基于枣公共基因组信息构建微卫星标记多重PCR体系的方法

    公开(公告)号:CN117070611A

    公开(公告)日:2023-11-17

    申请号:CN202310593294.2

    申请日:2023-05-24

    Abstract: 本发明提供基于枣公共基因组信息构建微卫星标记多重PCR体系的方法,涉及基因组信息构建技术领域。所述基于枣公共基因组信息构建微卫星标记多重PCR体系的方法包括具体步骤如下:S1:搜索SSR位点;从现有数据库内下载的冬枣基因组作为参考基因组和酸枣基因组做参考,并使用MISA软件对参考基因组进行分析,获取SSR位点信息与位置;S2:选择有代表性的SSR位点;根据获得的SSR位置信息截取SSR两端序列,通过blast比对到酸枣基因组中,筛选出在两个基因组中有差异的SSR位点;S3:根据筛选到的SSR位点设计引物;使用PrimerPremier5软件对SSR位点进行引物设计。本发明提供的基于枣公共基因组信息构建微卫星标记多重PCR体系的方法具有效率高的优点。

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