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公开(公告)号:CN118726648A
公开(公告)日:2024-10-01
申请号:CN202411101247.2
申请日:2024-08-12
Applicant: 杭州柏熠科技有限公司 , 浙江大学滨江研究院 , 浙江大学医学院附属儿童医院
IPC: C12Q1/6895 , C12Q1/6869 , C12Q1/6806 , C40B50/06 , C12N15/11
Abstract: 本发明提供一种三代纳米孔测序的真菌全长靶向检测试剂盒及应用,设计了针对于三代纳米孔测序的标签Barcode,以及包含标签Barcode、用于扩增真菌ITS全长序列的扩增引物、定位序列的靶向扩增产物,该试剂盒可实现对真菌样本总DNA进行ITS基因的全长PCR扩增,进行ITS基因高变区/保守区的扩增子扩增得到扩增子,在PCR结束后将所有产物合并成单个文库,后续的建库过程只需对单个文库进行末端修复,而不必对每个样品进行末端修复,同时省去了额外的Barcode连接步骤,大大降低了实验的复杂程度,缩短了实验时间,特别是对大量样本同时建库时尤为明显。
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公开(公告)号:CN114752704A
公开(公告)日:2022-07-15
申请号:CN202210264083.X
申请日:2022-03-17
Abstract: 本发明提供了应用多重探针熔解曲线法检测脑炎病毒核酸试剂盒及方法,包括荧光PCR反应液、酶混合液、阳性对照品、阴性对照品,所述荧光PCR反应液中含有PCR缓冲液、Mgcl2、dNTPs、六种脑炎病毒对应的上游引物、六种脑炎病毒对应的下游引物、六种脑炎病毒对应的荧光探针,所述六种脑炎病毒分别为肠道病毒、单纯疱疹病毒I型、单纯疱疹病毒II型、人巨细胞病毒、EB病毒、水痘带状疱疹病毒;所述上游引物的序列如SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:7、SEQ ID NO:10、SEQ ID NO:13、SEQ ID NO:16所示;所述下游引物的序列如SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:5、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:11、SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:17所示;所述荧光探针的序列如SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:9、SEQ ID NO:12、SEQ ID NO:15、SEQ ID NO:18所示。
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公开(公告)号:CN116064871A
公开(公告)日:2023-05-05
申请号:CN202211377643.9
申请日:2022-11-04
Abstract: 本发明公开了一种应用多重探针熔解曲线法检测血流感染细菌核酸的试剂盒及方法,本发明运用多重探针熔解曲线技术,采用4种不同荧光的探针荧光PCR联合多重熔解曲线,开发研制出用于血流感染常见8种细菌靶标的检测试剂盒。该发明具备了荧光定量PCR的灵敏度和特异性,且比荧光定量PCR方法检测通量更大,操作更简便,成本更低。为临床上血流感染的诊断提供可靠的实验手段。
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公开(公告)号:CN119108024A
公开(公告)日:2024-12-10
申请号:CN202411101254.2
申请日:2024-08-12
Applicant: 杭州柏熠科技有限公司 , 浙江大学滨江研究院 , 浙江大学医学院附属儿童医院
Abstract: 本发明提供一种基于全长16s rRNA三代测序数据的物种鉴定方法、装置及应用,获取待鉴定细菌的16s区域的原始纳米孔测序数据;预处理原始纳米孔测序数据得到fastq格式的预处理序列,去除预处理序列两端的接头和barcode序列后保留高质量序列,基于高质量序列构建归一化kmer矩阵,对归一化kmer矩阵降维后进行二次聚类得到聚类簇,将同一聚类簇内的序列合并得到聚类序列,将每一聚类序列同全长16s序列数据库内的序列进行比对得到每一聚类簇的最优物种并保留聚类簇内同最优物种的同属序列,合并同一物种的物种序列生成一致性序列,降低了三代测序数据的固有随机错误带来的鉴定错误,采用相似度评估技术合并高度相似的物种提高了鉴定结果的可靠性。
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公开(公告)号:CN114752704B
公开(公告)日:2023-09-22
申请号:CN202210264083.X
申请日:2022-03-17
Abstract: 本发明提供了应用多重探针熔解曲线法检测脑炎病毒核酸试剂盒及方法,包括荧光PCR反应液、酶混合液、阳性对照品、阴性对照品,所述荧光PCR反应液中含有PCR缓冲液、Mgcl2、dNTPs、六种脑炎病毒对应的上游引物、六种脑炎病毒对应的下游引物、六种脑炎病毒对应的荧光探针,所述六种脑炎病毒分别为肠道病毒、单纯疱疹病毒I型、单纯疱疹病毒II型、人巨细胞病毒、EB病毒、水痘带状疱疹病毒;所述上游引物的序列如SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:7、SEQ ID NO:10、SEQ ID NO:13、SEQ ID NO:16所示;所述下游引物的序列如SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:5、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:11、SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:17所示;所述荧光探针的序列如SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:9、SEQ ID NO:12、SEQ ID NO:15、SEQ ID NO:18所示。
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公开(公告)号:CN107287303A
公开(公告)日:2017-10-24
申请号:CN201710507125.7
申请日:2017-06-28
Applicant: 浙江大学
IPC: C12Q1/68
CPC classification number: C12Q1/6858 , C12Q2531/113 , C12Q2561/101 , C12Q2545/113
Abstract: 本发明提供一种线粒体耳聋常见突变A1555G的荧光定量PCR检测试剂盒,包含定量PCR反应液、第一阳性对照品、第二阳性对照品、阴性对照品、说明书和盒体,其中定量PCR反应液含有PCR缓冲液、MgCl2、dNTPs、耐热DNA聚合酶、上游扩增引物、下游扩增引物、第一荧光探针和第二荧光探针。本发明提供的试剂盒,针对mtDNA第1555位点的A>G单碱基突变设计两条MGB探针,通过荧光定量PCR对耳聋相关性的线粒体第1555位核苷酸进行检测,明确该位点是否发生A>G突变,具有简便、快速、准确等优点,可应用于线粒体A1555G突变相关性耳聋的临床诊断和防治,也为A1555G突变导致的线粒体耳聋的预防和治疗提供依据。
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公开(公告)号:CN107287302A
公开(公告)日:2017-10-24
申请号:CN201710507096.4
申请日:2017-06-28
Applicant: 浙江大学
IPC: C12Q1/68
CPC classification number: C12Q1/6858 , C12Q2531/113 , C12Q2561/101 , C12Q2545/113
Abstract: 本发明提供一种线粒体耳聋常见突变T12201C的荧光定量PCR检测试剂盒,包含定量PCR反应液、第一阳性对照品、第二阳性对照品、阴性对照品、说明书和盒体,其中定量PCR反应液含有PCR缓冲液、MgCl2、dNTPs、耐热DNA聚合酶、上游扩增引物、下游扩增引物、第一荧光探针和第二荧光探针。本发明提供的试剂盒,对mtDNA第12201位点的T>C单碱基突变设计两条MGB探针,通过荧光定量PCR对耳聋相关性的线粒体第12201位核苷酸进行检测,明确该位点是否发生T>C突变,具有简便、快速、准确等优点,可应用于线粒体T12201C突变相关性耳聋的临床诊断和防治,也为T12201C突变导致的线粒体耳聋的预防和治疗提供依据。
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公开(公告)号:CN103789426A
公开(公告)日:2014-05-14
申请号:CN201410027285.8
申请日:2014-01-21
Applicant: 浙江大学
CPC classification number: C12Q1/686 , C12Q1/04 , C12Q1/14 , C12Q2561/113 , C12Q2563/107
Abstract: 本发明提供一种革兰阳性菌的实时荧光定量PCR检测试剂盒,由革兰阳性菌DNA抽提液、定量PCR反应液、标准品、阳性对照品、阴性对照品、说明书和盒体组成,其中定量PCR反应液含有PCR缓冲液、MgCl2、dNTPs、耐热DNA聚合酶、上游扩增引物、下游扩增引物和革兰阳性菌荧光探针。本发明以革兰阳性菌16SrRNA基因为靶基因开发的实时荧光定量PCR试剂盒,能简便、快速、通用检测所有革兰阳性菌,并能对检测结果阳性的革兰阳性菌进行准确定量,提高了革兰阳性菌鉴定检测的通用性和敏感性,可为临床所有革兰阳性菌感染的早期诊断提供依据。
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公开(公告)号:CN101333526A
公开(公告)日:2008-12-31
申请号:CN200810063309.X
申请日:2008-08-01
Applicant: 浙江大学
IPC: C12N15/11 , A61K31/713 , A61P31/20
Abstract: 本发明提供一种人巨细胞病毒UL54基因的siRNA的cDNA序列,其核苷酸序列是:5’-CTCGATGAAGTCAAGAAGT-3’。本发明根据siRNA设计原则,选择的siRNA其cDNA序列的GC含量为42.1%,对应UL54 mRNA中3058-3076核苷酸位点,构建针对HCMV UL54(DNA多聚酶)基因的siRNA真核表达载体,转化大肠杆菌后提取质粒,分别转染AD293细胞和MRC-5细胞,最终筛选到1个能有效抑制UL54基因表达的siRNA序列,可在制备治疗人巨细胞病毒感染的药物中的应用。
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公开(公告)号:CN101200765A
公开(公告)日:2008-06-18
申请号:CN200710157185.7
申请日:2007-11-27
Applicant: 浙江大学
Abstract: 本发明提供一种革兰双检实时荧光定量PCR检测试剂盒,由定量PCR反应液1、革兰阳性标准品2、革兰阴性标准品3、阳性对照品4、阴性对照品5、细菌DNA抽提裂解液6、盒体8组成。盒体8设有容器孔,分别放置PCR反应液管、标准品、对照品、细菌DNA抽提裂解液。本发明试剂盒设计合理,运用实时荧光定量PCR技术,采用细菌通用引物和革兰阴、阳性双特异荧光探针,通过实时荧光定量,不仅进行细菌革兰阴、阳性菌分型,而且对检测的阴、阳性菌进行实时准确定量,可在检测细菌革兰阴、阳性菌DNA中应用。
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