公开(公告)号：CN119360944A

公开(公告)日：2025-01-24

申请号：CN202411342861.8

申请日：2024-09-25

Applicant: 江南大学

Inventor： 陈秋铭 ,  罗文杰 ,  陈洁 ,  何志勇 ,  曾茂茂 ,  王召君 ,  秦昉

IPC: G16B15/00 ,  G16B35/20 ,  G16B50/00

Abstract: 本发明公开了一种基于结构分析定向挖掘谷氨酰胺转氨酶的方法，该方法包括：步骤1、对生物信息学数据库进行检索，下载含transglutaminase标注信息的序列并做去重处理；步骤2、使用编程语言通过AlphaFoldDB数据库获取与所述序列对应的蛋白质结构文件；步骤3、使用编程语言通过DaliLite软件将所述蛋白质结构文件在本地批量与已知TGase进行结构相似性分析；步骤4、筛选得到与已知TGase相似度高的潜在新型TGase序列与结构；步骤5、活性验证，从而确认新型Tgase。本发明构建适用于谷氨酰胺转氨酶的生物信息学数据库挖掘方法，能够批量处理蛋白质数据库中的冗余信息，降低传统人工处理数据和实验筛选的工作量，实现了针对目标工业酶的快速且精准的数据库资源挖掘，具有普适性。