一种用于EBV检测的探针及检测方法

    公开(公告)号:CN111074002A

    公开(公告)日:2020-04-28

    申请号:CN202010014973.6

    申请日:2020-01-07

    Abstract: 本发明公开了一种用于EBV检测的探针及检测方法。所述探针制备过程需要进行两轮PCR反应。所述基于NGS技术的检测方法包括:制备DNA模板,片段化基因组DNA,纯化片段化产物,引进组文库构建,PCR扩增基因组文库,探针与基因组文库杂交,磁珠捕获杂交产物,对得到的捕获产物进行高通量测序并分析待测样本中EBV的感染情况。本发明公开的探针、方法具有成本低,数据分析快捷,覆盖深度高,检测准确度高等优势,适合对EBV引起的疾病进行早期筛查和术后诊断,为个性化用药提供指导。

    一种用于构建cfDNA甲基化NGS文库的试剂盒和方法

    公开(公告)号:CN118006732A

    公开(公告)日:2024-05-10

    申请号:CN202410314669.1

    申请日:2024-03-19

    Abstract: 本发明公开了一种cfDNA甲基化NGS文库的构建方法:重亚硫酸盐处理后的cfDNA单链,利用末端转移酶以NTP为底物,在单链3’端加上2‑4个ATP尾;以T4RNA连接酶在单链3’端连接单链接头;以二链合成引物,利用taq DNA聚合酶进行二链合成,在合成末端多加一个A碱基;利用DNA连接酶,以TA克隆的方式连接双链接头;利用建库index引物进行PCR扩增构建文库。该方法先转化后建库,避免l传统先建库后转化DNA断裂后造成大量数据丢失的问题,同时采用单链和双链两种接头连接方式,规避了普通单链建库需要采用随机引物合成的步骤,既避免了随机引物不可从头合成的问题,又避免了随机引物合成的偏好性。

    一种检测人类EGFR 19号外显子基因缺失突变的引物探针组合、试剂盒及方法

    公开(公告)号:CN117887852A

    公开(公告)日:2024-04-16

    申请号:CN202410091216.7

    申请日:2024-01-22

    Abstract: 本发明公开了一种检测人类EGFR 19号外显子基因缺失突变的引物探针组合、试剂盒及方法,检测的EGFR 19号外显子基因缺失突变包括25种类型,引物探针组合包括序列如SEQ ID NO.1‑5所示的正向引物,序列如SEQ ID NO.6所示的反向引物,序列如SEQ ID NO.8所示的检测探针,序列如SEQ ID NO.9所示的blocker探针,检测探针的5’端有第一荧光基团,3’端有第一淬灭基团,blocker探针3’端经过延伸阻断修饰。组合中的引物对扩增子片段在100bp左右,经过筛选的引物探针组合,可实现对EGFR 19号外显子基因缺失变异的高特异性,高灵敏度检测,可检出5ng样本中0.5%的变异。

    一种检测NTRK3基因融合突变的引物探针组合、试剂盒及检测方法

    公开(公告)号:CN117821593A

    公开(公告)日:2024-04-05

    申请号:CN202410039291.9

    申请日:2024-01-09

    Abstract: 本发明公开了一种检测NTRK3基因融合突变的引物探针组合、试剂盒及检测方法,所述引物探针组合检测ETV6‑NTRK3融合基因的exon 4‑exon14、exon5‑exon15、exon5‑exon14、exon4‑exon15融合类型;EML4‑NTRK3融合基因的exon 2‑exon14融合类型;SQSTM1‑NTRK3融合基因的exon5‑exon14、exon5‑exon14融合类型;RBPMS‑NTRK3融合基因的exon5‑exon15融合类型;所述引物探针组合包括核酸序列如SEQ ID NO.9、SEQ ID NO.12、SEQ ID NO.15、SEQ ID NO.19、SEQ ID NO.17、SEQ ID NO.18所示的正向引物,核酸序列如SEQ ID NO.10、SEQ ID NO.13所示的反向引物,以及核酸序列如SEQ ID NO.11和SEQ ID NO.14所示的探针,且探针的5’端有第一荧光基团,3’端有第一猝灭基团。所述引物对的扩增子片段较短,在100bp左右,能有效检测出多种肿瘤FFPE样本中提取的RNA中是否存在NTRK3基因与多种基因融合的突变,并能保证检测的特异性及灵敏度。

    一种FFPE样本总核酸提取试剂组合、试剂盒及提取方法

    公开(公告)号:CN115896094A

    公开(公告)日:2023-04-04

    申请号:CN202211468539.0

    申请日:2022-11-22

    Abstract: 本发明公开了一种FFPE样本总核酸提取试剂组合、试剂盒和提取方法,属于分子生物学技术领域。所述试剂组合包括裂解液、结合液、第一漂洗液和洗脱液,其中,所述裂解液包含50~300mM的Tris·HCl、0.5~1.5M的盐酸盐、0.2~1.5%的十二烷基硫酸钠、2~20mM的EDTA和1~6M的异硫氰酸胍;所述结合液包含0.4~1.2M的盐酸盐和50~90%异丙醇;所述第一漂洗液包含2~10M盐酸胍和40~90%乙醇;所述洗脱液包含10~20mM的Tris·HCl。利用本发明的试剂组合、试剂盒和/或提取方法,能够从少量FFPE样本中得到高含量和高纯度的总核酸样本,并且提取操作简捷、重复性高、不需要接触酚、氯仿、异戊醇等有毒有害物质,操作过程更加安全。

Patent Agency Ranking