一种单细胞RNA逆转录与文库构建的方法

    公开(公告)号:CN108103055B

    公开(公告)日:2021-05-28

    申请号:CN201810019044.7

    申请日:2018-01-09

    Abstract: 本发明属于转录组分析领域,涉及到一种快速进行单细胞RNA逆转录与文库构建的方法。本发明能在5‑6小时内,由1‑2000个细胞或10pg‑20ng经提取的真核生物总RNA为起始,扩增出20‑500ng高质量全长双链cDNA,并获得符合下游分析要求的高质量cDNA文库。此发明有效避免了cDNA合成过程中的3’偏好性和基因组DNA的污染,表达定量分子标签可辅助基因表达量计算,同时在完整扩增RNA序列信息的同时该表达定量分子标签还可保留链来源信息。本发明可获得95%以上的逆转录与扩增建库成功率,cDNA文库可无缝衔接Illumina主流测序平台,下机数据(5M Reads)可检测到90%以上的基因表达,基因表达一致性超过90%,扩增无明显偏倚,且需要的样本投入量更少。

    用于无创胚胎移植优先级评级的系统和方法

    公开(公告)号:CN112582022A

    公开(公告)日:2021-03-30

    申请号:CN202010705776.9

    申请日:2020-07-21

    Abstract: 本发明为用于无创胚胎移植优先级评级的系统和方法,提供生物特征和生物特征的组合,其可用于基于胚胎培养液和/或囊胚腔液的胚胎整倍体概率预测和胚胎植入优先级的评级。本发明还涉及将这些生物特征的量值输入分类系统例如随机森林以预测胚胎整倍体概率的方法,以及利用该胚胎整倍体概率来评级胚胎的植入优先级的方法。本发明也提供包含用于确定所述生物特征和生物特征组合的试剂在本发明预测和评级方法中的应用、以及用于所述预测方法和评级方法的系统和计算机程序产品。

    扩增DNA的方法
    5.
    发明公开

    公开(公告)号:CN111621548A

    公开(公告)日:2020-09-04

    申请号:CN202010490130.3

    申请日:2016-04-26

    Abstract: 本申请涉及一种扩增基因组DNA的方法,包括:(a)提供第一反应混合物,包括包含基因组DNA的样本、第一引物、核苷酸单体混合物和核酸聚合酶,其中所述第一引物从5’端到3’端包含通用序列和包括第一随机序列的第一可变序列;(b)将第一反应混合物置于第一温度循环程序获得预扩增产物;(c)提供第二反应混合物,包括预扩增产物、第二引物、核苷酸单体混合物和核酸聚合酶,其中所述第二引物从5’端到3’端包含或由特定序列及所述通用序列组成;(d)将第二反应混合物置于第二温度循环程序进行扩增,获得扩增产物。本申请还涉及一种用于扩增基因组DNA的试剂盒。

    扩增DNA的方法
    6.
    发明公开

    公开(公告)号:CN105602939A

    公开(公告)日:2016-05-25

    申请号:CN201610052456.1

    申请日:2016-01-26

    Inventor: 陆思嘉 殷广军

    Abstract: 本申请涉及一种扩增细胞基因组DNA的方法,包括:(a)提供包括基因组DNA、第一类引物、第二类引物、核苷酸单体混合物和核酸聚合酶的反应混合物,其中所述第一类引物从5’端到3’端包含通用序列和可变序列,所述第二类引物包含所述通用序列且不包含所述可变序列;(b)将所述反应混合物置于第一温度循环程序以得到基因组扩增产物;(c)将步骤(b)得到的反应混合物置于第二温度循环程序,使得所述第二类引物的通用序列能够与所述基因组扩增产物的3’端配对并扩增所述基因组扩增产物以得到扩大的基因组扩增产物,其中在所述步骤(b)和所述步骤(c)之前提供所述反应混合物。本申请还涉及一种用于扩增基因组DNA的试剂盒。

    一种利用囊胚培养液检测胚胎染色体异常的方法

    公开(公告)号:CN113684250B

    公开(公告)日:2024-08-20

    申请号:CN202110984786.5

    申请日:2015-11-05

    Abstract: 本发明涉及一种利用囊胚培养液检测胚胎染色体异常的方法,通过从胚胎早期体外培养液即囊胚培养液中检测胚胎来源的游离DNA,对微量DNA进行均匀的全基因组扩增,再利用二代测序等方法对扩增后的DNA产物进行分析,从而判断胚胎的染色体情况,即是否出现染色体整体或局部的非整倍体。本发明选择囊胚培养液这种体外受精操作过程中胚胎体外培养阶段的废弃物作为检测样本,这种非侵入性无创的方法既避免了常规卵裂球活检或囊胚滋养层细胞活检取样时对胚胎造成的细胞损伤,又不给临床增添额外的麻烦,同时简化了样本获取时的操作,安全可靠性及简便性更高。

    清洗卵子或受精卵表面的方法

    公开(公告)号:CN105950546B

    公开(公告)日:2018-09-25

    申请号:CN201610584345.5

    申请日:2016-07-22

    Inventor: 蔡立义 陆思嘉

    CPC classification number: Y02A40/81

    Abstract: 本发明涉及一种清洗卵子或受精卵表面的方法。具体地,本发明公开的方法包括步骤(1)将未经处理的卵子或未经处理的受精卵置于第一培养皿中,其中,所述第一培养皿经标准细胞培养表面处理且含有第一培养液,所述第一培养液含蛋白;然后加入透明质酸酶处理所述卵子或受精卵,从而得到经第一次处理的卵子或受精卵;(2)将经第一次处理的卵子或受精卵移入第二培养皿中,其中,所述第二培养皿未经表面处理且含有第二培养液,所述第二培养液不含蛋白;然后用带有第三培养液的棒状工具拨动所述卵子或受精卵,其中,所述第三培养液含蛋白;使颗粒细胞和/或多余精子脱离卵子或受精卵表面,从而被彻底清除干净。

    一种单细胞mRNA逆转录与扩增的方法

    公开(公告)号:CN107893100A

    公开(公告)日:2018-04-10

    申请号:CN201711139327.7

    申请日:2017-11-16

    Abstract: 本发明属于转录组分析领域,具体涉及一种单细胞mRNA逆转录与扩增方法。本发明能在5-6小时内,由1-2000个细胞或10pg-20ng经提取的真核生物总RNA为起始,扩增出20-500ng高质量全长双链cDNA。本发明可获得95%以上的逆转录与扩增成功率,扩增的全长cDNA可无缝衔接主流测序平台。本发明是在单细胞水平研究基因表达强有力的工具,极大地拓展了RNA-Seq的应用范围,经本发明逆转录与扩增出的cDNA,可用作极微量样品的表达分析(单个细胞)、胚胎早期发育研究、肿瘤细胞异质性研究、免疫细胞群研究、干细胞分化研究。

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