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公开(公告)号：CN114385233B
公开(公告)日：2022-08-02
申请号：CN202210291811.6
申请日：2022-03-24
Applicant: 山东省计算中心(国家超级计算济南中心)
Abstract: 本申请属于计算机系统技术领域，提供了一种跨平台自适应数据处理工作流系统及方法，包括客户端，被配置为基于应用程序编程接口调用和画布式拖拽构建工作流，将所构建的工作流通过Istio安全网关发送到服务端；服务端，被配置为基于服务器接口接收客户端所构建的工作流，基于运算符计算平台适配器进行工作流逻辑运算符的计算环境优化适配。本申请采用基于Kubernetes的微服务架构，采用Istio安全网关作为客户端与服务端的唯一通道，实现跨平台自适应数据工作流的处理。
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公开(公告)号：CN114360637B
公开(公告)日：2024-10-29
申请号：CN202210022369.7
申请日：2022-01-10
Applicant: 山东省计算中心(国家超级计算济南中心) , 中国海洋大学
IPC: G16B15/00 , G16B25/00 , G06N3/042 , G06N3/0464 , G06N3/08
Abstract: 本发明公开了一种基于图注意力网络的蛋白质‑配体亲和力评价方法。为了解决数据集规模小的问题，本发明模拟半柔性对接过程，设计了基于分子柔性的数据增强方法(Data Enhancement Method based on molecular flexibility)，扩大数据规模、提高模型质量、保证了方法的科学性与合理性。本发明设计基于图注意力机制的分子特征提取方法，提取分子有效特征，提高打分函数的精度和性能。
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公开(公告)号：CN111125347B
公开(公告)日：2023-10-27
申请号：CN201911376996.5
申请日：2019-12-27
Applicant: 山东省计算中心(国家超级计算济南中心)
IPC: G06F16/338 , G06F16/36
Abstract: 本发明的基于unity3d的知识图谱3D可视化方法，包括：a).摄像机、天空盒和场景初始化；b).三元组数据获取；c).预制体的创建及三维物理结构组织；d).三维力学模型构建；e).帧循环；f).沉浸式摄影机脚本；g).全局摄影机脚本；h).属性信息显示及UI绘制；i).检索功能及传送功能；j).沉浸视图、全局视图切换。本发明的基于unity3d的知识图谱3D可视化方法，具有良好的可移植性和可扩展性，可以发布到web、手机、PC等多种平台，而不会像WebGL等技术一样开发后即对平台具有高度依赖；另一方面表现在未来可以方便的扩展至虚拟现实、增强现实等新兴的显示技术上，实现更广阔、更沉浸、更具互动性的知识图谱3D可视化。
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公开(公告)号：CN110767266B
公开(公告)日：2023-04-18
申请号：CN201911064826.3
申请日：2019-11-04
Applicant: 山东省计算中心(国家超级计算济南中心) , 青岛海洋科学与技术国家实验室发展中心
Abstract: 本发明的基于图卷积的面向ErbB靶向蛋白家族的打分函数构建方法，包括：a).构建ErbB靶向蛋白数据，对于ErbB包含的4个受体酪氨酸激酶ErbB‑1、ErbB‑2、ErbB‑3和ErbB‑4均构建靶向蛋白数据集；b).扩大数据集规模，采用原始构象、旋转构象、优化构象的方法扩大数据集规模；c).构建ErbB靶向蛋白家族机器学习打分函数模型；d).模型的训练和评估。本发明的打分函数构建方法，建了一个ErbB蛋白家族机器学习分子亲和力评估数据集，为ErbB蛋白家族的机器学习任务奠定了数据基础；通过GCN技术突破了经典打分函数的瓶颈，提高了打分函数的性能，解决了机器学习打分函数通用模型准确率低的问题。
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公开(公告)号：CN114360637A
公开(公告)日：2022-04-15
申请号：CN202210022369.7
申请日：2022-01-10
Applicant: 山东省计算中心(国家超级计算济南中心) , 中国海洋大学
Abstract: 本发明公开了一种基于图注意力网络的蛋白质‑配体亲和力评价方法。为了解决数据集规模小的问题，本发明模拟半柔性对接过程，设计了基于分子柔性的数据增强方法(Data Enhancement Method based on molecular flexibility)，扩大数据规模、提高模型质量、保证了方法的科学性与合理性。本发明设计基于图注意力机制的分子特征提取方法，提取分子有效特征，提高打分函数的精度和性能。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN112417166A
公开(公告)日：2021-02-26
申请号：CN202011309998.5
申请日：2020-11-20
Applicant: 山东省计算中心(国家超级计算济南中心)
Abstract: 本发明的知识图谱三元组置信度评价方法，包括评估阶段、融合阶段和校验阶段，a).实体层面评估；a‑1).数据源角度；a‑2).文献共现角度；a‑3).外链规模角度；a‑4).文本描述角度；a‑5).实体重要性角度；a‑6).实体的度的角度；b).关系层面评估；b‑1).数据源角度；b‑2).文献共现角度；b‑3).对实体间已知关系层面的评价；b‑4).对实体间未知关系层面的评价；c).知识图谱全局层面评估。本发明的知识图谱三元组置信度评价方法，可高效、快速、大规模的发掘知识图谱数据中的错误，进而提升整个知识图谱系统的数据质量；可以对链接预测、关系推理等机器学习任务的结果进行数据可靠性校验。
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公开(公告)号：CN114385233A
公开(公告)日：2022-04-22
申请号：CN202210291811.6
申请日：2022-03-24
Applicant: 山东省计算中心(国家超级计算济南中心)
Abstract: 本申请属于计算机系统技术领域，提供了一种跨平台自适应数据处理工作流系统及方法，包括客户端，被配置为基于应用程序编程接口调用和画布式拖拽构建工作流，将所构建的工作流通过Istio安全网关发送到服务端；服务端，被配置为基于服务器接口接收客户端所构建的工作流，基于运算符计算平台适配器进行工作流逻辑运算符的计算环境优化适配。本申请采用基于Kubernetes的微服务架构，采用Istio安全网关作为客户端与服务端的唯一通道，实现跨平台自适应数据工作流的处理。
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公开(公告)号：CN111710365B
公开(公告)日：2022-04-08
申请号：CN202010525374.0
申请日：2020-06-10
Applicant: 山东省计算中心(国家超级计算济南中心)
IPC: G16B40/00 , G06F40/247 , G06F16/36
Abstract: 本发明基于本体的蛋白质/基因同义词表构建方法，包括：a).数据源Uniprot、BioGRID和NCBI Gene的获取；b).数据文件的分割；c).上层本体的建立；d).Uniprot‑Swissprot向上层本体的映射和融合；e).BioGRID向上层本体的映射和融合；f).NCBI Gene向上层本体的映射和融合；g).同义词的去重。本发明的蛋白质/基因同义词表构建方法，建立了同义词规模上更全面、准确度上更可靠、分类信息上更细致的蛋白质/基因同义词表，为进行更高效、准确的文献数据挖掘提供了前提保证，是生物医药专家进行科研发现的有力辅助。
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公开(公告)号：CN112380345A
公开(公告)日：2021-02-19
申请号：CN202011313700.8
申请日：2020-11-20
Applicant: 山东省计算中心(国家超级计算济南中心)
IPC: G06F16/35 , G06F16/36 , G06F40/232 , G06F40/258 , G06F40/284 , G06F40/289
Abstract: 本发明的基于GNN的COVID‑19科学文献细粒度分类方法，包括：a).COVID‑19科学文献知识图谱的构建；a‑1).知识类别的划分；a‑2).科学文献中实体设计；a‑3).科学文献中关系设计；a‑4).构建COVID‑19科学文献知识图谱；b).西药治疗知识图谱构建；c).中药治疗知识图谱构建；d).构建图神经网络模型；e).文本分类。本发明的基于GNN的COVID‑19科学文献细粒度分类方法，为医学工作者在海量的（通常大于1万篇）有关COVID‑19科学文献中快速查找到自己所需的知识类别文献，提供了一种行之有效的筛选和分类方法，有益效果显著，适于应用推广。
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公开(公告)号：CN111710365A
公开(公告)日：2020-09-25
申请号：CN202010525374.0
申请日：2020-06-10
Applicant: 山东省计算中心(国家超级计算济南中心)
IPC: G16B40/00 , G06F40/247 , G06F16/36
Abstract: 本发明基于本体的蛋白质/基因同义词表构建方法，包括：a).数据源Uniprot、BioGRID和NCBI Gene的获取；b).数据文件的分割；c).上层本体的建立；d).Uniprot-Swissprot向上层本体的映射和融合；e).BioGRID向上层本体的映射和融合；f).NCBI Gene向上层本体的映射和融合；g).同义词的去重。本发明的蛋白质/基因同义词表构建方法，建立了同义词规模上更全面、准确度上更可靠、分类信息上更细致的蛋白质/基因同义词表，为进行更高效、准确的文献数据挖掘提供了前提保证，是生物医药专家进行科研发现的有力辅助。
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