公开(公告)号：CN113832243A

公开(公告)日：2021-12-24

申请号：CN202111009742.7

申请日：2021-08-30

Applicant: 广东省农业科学院茶叶研究所

Inventor： 李红建 ,  吴华玲 ,  方开星 ,  王青 ,  姜晓辉 ,  秦丹丹 ,  倪尔东 ,  王秋霜 ,  潘辰东 ,  李波

IPC: C12Q1/6895 ,  C12Q1/6858 ,  C12N15/11

Abstract: 基于KASP技术开发的用于茶树品种鉴定的核心SNP标记。本发明提供了一种检测SNP位点的试剂，所述试剂用于检测SNP位点1～30中的一个或几个。通过对251份茶树资源进行简化基因组测序，获得96401个SNP位点，基于缺失率＜0.15、次等位基因频率＞0.2和杂合率＜0.2这三个筛选标准，获得2528个SNP位点。利用LociScan_V1.0位点筛选工具对2528个位点进行分层筛选，获得30个SNP核心SNP位点，设计对应引物，对72份经过国家、省级审定或其他重要茶树品种/系进行KASP检测。不仅丰富了茶树分子标记，还可以广泛的应用于茶树品种进行基因分型、鉴别或辅助鉴别茶树品种、检测任意两个茶树的相似性等方面的应用。

公开(公告)号：CN113832243B

公开(公告)日：2022-05-17

申请号：CN202111009742.7

申请日：2021-08-30

Applicant: 广东省农业科学院茶叶研究所

Inventor： 李红建 ,  吴华玲 ,  方开星 ,  王青 ,  姜晓辉 ,  秦丹丹 ,  倪尔东 ,  王秋霜 ,  潘辰东 ,  李波

IPC: C12Q1/6895 ,  C12Q1/6858 ,  C12N15/11

Abstract: 基于KASP技术开发的用于茶树品种鉴定的核心SNP标记。本发明提供了一种检测SNP位点的试剂，所述试剂用于检测SNP位点1～30中的一个或几个。通过对251份茶树资源进行简化基因组测序，获得96401个SNP位点，基于缺失率＜0.15、次等位基因频率＞0.2和杂合率＜0.2这三个筛选标准，获得2528个SNP位点。利用LociScan_V1.0位点筛选工具对2528个位点进行分层筛选，获得30个SNP核心SNP位点，设计对应引物，对72份经过国家、省级审定或其他重要茶树品种/系进行KASP检测。不仅丰富了茶树分子标记，还可以广泛的应用于茶树品种进行基因分型、鉴别或辅助鉴别茶树品种、检测任意两个茶树的相似性等方面的应用。