注射器和/或聚结装置,所述聚结装置用于使来自二级微流体路径的二级水性微滴聚结成所述有序流中的一级水性微滴;存储区,其在第二区的下游与一级微流体路径连接,一级水性微滴被存储在所述存储区中;光源,其用于检测在一级微流体路径下游的一个或多个位置处的微滴,和光检测器,其用于检测来自所述位置处的一级水性小滴的荧光。
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公开(公告)号:CN105143468B
公开(公告)日:2017-07-07
申请号:CN201480020429.5
申请日:2014-04-09
Inventor: 卡梅伦·亚历山大·弗雷林 , 巴纳比·巴姆福思 , 布鲁诺·弗拉维奥·诺盖拉·德·索萨·苏亚雷斯 , 托马斯·亨利·艾萨克 , 鲍里斯·布赖纳 , 亚历山德拉·纳塔莱 , 米歇尔·阿马西奥 , 保罗·迪尔
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明提供一种用于确定多核苷酸分析物中核苷酸碱基的序列的方法。其特征在于以下步骤:(1)通过焦磷酸解从分析物产生单核苷酸碱基流;(2)通过将各单核苷酸碱基与用处于不可检测状态的可检测元件标记的捕获系统反应产生捕获的分子;(3)从各捕获的分子释放处于可检测状态的可检测元件;以及(4)检测这样释放的可检测元件并且由其确定核苷酸碱基的序列。所述方法可以有利地用于涉及使用微滴的测序仪中。
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公开(公告)号:CN105143468A
公开(公告)日:2015-12-09
申请号:CN201480020429.5
申请日:2014-04-09
Inventor: 卡梅伦·亚历山大·弗雷林 , 巴纳比·巴姆福思 , 布鲁诺·弗拉维奥·诺盖拉·德·索萨·苏亚雷斯 , 托马斯·亨利·艾萨克 , 鲍里斯·布赖纳 , 亚历山德拉·纳塔莱 , 米歇尔·阿马西奥 , 保罗·迪尔
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明提供一种用于确定多核苷酸分析物中核苷酸碱基的序列的方法。其特征在于以下步骤:(1)通过焦磷酸解从分析物产生单核苷酸碱基流;(2)通过将各单核苷酸碱基与用处于不可检测状态的可检测元件标记的捕获系统反应产生捕获的分子;(3)从各捕获的分子释放处于可检测状态的可检测元件;以及(4)检测这样释放的可检测元件并且由其确定核苷酸碱基的序列。所述方法可以有利地用于涉及使用微滴的测序仪中。
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公开(公告)号:CN104903463A
公开(公告)日:2015-09-09
申请号:CN201380062971.2
申请日:2013-10-04
Applicant: 贝斯4创新公司
Inventor: 卡梅伦·亚历山大·弗雷林 , 巴纳比·巴姆福思 , 布鲁诺·弗拉维奥·诺盖拉·德·索萨·苏亚雷斯 , 托马斯·亨利·艾萨克 , 鲍里斯·布赖纳 , 亚历山德拉·纳塔莱 , 米歇尔·阿马西奥
IPC: C12Q1/68
CPC classification number: C12Q1/6874 , C12Q1/6869 , C12Q2521/101 , C12Q2521/301 , C12Q2521/319 , C12Q2521/501 , C12Q2525/301 , C12Q2563/159 , C12Q2565/1015 , C12Q2565/629
Abstract: 本发明公开了用于测序多核苷酸分析物的方法,所述方法包括:a.产生含有单核苷酸的小滴流,其中在所述小滴流中的单核苷酸的顺序与所述分析物中核苷酸的序列对应;b.向每个小滴中引入多个生物探针类型,每个类型包含处于不可检测状态的不同的标记且适于捕获不同的单核苷酸;c.使包含在所述小滴中的单核苷酸与其互补探针结合;d.使所述标记以可检测状态从已经结合单核苷酸的探针释放。所述探针是哑铃形状的探针,其包含荧光供体和猝灭剂标记和单核苷酸缺口。在通过聚合酶和连接酶修复缺口后,通过限制酶切割限制酶识别位点,然后进行外切核酸酶消化,以释放所述标记。
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公开(公告)号:CN104884635B
公开(公告)日:2017-08-25
申请号:CN201380062825.X
申请日:2013-10-04
Applicant: 贝斯4创新公司
Inventor: 卡梅伦·亚历山大·弗雷林 , 巴纳比·巴姆福思 , 布鲁诺·弗拉维奥·诺盖拉·德·索萨·苏亚雷斯 , 托马斯·亨利·艾萨克 , 鲍里斯·布赖纳 , 亚历山德拉·纳塔莱 , 米歇尔·阿马西奥
IPC: C12Q1/68
CPC classification number: C12Q1/6876 , C12Q1/6823 , C12Q1/6869 , C12Q2521/301 , C12Q2521/319 , C12Q2525/301 , C12Q2563/107 , C12Q2565/1015 , C12Q2521/101 , C12Q2521/501
Abstract: 本发明公开了生物探针,其特征在于包含末端连接两个不同寡核苷酸区的单链核苷酸区其中寡核苷酸区中至少一个包含具有特征性检测特性的可检测元件且其中可检测元件被布置在寡核苷酸区上以致可检测特性的可检测性低于当相同数量的可检测元件结合到相应数量的单个核苷酸时。该生物探针尤其可用于捕获单个核苷酸或单链核苷酸以产生可由限制酶和外切核酸酶降解的占用探针从而产生携带可检测形式的可检测元件的单个核苷酸。典型地可检测元件是荧光团且通过如使用多个相邻的荧光团或荧光团和与其连接的猝灭剂的混合物使探针中相应的特征性荧光不可检测。优选地单链核苷酸区由单个核苷酸组成,其关联的核苷酸碱基是DNA或RNA中发现的特征性核苷酸碱基之一。
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公开(公告)号:CN105121662B
公开(公告)日:2017-03-22
申请号:CN201480020411.5
申请日:2014-04-09
Inventor: 卡梅伦·亚历山大·弗雷林 , 巴纳比·巴姆福思 , 布鲁诺·弗拉维奥·诺盖拉·德· , 索萨·苏亚雷斯 , 托马斯·亨利·艾萨克 , 鲍里斯·布赖纳 , 亚历山德拉·纳塔莱 , 米歇尔·阿马西奥 , 保罗·迪尔
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明提供一种用于确定多核苷酸分析物中核苷酸碱基的序列的方法。其特征在于以下步骤:(1)由所述分析物产生单核苷酸碱基流;(2)通过将各单核苷酸碱基与捕获系统反应产生捕获的分子;(3)扩增所述捕获的分子的至少部分,从而产生以所述单核苷酸碱基为特征的多个扩增子;(4)利用具有特征可检测元件的相应探针标记所述扩增子,和(5)检测所述可检测元件的性质特征。
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公开(公告)号:CN105121662A
公开(公告)日:2015-12-02
申请号:CN201480020411.5
申请日:2014-04-09
Inventor: 卡梅伦·亚历山大·弗雷林 , 巴纳比·巴姆福思 , 布鲁诺·弗拉维奥·诺盖拉·德·索萨·苏亚雷斯 , 托马斯·亨利·艾萨克 , 鲍里斯·布赖纳 , 亚历山德拉·纳塔莱 , 米歇尔·阿马西奥 , 保罗·迪尔
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明提供一种用于确定多核苷酸分析物中核苷酸碱基的序列的方法。其特征在于以下步骤:(1)由所述分析物产生单核苷酸碱基流;(2)通过将各单核苷酸碱基与捕获系统反应产生捕获的分子;(3)扩增所述捕获的分子的至少部分,从而产生以所述单核苷酸碱基为特征的多个扩增子;(4)利用具有特征可检测元件的相应探针标记所述扩增子,和(5)检测所述可检测元件的性质特征。
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