基于枣基因组多态性SSR位点的筛选方法及条形码的生成

    公开(公告)号:CN115786473B

    公开(公告)日:2023-07-04

    申请号:CN202211108149.2

    申请日:2022-09-13

    Abstract: 本发明公开了一种基于枣基因组多态性SSR位点的筛选在条形码中的应用,其步骤如下:S1、基于枣基因组搜索SSR位点;S2、对步骤S1搜索到的SSR位点按条件进行初步筛选,保证SSR两端序列在枣基因组中的唯一性;S3、进一步筛选步骤S2得到的SSR位点,保证对应SSR存在多态性;S4、对步骤S3获得的SSR位点进行引物设计及验证;S5、对SSR位点赋值并生成条形码。本发明采用上述的一种基于枣基因组多态性SSR位点的筛选在条形码中的应用,可以更高效、更系统的在基因组中筛选多态性SSR位点,更精准的对不同枣品种进行分类,提高了工作效率,缩短了试验时间。

    基于枣公共基因组信息构建微卫星标记多重PCR体系的方法

    公开(公告)号:CN117070611A

    公开(公告)日:2023-11-17

    申请号:CN202310593294.2

    申请日:2023-05-24

    Abstract: 本发明提供基于枣公共基因组信息构建微卫星标记多重PCR体系的方法,涉及基因组信息构建技术领域。所述基于枣公共基因组信息构建微卫星标记多重PCR体系的方法包括具体步骤如下:S1:搜索SSR位点;从现有数据库内下载的冬枣基因组作为参考基因组和酸枣基因组做参考,并使用MISA软件对参考基因组进行分析,获取SSR位点信息与位置;S2:选择有代表性的SSR位点;根据获得的SSR位置信息截取SSR两端序列,通过blast比对到酸枣基因组中,筛选出在两个基因组中有差异的SSR位点;S3:根据筛选到的SSR位点设计引物;使用PrimerPremier5软件对SSR位点进行引物设计。本发明提供的基于枣公共基因组信息构建微卫星标记多重PCR体系的方法具有效率高的优点。

    基于枣基因组多态性SSR位点的筛选方法及条形码的生成

    公开(公告)号:CN115786473A

    公开(公告)日:2023-03-14

    申请号:CN202211108149.2

    申请日:2022-09-13

    Abstract: 本发明公开了一种基于枣基因组多态性SSR位点的筛选在条形码中的应用,其步骤如下:S1、基于枣基因组搜索SSR位点;S2、对步骤S1搜索到的SSR位点按条件进行初步筛选,保证SSR两端序列在枣基因组中的唯一性;S3、进一步筛选步骤S2得到的SSR位点,保证对应SSR存在多态性;S4、对步骤S3获得的SSR位点进行引物设计及验证;S5、对SSR位点赋值并生成条形码。本发明采用上述的一种基于枣基因组多态性SSR位点的筛选在条形码中的应用,可以更高效、更系统的在基因组中筛选多态性SSR位点,更精准的对不同枣品种进行分类,提高了工作效率,缩短了试验时间。

Patent Agency Ranking